ac4CRNA乙酰化是在RNAac4C修饰酶的作用下,使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰(N4-acetylcytidine)。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18SrRNA上,导致Watson-Crick碱基热稳定性增加,调控蛋白合成中的编码准确性;近期研究发现ac4C分布在人类转录组中,大多数位点出现在编码序列(CDS)内,并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前,ac4CRNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”!m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。江西m5c环状平台
1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速轰动了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项youxiu青年基金,两项重点项目,94项面上项目,62项青年基金项目,15项地区科学基金项目。比如中医学和药理学方向,相信未来其他类型的tumour和学科方向必定会争取更多的环状RNA课题资助。与此同时,生命科学方向环状RNA研究显得略微低调些,陕西m5c环状RNA修饰具有高度保守性,部分具有快速的进化性改变。
近期,云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组包含了外泌体和环状RNA两大科研热点,应用云序生物提供的全转录组测序服务,通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《JournalofNeurotrauma》(影响因子5.19)上发表了世界first小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA研究的一篇文章。研究背景:大脑创伤(TBI)具有极高的发病率和致死率,会不同程度地危害身体健康,目前对其致病机理,尤其是对神经系统造成伤害的分子机理尚不知晓。
研究指出,环状RNA能够调控来源基因的表达。为了进一步了解小麦差异表达环状RNA的功能,研究人员对它们的来源基因进行GO(GeneOntology)分析。结果显示在脱水作用下,差异表达的环状RNA的来源基因可能在不同的生物进程和分子功能方面发挥作用。2013年两篇Nature文章揭示环状RNA具有miRNA海绵的功能,它可以吸附miRNA来调节基因的表达。研究人员对不同样本之间差异表达的62种环状RNA进行靶miRNA的结合预测。发现其中6种环状RNA具有潜在的miRNA结合位点。随后,研究人员对这些miRNA下游靶基因进行功能预测,分析结果显示靶基因参与的信号通路都与脱水应激反应相关,暗示着这7种差异表达的环状RNA可能通过miRNA海绵机制发挥作用。云序生物作为业内成熟的测序公司,能为不同的客户提供个性化的服务。越来越多的研究表明circRNA可发挥miRNA海绵或ceRNA的作用。
研究背景:利用高通量测序手段,研究者们在拟南芥、小鼠、果蝇和人体内都发现了环状RNA的高度表达,证明了环状RNA在不同物种中存在。目前,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限,环状RNA数据库circBase中已收录的物种有7个。作为一种重要的模式生物,非洲爪蟾的环状RNA尚未见报道。本文通过云序生物提供的一站式环状RNA测序、环状RNA定量PCR、环状RNA的RNaseR耐受性实验和生物信息学服务于全世界进行了非洲爪蟾环状RNA表达谱的构建,为后续研究脊椎动物环状RNA的生物学功能奠定了基础,非常具有借鉴意义。目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术。贵州环状mRNA测序
可以翻译成蛋白质,但大部分是非编码RNA。江西m5c环状平台
1.环状RNA测序,高通量筛选AZ处理相关环状RNA各类农药(除草剂、杀虫剂和杀菌剂三类)对非洲爪蟾产生的包括神经发育、性腺发育等方面的伤害作用,使得非洲爪蟾作为农药污染监测的模式生物备受青睐。莠去津(Atrazine,AZ)是地下水和地表水中常见的环境内分泌干扰物之一。研究人员在Nieuwkoop-Faber(NF)第47阶段(孵化后第13天),将来自一对成年配偶的蝌蚪随机分为AZ处理和对照两组,随后收集雄性非洲爪蟾的睾丸组织(AZ处理组vs.对照组:3vs.3)用于检测非洲爪蟾中所有环状RNA的表达情况,检测一共发现了68575条环状RNA。接下来,研究人员系统分析了不同样本之间环状RNA的表达情况,发现405条环状RNA差异表达(包括44条上调和361条下调),这暗示着这些环状RNA可能在AZ污染过程中发挥作用。江西m5c环状平台
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