企业商机
环状基本参数
  • 品牌
  • 上海云序生物
环状企业商机

3.2RNApull-down+MS/WB/qPCR/RNA-Seq设计目标RNA生物探针把相应的结合蛋白质与RNA复合物沉淀下来,蛋白质谱检测或WB检测与RNA结合的蛋白。设计目标RNA生物探针把相应的结合蛋白质与RNA复合物沉淀下来,qPCR检测或RNA-seq检测与RNA结合的RNA。3.3双荧光素酶报告实验双荧光素酶报告实验检测两个基因之间的互作。3.4病毒液以及siRNA设计提供circRNA过表达以及干扰慢病毒,腺病毒以及设计siRNA。四、CircRNA修饰研究4.1m6A/m5C/ac4C/m7G/m1A等修饰针对环状RNA各类修饰进行高通量筛选。4.2MeRIP-circRNA-PCR验证对高通量测序的结果,通过qPCR进行进一步验证。circRNA分子呈封闭环状结构,不易被核酸外切酶RNaseR降解,比线性RNA更稳定。福建RIP环状RNA实时定量PCR

福建RIP环状RNA实时定量PCR,环状

2.环状RNA定量PCR及RNaseR耐受实验,验证环状RNA的表达和结构为了验证测序结果的准确性,研究人员随机选取了8条差异表达的环状RNA,利用“divergentprimers”进行环状RNA定量PCR检测和RNaseR耐受性实验。所有环状RNA的表达都能够被定量PCR实验检测到,并且定量PCR结果与测序结果趋势一致,表明环状RNA测序结果准确性非常高。所有环状RNA都能抵抗RNaseR的消化,进一步证实了这些RNA的环形结构。云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的测序公司,自行建立的环状RNA数据库circDB,借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点为客户提供好的服务。黑龙江甲基化环状m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰。

福建RIP环状RNA实时定量PCR,环状

环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转录前、后及翻译水平严格调控细胞生殖生长等过程。云序曾对环状RNA经典研究思路进行过详细解析(2018国自然研究热点一环状RNA研究深度剖析),感兴趣的老师可以查询浏览。

研究三:环状RNA分子功能机制 在确定Cia-cGAS具有明显细胞表型之后,作者围绕其分子机制展开了详细的探索。为了找到Cia-cGAS影响下游的靶基因,作者在敲除Cia-cGAS后进行转录组分析,发现差异表达的基因与IFN-α下游靶基因是一致的。且当Cia-cGAS敲除后I型IFN mRNAs 表达量也明显增高。结果,作者证实cia-cGAS通过调控I型IFN通路影响LT-HSC静息状态。接下来,作者针对Cia-cGAS在该通路中的作用机理进行了详细解析。作者直接采用RNA Pull Down技术手段找到与Cia-cGAS相互作用的功能蛋白。基于这一技术手段,作者发现Cia-cGAS与cGAS蛋白具有明显相互作用。cGAS RIP实验反向证实二者之间具有真实的相互作用。免疫荧光及FISH实验证实Cia-cGAS及cGAS细胞内共定位表达。基于EMSA等技术手段,作者找到了二者相互作用位点。后续作者补充大量生理生化实验,结果揭示LT-HSC中Cia-cGAS结合并抑制cGAS的活性,结果通过拮抗cGAS催化产物I型IFN来维持HSCs静息状态。同一基因位置可以产生不同类型的环状RNA。

福建RIP环状RNA实时定量PCR,环状

云序生物对ac4CRNA乙酰化检测手段为acRIP-Seq技术,技术原理如下:将乙酰化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有乙酰化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本只含有打断的RNA的片段,并不添加RNA乙酰化特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取的乙酰化片段的背景。对比免疫共沉淀(IP)样本和对照样本(Input)中的序列片段,将RNA乙酰化修饰位点定位到转录组上,并根据RNA-seq数据,计算样本中RNA乙酰化程度及对RNA表达水平的影响。circRNA形成没有3’末端和5’末端的共价环状结构。天津m6a环状研究

与mRNA相比,m6A甲基化修饰在环状RNA上更普遍。福建RIP环状RNA实时定量PCR

研究背景:造血干细胞(HSC)自我更新和分化之间的平衡打破将导致骨髓衰竭及恶性血液tumour发生。然而,HSCs如何维持其静止状态并避免I型干扰素(IFN)介导能量耗竭、细胞凋亡仍未可知。本文一种名为cia-cGAS的环状RNA,它在长效(LT)-HSCs细胞核中高度表达。小鼠Cia-cGAS缺陷将导致I型IFN在骨髓中高表达并伴随静息LT-HSC数量明显减少。在稳态条件下,cia-cGAS在细胞核中通过结合DNA传感器cGAS以阻断其合酶活性,由此保护静息LT-HSC免于被cGAS介导耗尽凋亡。此外,cia-cGAS与线性cGAS相比,与cGAS结合亲和力更强,由此抑制cGAS介导LT-HSCs中I型IFN产生。本文揭示了一个新型环状RNA——cia-cGAS可结合DNA敏感的cGAMP合酶cGAS并抑制其活性,调控长效造血干细胞(LT-HSC)静息状态。福建RIP环状RNA实时定量PCR

上海云序生物科技有限公司是一家有着雄厚实力背景、信誉可靠、励精图治、展望未来、有梦想有目标,有组织有体系的公司,坚持于带领员工在未来的道路上大放光明,携手共画蓝图,在上海市等地区的商务服务行业中积累了大批忠诚的客户粉丝源,也收获了良好的用户口碑,为公司的发展奠定的良好的行业基础,也希望未来公司能成为*****,努力为行业领域的发展奉献出自己的一份力量,我们相信精益求精的工作态度和不断的完善创新理念以及自强不息,斗志昂扬的的企业精神将**云序供和您一起携手步入辉煌,共创佳绩,一直以来,公司贯彻执行科学管理、创新发展、诚实守信的方针,员工精诚努力,协同奋取,以品质、服务来赢得市场,我们一直在路上!

环状产品展示
  • 福建RIP环状RNA实时定量PCR,环状
  • 福建RIP环状RNA实时定量PCR,环状
  • 福建RIP环状RNA实时定量PCR,环状
与环状相关的文章
与环状相关的**
信息来源于互联网 本站不为信息真实性负责