RNAm6A甲基化是RNA较关键的内部修饰之一,是真核生物丰富和调节遗传信息的一种保守的转录后机制。m6A修饰具有多种生物学功能,如调控mRNA翻译、转录以及稳定性等。目前,已在多种植物中发现这种RNA修饰,参与调控不同植物的各方面生物学功能。其中,拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与m6A甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化普遍存在于拟南芥各个发育期,并揭示了RNA甲基化相关酶在特殊发育时期,如开花,叶片形成,种子发育,根部生长等过程中发挥重要作用。目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术。dna羟甲基化怎么表示
ac4C RNA乙酰化是在RNA ac4C修饰酶的作用下,使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰(N4-acetylcytidine)。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上,导致Watson-Crick碱基热稳定性增加,调控蛋白合成中的编码准确性;近期研究发现ac4C分布在人类转录组中,大多数位点出现在编码序列(CDS)内,并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前,ac4C RNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”!江苏环状DNA甲基化2’-O-RNA甲基化修饰在mRNA、tRNA、rRNA、miRNA等分子上分布。
云序优势一站式服务客户只需提供组织、细胞、体液样品或RNA,云序生物为您完成从ac4CRNA富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。抗体富集效率高acRIP-seq的富集效率是决定数据质量的关键,云序生物acRIP-seq实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程,具有极高的效率和特异性。分子全覆盖可检测mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多类RNA分子ac4C乙酰化位点。严格的质控云序生物对acRIP-seq实验每一步骤均设有关键质控,全程监控实验质量,保证客户得到数据。专业的生物信息学分析云序生物拥有专业的生物信息分析团队,帮助客户进行实验数据的挖掘。RNA乙酰化测序与转录组联合应用可整合RNA乙酰化数据和转录组数据进行生物信息学关联分析,揭示RNA乙酰化对基因表达调控的影响,深入挖掘RNA乙酰化的功能。
案例3:m6ARNA去甲基化酶ALKBH5通过结合lncRNA促进胶质瘤细胞期刊:CancerCell影响因子:27.43近年来,m6ARNA修饰的研究已成为当今生命科学领域前沿研究之一,不断有高影响分子文章问世。m6ARNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰,此时人们更关心m6ARNA修饰与重大疾病之间的相关性。近期CancerCell报道了m6ARNA去甲基化酶ALKBH5在神经胶质瘤中具有生理作用。在本研究中,去甲基化酶ALKBH5在恶性胶质瘤干性样细胞表达上调,而ALKBH5高表达的胶质细胞瘤患者预后生存率更差。通过敲低ALKBH5,meRIP鉴定m6ARNA甲基化修饰模式,基因芯片检测差异表达>2倍的基因,终筛选到与细胞周期调控相关的FOXM1基因,其在GSCs的自我修复和tumsour形成中起到关键作用。对m6A RNA甲基化,目前较流行的检测手段为m6A-Seq技术。
案例2:2’-O-RNA甲基化酶FTSJ3协助HIV病毒逃避宿主细胞免疫识别机制原文:FTSJ3isanRNA2’-O-methyltransferaserecruitedbyHIVtoavoidinnateimmunesensing期刊:Nature影响因子:41.6外国研究人员首先借助蛋白互作实验证实TRBP蛋白能够在不依赖于DICER酶的作用下与FTSJ3结合,形成复合物,因此推测,FTSJ3是一种2-O-甲基化转移酶。接着,体外和体内实验表明FTSJ3就是一种通过TRBP被招募到HIVRNA上的2-O-甲基化转移酶。通过优化的2’-O-RNA甲基化测序手段,证实在HIV病毒遗传信息的特定位置上存在依赖于FTSJ3的2-O-甲基化修饰。综上,该研究证实TRBP-FTSJ3复合物通过招募到HIV病毒RNA发生2-O-甲基化从而解释了HIV病毒逃避宿主细胞先天免疫识别的机制。miRNA的生物合成和生物学功能、tRNA稳定性、18S rRNA的核内加工及成熟。黑龙江mRNA甲基化
m6A甲基化是番茄果实mRNA中普遍存在的修饰。dna羟甲基化怎么表示
样本要求样品类型细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。样品量a)细胞:1×108b)组织:500mg-5gc)RNA:100μg-300μg(OD260/280:1.6-2.3;RNA无明显降解)样品运输及保存样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。云序优势一站式服务:客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。dna羟甲基化怎么表示
上海云序生物科技有限公司是一家集研发、制造、销售为一体的****,公司位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2,成立于2015-03-02。公司秉承着技术研发、客户优先的原则,为国内RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体的产品发展添砖加瓦。主要经营RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等产品服务,现在公司拥有一支经验丰富的研发设计团队,对于产品研发和生产要求极为严格,完全按照行业标准研发和生产。上海云序生物科技有限公司每年将部分收入投入到RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体产品开发工作中,也为公司的技术创新和人材培养起到了很好的推动作用。公司在长期的生产运营中形成了一套完善的科技激励政策,以激励在技术研发、产品改进等。上海云序生物科技有限公司以市场为导向,以创新为动力。不断提升管理水平及RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体产品质量。本公司以良好的商品品质、诚信的经营理念期待您的到来!