研究二:环状RNA分子细胞表型作者发现Cia-cGAS是由D430042O09Rik的4、5、6号外显子连接成环。且位于外显子上下游的内含子区域具有成环所需高度同源序列。作者通过Cas9技术手段,敲除一端同源序列后,成功获得Cia-cGAS敲除小鼠模型。敲除小鼠中LSK祖细胞明显增多,LT-HSC明显减少,且基因敲除小鼠出生6个月后会死于贫血。对基因敲除小鼠中LT-HSC进行BrdU染色,结果说明敲除小鼠中LT-HSC细胞处于增殖分裂活跃期。同时脉冲标记H2B-GFP小鼠模型证实Cia-cGAS敲除后,静息状态的LT-HSC细胞比例明显降低。环状 RNA 可以起到 microRNA 海绵的作用。江西m7G环状平台
鸡白血病病毒亚群(ALV-J)是一类逆转录病毒,该病毒会引起一种重要的感ran性疾病。患病的家禽会导致产蛋率的下降,大面积影响到家禽养殖产业。感ranALV-J的鸡免疫系统会受到严重的抑制并引起多种tumour疾病从而产生很高的死亡率,目前还不能通过接种疫苗的方式来防御这种疾病。来自华南农业大学广东省重点实验室的研究团队通过环状RNA测序的方式研究了病毒抗性与病毒易感的鸡肝脏组织当中环状RNA的表达,发现了32个差异表达的环状分子,其中12个在ALV-J抗性样本中表达量明显升高,而20个在易感样本中表达量更高,而生信预测表明这些环状RNA分子能够调控免疫分子通路的信息传递从而改变生物体的抵抗力。江西外泌体环状平台环状RNA可以抵抗核酸外切酶的降解作用。
云序生物—环状RNA研究优势云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的测序公司,自行建立的环状RNA数据库circDB,借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点为客户提供好的服务。云序积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病。云序生物提供系统性环状RNA服务,从筛选(circRNA测序)到验证(qPCR)再到机制研究(RIP、RNApull-down、ChIP、双荧光素酶实验)以及上游表观调控(m6A甲基化等各类RNA修饰研究),为您更全的覆盖环状RNA上下游分子机制验证的重要研究环节。除了提供组织和细胞的样本类型测序之外,我们还提供体液、血清血浆、外泌体石蜡样本等特殊样本的测序服务。回首过去,从国内发出circRNA测序到全转录组测序概念提出,到m6A等RNA甲基化测序平台出现,再到如今的eccDNA测序服务,我们一直在紧跟国际科研热点方向进行测序技术的创新。
作为一种广fan存在于各类真核生物中的新型非编码RNA,环状RNA逐渐成为了当下热门的明星分子。由于环状RNA的研究刚刚起步,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限。因此,对新物种中环状RNA表达谱进行系统性研究就成为了发表SCI文章的一条捷径。云序生物客户发表的这项成果是全世界di一篇对非洲爪蟾环状RNA进行系统性研究的文章,也为广大研究人员提供了一个非常好的模板,即:如何通过环状RNA高通量测序和生物信息学分析,在不进行功能和分子机制研究的情况下,短平快的发表一篇影响因子不错的文章,非常具有借鉴意义。云序优势:一站式服务,优化的实验流程,严格的质控,专业的生物信息学分析。
环状RNA是什么?环状RNA(circRNAs)是一类不具有5’末端帽子和3’末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。目前发现的circRNAs主要来源于基因外显子exon,但还有其他类型,比如来源于内含子intron,基因间intergenic,反义链antisense,重叠区senseoverlapping。首先需要确定好研究物种,疾病模型,样品类型等基本信息。接下来,通过高通量手段即RNA-seq(云序提供全转录组-seq或circRNA-seq)或文献报道,筛选差异表达的circRNA。如果想短平快的发表3-5分的文章,那么表达谱分析显得再合适不过了。如果有大量的临床样本,那么做分子标志物也是很easy的,思路和表达谱分析相似如下图展示,不过多了临床样本的统计和验证。(比如KM曲线,ROC曲线,PAM分析等等)m6A RNA-seq的富集效率是决定数据质量的关键。安徽m1A环状研究
m6A环状RNA测序,云序生物提供成熟m6A RNA甲基化MeRIP-seq服务。江西m7G环状平台
云序环状RNA课题技术服务四大模块:一、环状RNA筛选:1.1circRNA测序1.2全转录组测序(同时检测circRNA、lncRNA、mRNA)二、环状RNA验证2.1qRT-PCR对选定目标RNA分子可进行qPCR检测服务,包括引物设计与表达鉴定。2.2Sanger测序与RNaseR酶耐受实验对选定的环状RNA分子进行反式剪切位点引物设计,扩增后Sanger测序验证环状;使用RNaseR酶处理环状RNA分子,验证环状RNA分子稳定性。三、CircRNA功能机制研究3.1RIP测序/qPCR针对目标蛋白抗体把蛋白-RNA复合物沉淀下来,并对复合物上的RNA进行测序或对目标RNA进行qRCR表达分析。江西m7G环状平台
上海云序生物科技有限公司汇集了大量的优秀人才,集企业奇思,创经济奇迹,一群有梦想有朝气的团队不断在前进的道路上开创新天地,绘画新蓝图,在上海市等地区的商务服务中始终保持良好的信誉,信奉着“争取每一个客户不容易,失去每一个用户很简单”的理念,市场是企业的方向,质量是企业的生命,在公司有效方针的领导下,全体上下,团结一致,共同进退,**协力把各方面工作做得更好,努力开创工作的新局面,公司的新高度,未来云序供和您一起奔向更美好的未来,即使现在有一点小小的成绩,也不足以骄傲,过去的种种都已成为昨日我们只有总结经验,才能继续上路,让我们一起点燃新的希望,放飞新的梦想!