3.生物信息学分析,AZ处理相关环状RNA的功能预测 2013年两篇Nature文章揭示环状RNA具有miRNA海绵的功能,它可以吸附miRNA来调节相关基因的表达。此后,环状RNA的ceRNA功能机制正被人们广fan研究。研究人员通过生物信息学预测,发现282条AZ相关差异表达的环状RNA含有miRNA的结合位点,每个环状RNA的结合位点数从1到21不等。基于这些数据,研究人员根据它们的结合能力选出了5个miRNA。 然后他们随机选择了5个差异下调的环状RNA,并使用前5个预测的miRNA构建了circRNA-miRNA网络。可以看出每个环状RNA有多个miRNA结合位点,且一些环状RNA与同一miRNA的结合位点是相同的,暗示着环状RNA彼此之间的竞争性与miRNA结合。以上结果表明非洲爪蟾体内环状RNA可能存在的miRNA的海绵功能。环状RNA在tumour领域的研究非常热门。天津m1A环状测序
技术简介 环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子,其在真核细胞中的大量存在颠覆了传统的线性RNA观点,成为近两年来RNA领域中迅速升起的一颗新星。环状RNA的表达具有组织和疾病特异性,与组织发育、疾病的发生和发展密切相关。此外,环状RNA不易降解,能在血浆、唾液等体液中稳定存在,可以作为新型疾病分子标志物。当前,科研人员对这一功能性分子仍知之甚少,可见对其展开深入的研究是非常有必要的,一场科研的竞赛已悄然开始!云序生物提供的环状RNA测序服务,采用Cloudseq CircRNA Enrichment Kit,去除样本中的线性mRNA和rRNA,保留纯化后的环状RNA,因此测序获得的环状RNA有效数据量是其他测序服务供应商远远无法企及的,帮助客户以较低的成本检测到更多的环状RNA。此外,Cloudseq CircRNA Enrichment Kit覆盖几乎全部已知物种,对环状RNA的研究将不再局限于人、小鼠、大鼠等常见物种。中国台湾研究环状circRNA可以与RNA结合蛋白相互结合影响亲本基因mRNA的表达。
斑马鱼作为一种重要的模式生物,对于其环状RNA的研究还尚未报道。作者以雌雄斑马鱼混合组织为样品,通过云序生物提供的环状RNA测序和生物信息学服务发表了全世界首篇斑马鱼环状RNA表达谱文章。本研究共筛选到3868条环状RNA,为后续研究鱼类环状RNA的生物学功能奠定基础。环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。
环状RNA作为新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,其中大于10分的文章约60篇,是2018年的3倍左右。2019年关于环状RNA的国自然审批金额高达8000多万,环状RNA的火热程度可想而知。2020年国自然还未公布,但是小编预测环状RNA如果还是集中在吸附microRNA的ceRNA机制上,可能会造成**审美疲劳,影响中标率。环状RNA海绵机制并不是单一的环状RNA参与调控的机制。近期近期多篇关于环状RNA机制研究,揭示了环状RNA在tumour方向的研究进展。目前发现的circRNA主要来源于基因外显子。
(human papillomavirus)染上以及酗酒、吸烟等因素都有可能导致舌鳞状细胞cancer(tongue squamous cell carcinoma, TSCC)的发生,恶性舌cancer的增长会严重影响到病人的吞咽、呼吸、语言等正常生理功能,严重影响病人的生活质量。南通大学吴昊团队应用全转录组测序技术对TSCC病人的舌ai组织进行环状RNA研究,这一工作为舌ai发病机制和医治研究提供更多理论依据和研究基础,对332个差异表达环状RNA富集分析结果表明,这些环状分子可能参与cancer相关信号通路的调控。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。天津m1A环状测序
circRNA分子呈封闭环状结构,不受RNA外切酶影响。天津m1A环状测序
研究背景: 利用高通量测序手段,研究者们在拟南芥、小鼠、果蝇和人体内都发现了环状RNA的高度表达,证明了环状RNA在不同物种中存在。目前,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限,环状RNA数据库circBase中已收录的物种有7个。作为一种重要的模式生物,非洲爪蟾的环状RNA尚未见报道。本文通过云序生物提供的一站式环状RNA测序、环状RNA定量PCR、环状RNA的RNase R耐受性实验和生物信息学服务于全世界进行了非洲爪蟾环状RNA表达谱的构建,为后续研究脊椎动物环状RNA的生物学功能奠定了基础,非常具有借鉴意义。天津m1A环状测序
上海云序生物科技有限公司坐落在上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2,是一家专业的上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。公司。公司目前拥有专业的技术员工,为员工提供广阔的发展平台与成长空间,为客户提供高质的产品服务,深受员工与客户好评。公司业务范围主要包括:RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等。公司奉行顾客至上、质量为本的经营宗旨,深受客户好评。一直以来公司坚持以客户为中心、RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体市场为导向,重信誉,保质量,想客户之所想,急用户之所急,全力以赴满足客户的一切需要。