mRNAm6Am-Exo-seq测序服务云序生物在国内首批引入m6Am-Exo-seq测序服务,利用5’核酸外切酶消除非目的性的RNA的片段上m6A修饰的信号干扰,选择性地获取mRNA5’帽子结构下游m6Am修饰富集区域的序列信息。对选择性获取到的m6Am修饰的RNA的片段进行反转录建库和高通量测序,可为后续的生物信息学分析提供丰富的数据,进而揭示差异性m6Am修饰位点的特征及其可能的生物学功能,为您的科研课题提供强劲的助力。云序优势一站式服务:客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。种种研究迹象表明m6A 存在于很多物种中,占到了 RNA甲基化修饰的80%。microRNA甲基化基因
案例1:拟南芥花叶根组织m6ARNA甲基化谱原文:Transcriptome-widehigh-throughputdeepm6A-seqrevealsuniquedifferentialm6AmethylationpatternsbetweenthreeorgansinArabidopsisthaliana期刊:GenomeBiology影响因子:13.21西北农林科技大学联合中科院和普渡大学,借助m6ARNA甲基化测序技术,对比拟南芥花,叶,根组织中(每种组织有两个生物学重复)m6ARNA甲基化情况。结果发现检测组织中m6ARNA甲基化修饰程度比人类高10%左右,占转录组的83%。江西pri-miRNA甲基化2’-O-RNA甲基化是一种受RNA甲基化酶或纤维蛋白酶作用下。
m6A修饰在植物中是必不可少的。在这里,作者证明了在水稻中表达转基因人RNA去甲基化酶FTO可以使温室条件下的粮食产量增加3倍以上。在田间试验中,转基因FTO在水稻和马铃薯中的表达使产量和生物量增加了约50%。此外,FTO的存在促进了根分生组织细胞增殖和分蘖芽的形成,提高了光合效率和抗旱性,但对成熟细胞大小、茎分生组织细胞增殖、根直径、株高或倍性没有影响。FTO介导了植物RNA中大量的m6A去甲基化(在poly(A)RNA中约7%的去甲基化,在非核糖体核RNA中m6A下降约35%),诱导染色质开放和转录激huo。因此,调控植物RNAm6A甲基化是一种很有前景的策略,可明显提高植物的生长和作物产量。
RNAm6A甲基化是RNA较关键的内部修饰之一,是真核生物丰富和调节遗传信息的一种保守的转录后机制。m6A修饰具有多种生物学功能,如调控mRNA翻译、转录以及稳定性等。目前,已在多种植物中发现这种RNA修饰,参与调控不同植物的各方面生物学功能。其中,拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与m6A甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化普遍存在于拟南芥各个发育期,并揭示了RNA甲基化相关酶在特殊发育时期,如开花,叶片形成,种子发育,根部生长等过程中发挥重要作用。RNA m6A甲基化是RNA较关键的内部修饰之一。
技术简介2’-O-RNA甲基化是一种受RNA甲基化酶或纤维蛋白酶作用下,核糖RNA在2’位置上发生甲基化的化学修饰。在哺乳动物、酵母、植物、病毒等物种中普遍存在。已有研究表明,2’-O-RNA甲基化修饰在mRNA、tRNA、rRNA、miRNA等分子上分布。从结构上,2’-O-RNA甲基化通过提高核苷酸的疏水性,从而增强其稳定性。已有研究表明,2’-O-RNA甲基化影响mRNA与蛋白的结合、调控rRNA翻译效率、参与tRNA识别等生物过程。近年来,2’-O-RNA甲基化修饰作为一类新型RNA甲基化,高影响因子文章不断,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点。m7G RNA甲基化修饰能够调节mRNA的转录。四川mRNA甲基化
环状RNA也会被m6A甲基化修饰,并会促进环状RNA编码蛋白这一有趣的结论。microRNA甲基化基因
在这篇文章中,发现番茄果实成熟过程中,mRNA m6A甲基化表现出与DNA甲基化相似的动态变化。RNA甲基组分析表明,m6A甲基化是番茄果实mRNA中普遍存在的修饰,且m6A位点富集于终止密码子周围和3'UTR区。在具有DNA超甲基化的成熟缺陷表观突变体无色非成熟(Cnr)的果实中,有1100多个转录本显示m6A水平升高,而只有134个转录本显示m6A水平降低,表明m6A的整体水平升高。m6A沉积通常与转录本丰度呈负相关。云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。microRNA甲基化基因
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