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2.环状RNA定量PCR及RNase R耐受实验,验证环状RNA的表达和结构 为了验证测序结果的准确性,研究人员随机选取了8条差异表达的环状RNA,利用“divergent primers”进行环状RNA定量PCR检测和RNase R耐受性实验。所有环状RNA的表达都能够被定量PCR实验检测到,并且定量PCR结果与测序结果趋势一致,表明环状RNA测序结果准确性非常高。所有环状RNA都能抵抗RNase R的消化,进一步证实了这些RNA的环形结构。云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的测序公司,自行建立的环状RNA数据库circDB,借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点为客户提供好的服务。circRNA形成没有3’末端和5’末端的共价环状结构。陕西环状rna

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云序优势 适用于任何物种: 可以检测几乎所有动植物的环状RNA。 适用于降解样品: 可以检测部分降解的样品的环状RNA。 有效数据量高: 通过商业化kit富集环状RNA,极大地提高了有效数据比例。 性价比高:能够用较低的成本检测更多的环状RNA。 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织、体液或总RNA,云序生物为您完成从样品准备、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。 专业化的生物信息学分析: 云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析要求。云南外泌体环状测序环状 RNA 可以起到 microRNA 海绵的作用。

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鸡白血病病毒亚群(ALV-J)是一类逆转录病毒,该病毒会引起一种重要的感ran性疾病。患病的家禽会导致产蛋率的下降,大面积影响到家禽养殖产业。感ranALV-J的鸡免疫系统会受到严重的抑制并引起多种tumour疾病从而产生很高的死亡率,目前还不能通过接种疫苗的方式来防御这种疾病。来自华南农业大学广东省重点实验室的研究团队通过环状RNA测序的方式研究了病毒抗性与病毒易感的鸡肝脏组织当中环状RNA的表达,发现了32个差异表达的环状分子,其中12个在ALV-J抗性样本中表达量明显升高,而20个在易感样本中表达量更高,而生信预测表明这些环状RNA分子能够调控免疫分子通路的信息传递从而改变生物体的抵抗力。

研究思路: 作者首先分离了采用除草剂处理的雄性非洲爪蟾的睾丸组织,提取RNA,通过全转录组测序检测样本中环状RNA的表达变化。结果发现405个差异表达的环状RNA,其中44条上调和361条下调,这暗示着这些环状RNA可能在AZ污染过程中发挥作用。接下来通过环状RNA定量PCR检测和RNase R耐受性实验验证了环状RNA的表达量和结构。随后通过生信分析如GO及KEGG分析对差异表达的环状RNA进行了功能预测。GO分析表明这些RNA分子主要参与19条信号通路,其中Wnt信号通路和黄体酮介导的卵母细胞成熟通路可能是AZ污染涉及的信号通路。CircRNA-miRNA互作网络图揭示了环状RNA作用靶miRNA及可能的功能。本文研究了非洲爪蟾的环状RNA表达谱,为后续分子机理详细研究提供诸多靶分子。环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子。

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技术简介 环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子,其在真核细胞中的大量存在颠覆了传统的线性RNA观点,成为近两年来RNA领域中迅速升起的一颗新星。环状RNA的表达具有组织和疾病特异性,与组织发育、疾病的发生 和发展密切相关。此外,环状RNA不易降解,能在血浆、唾液等体液中稳定存在,可以作为新型疾病分子标志物。当前,科研人员对这一功能性分子仍知之甚少,可见对其展开深入的研究势在必行,一场科研的竞赛已悄然开始! 云序生物提供的环状RNA测序服务,采用Cloudseq CircRNA Enrichment Kit,去除样本中的线性mRNA和rRNA,保留纯化后的环状RNA,因此测序获得的环状RNA有效数据量是其他测序服务供应商远远无法企及的,帮助客户以较低的成本检测到更多的环状RNA。此外,Cloudseq CircRNA Enrichment Kit覆盖几乎全部已知物种,对环状RNA的研究将不再局限于人、小鼠、大鼠等常见物种。circRNA分子呈封闭环状结构,不受RNA外切酶影响。江苏m5c环状rna

环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子,也是RNA领域新的研究热点。陕西环状rna

环状RNA是什么? 环状RNA(circRNAs)是一类不具有5’末端帽子和3’末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。目前发现的circRNAs主要来源于基因外显子exon,但还有其他类型,比如来源于内含子intron,基因间intergenic,反义链antisense,重叠区sense overlapping。首先需要确定好研究物种,疾病模型,样品类型等基本信息。接下来,通过高通量手段即RNA-seq(云序提供全转录组-seq或circRNA-seq)或文献报道,筛选差异表达的circRNA。如果想短平快的发表3-5分的文章,那么表达谱分析显得再合适不过了。如果有大量的临床样本,那么做分子标志物也是很easy的,思路和表达谱分析相似如下图展示,不过多了临床样本的统计和验证。(比如KM曲线,ROC曲线,PAM分析等等)陕西环状rna

上海云序生物科技有限公司坐落在上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2,是一家专业的上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。公司。公司目前拥有专业的技术员工,为员工提供广阔的发展平台与成长空间,为客户提供高质的产品服务,深受员工与客户好评。公司业务范围主要包括:RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等。公司奉行顾客至上、质量为本的经营宗旨,深受客户好评。一直以来公司坚持以客户为中心、RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体市场为导向,重信誉,保质量,想客户之所想,急用户之所急,全力以赴满足客户的一切需要。

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