河北外泌体环状研究

云序生物—环状RNA研究优势云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的测序公司，自行建立的环状RNA数据库circDB，借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点为客户提供好的服务。云序积累了超过10000例环状RNA测序的经验，样本覆盖20多个物种以及50多种疾病。云序生物提供系统性环状RNA服务，从筛选（circRNA测序）到验证（qPCR）再到机制研究（RIP、RNApull-down、ChIP、双荧光素酶实验）以及上游表观调控（m6A甲基化等各类RNA修饰研究），为您更全的覆盖环状RNA上下游分子机制验证的重要研究环节。除了提供组织和细胞的样本类型测序之外，我们还提供体液、血清血浆、外泌体石蜡样本等特殊样本的测序服务。回首过去，从国内发出circRNA测序到全转录组测序概念提出，到m6A等RNA甲基化测序平台出现，再到如今的eccDNA测序服务，我们一直在紧跟国际科研热点方向进行测序技术的创新。m6A环状RNA测序，云序生物提供成熟m6A RNA甲基化MeRIP-seq服务。河北外泌体环状研究

近期，云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组包含了外泌体和环状RNA两大科研热点，应用云序生物提供的全转录组测序服务，通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《JournalofNeurotrauma》（影响因子5.19）上发表了世界first小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA研究的一篇文章。研究背景：大脑创伤（TBI）具有极高的发病率和致死率，会不同程度地危害身体健康，目前对其致病机理，尤其是对神经系统造成伤害的分子机理尚不知晓。陕西RIP环状dnacircRNA 早于20世纪70年代在RNA病毒中被发现。

胶质瘤作为较常见的颅内恶性tumour占颅脑tumour的40%~50%，电磁辐射等其他环境致cancer因素会导致胶质瘤的发生，尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤医治手段，但是多形性胶质母细胞瘤（GBM）的强侵袭、增殖能力仍给病人的医治造成很大的困难。上海第二军医大学附属长征医院研究者通过环状RNA测序，从环状RNA角度对胶质瘤的发生和发展进行了研究， 共发现206个上调环状和1205个下调环状，其中扩大样本量qPCR验证（13例正常、68例疾病）后将目标锁定在circBRAF。该环状转录自BRAF基因，虽然在正常人样本当中BRAF基因编码的环状cricBRAF分子mRNA分子水平无明显差异，但是在疾病样本当中circBRAF有明显上调，KM曲线结合临床资料表明该环状的高表达能一定程度上预示着疾病的恶性程度和预后情况。

ac4CRNA乙酰化是在RNAac4C修饰酶的作用下，使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰（N4-acetylcytidine）。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18SrRNA上，导致Watson-Crick碱基热稳定性增加，调控蛋白合成中的编码准确性；近期研究发现ac4C分布在人类转录组中，大多数位点出现在编码序列（CDS）内，并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前，ac4CRNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰，是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”！目前发现的circRNA主要来源于基因外显子。

一、环状RNA表达谱：作者将50个CRC患者和50个正常人的血清样品分别随机分为5组均匀混样，对混样后的5v5个样品进行了外泌体全转录组测序,检测到1924个环状RNA,来源基因在各染色体上均有分布，环状大部分长度小于500nt。二、CRC患者和健康人中环状RNA的差异表达接着作者筛选出了122个在CRC与健康人血清外泌体中差异表达的环状RNA，其中100个明显上调，22个明显下调。其中65个为新发现的环状RNA。三、差异环状RNA的功能预测通过对环状RNA来源基因的GO分析预测差异环状RNA的功能，结果显示上调的环状的潜在功能富集在蛋白修饰和细胞对内源性刺激的反应相关功能，高尔基体相关功能。此外KEGG分析还找到了这些基因参与的4个相关通路。可以翻译成蛋白质，但大部分是非编码RNA。广西环状mRNA测序

云序生物提供一站式环状RNA实时定量PCR技术服务。河北外泌体环状研究

（humanpapillomavirus）染上以及酗酒、吸烟等因素都有可能导致舌鳞状细胞cancer（tonguesquamouscellcarcinoma,TSCC）的发生，恶性舌cancer的增长会严重影响到病人的吞咽、呼吸、语言等正常生理功能，严重影响病人的生活质量。南通大学吴昊团队应用全转录组测序技术对TSCC病人的舌ai组织进行环状RNA研究，这一工作为舌ai发病机制和医治研究提供更多理论依据和研究基础，对332个差异表达环状RNA富集分析结果表明，这些环状分子可能参与cancer相关信号通路的调控。河北外泌体环状研究

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