北京环状DNA甲基化

云序优势单碱基分辨m7GRNA甲基化单碱基测序方式，可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。抗体富集效率高m7GMeRIP测序方式，采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程，具有极高的效率和特异性。高通量检测可对全转录组范围内的m7G位点进行高通量地平行检测。全分子覆盖地对环状RNA、mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G位点进行检测。一站式服务客户需提供组织或细胞，云序生物一站式完成RNA抽提，样品预处理，建库，测序，数据分析流程。专业的生物信息学分析专业的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析需求miRNA的生物合成和生物学功能、tRNA稳定性、18S rRNA的核内加工及成熟。北京环状DNA甲基化

样本要求 样品类型 细胞、组织或RNA，其他样本类型请电询。 测序样品量 1.单碱基测序方式： a) 细胞：≥1×108 b) 组织：500 mg - 5 g c) RNA：100 μg - 300 μg 2. MeRIP测序方式： a) 细胞：≥2×107 b) 组织：100mg - 1g c) RNA：30 μg - 300 μg d) 超微量满足500 ng - 30 μg 样品运输及保存 样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。 样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存；RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。云南m7G+m3C RNA甲基化将甲基化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育。

案例2:m5CRNA甲基化基因组分布图谱原文：Distinct5-methylcytosineprofilesinpoly(A)RNAfrommouseembryonicstemcellsandbrain期刊：GenomeBiology影响因子：13.21近期刊登了解析RNAm5C在不同组织细胞的分布图谱相关文章。研究人员选取小鼠胚胎干细胞（ESC）和脑组织（n=3）作为实验样本，利用m5CRNA甲基化测序技术对两组样本中的总RNA和胞核RNA进行检测。结果表明，ESC中总RNA5mC的分布频率比脑组织的分布频率更高。研究人员将m5C位点和不同的基因组区域（CDS,5’-UTR,3’-UTR等）进行了关联分析。结果表明，总RNA中m5C位点更倾向于分布在转录起始位点。脑组织和ESC中，3’-UTR区m5C的分布区别很大，这暗示着3’-UTR区的RNAm5C修饰可能与细胞功能和细胞类型密切相关。

在本研究中，作者对两个玉米(Zeamays)自交系转录组范围内的m6AmRNA分布和多聚体分析进行了平行分析，以评估m6A修饰与翻译状态的整体相关性。m6A位点普遍分布于数千个蛋白编码基因中，局限于一个共识基序内，主要富集于3’UTR区，且m6A修饰在调节替代聚腺苷酸位点的选择中发挥作用。更重要的是，m6A修饰根据其强度和基因位置显示了与翻译状态的多方面相关性。此外，在m6A修饰中观察到大量的种内变异，这种自然变异部分是由基因特异性表达和选择性剪接驱动的。总之，这些发现为鉴定玉米中受m6A修饰的转录本提供了宝贵的资源，并为更好地理解m6A在介导基因表达调控中的自然变异铺平了道路。核糖RNA在2’位置上发生甲基化的化学修饰。

m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。研究表明，m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰，近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。与m6ARNA检测方式一致，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术，抗体富集的技术原理如下：将m1ARNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RAN片段，对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。m6A除了分布在 mRNA 中，也出现在很多非编码 RNA中 ，如：环状RNA 、LncRNA等。山东甲基化测序

2’-O-RNA甲基化是一种受RNA甲基化酶或纤维蛋白酶作用下。北京环状DNA甲基化

技术原理 为了系统性揭示RNA O8G氧化修饰，云序生物提供了成熟的 RNA O8G氧化MeRIP-Seq技术服务。技术原理如下：将RNA O8G氧化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有O8G氧化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RNA的片段。对照样本用于消除非特异性抓取O8G氧化片段的背景。对比免疫共沉淀IP样本和Input样本中的序列片段，将O8G氧化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，计算样本中O8G氧化程度。 配合专业的生物信息学分析，云序生物可进一步提供高精度的O8G氧化图谱，帮助客户揭示O8G氧化在生物学功能和潜在的作用机制。北京环状DNA甲基化

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