在本研究中,作者对两个玉米(Zeamays)自交系转录组范围内的m6AmRNA分布和多聚体分析进行了平行分析,以评估m6A修饰与翻译状态的整体相关性。m6A位点普遍分布于数千个蛋白编码基因中,局限于一个共识基序内,主要富集于3’UTR区,且m6A修饰在调节替代聚腺苷酸位点的选择中发挥作用。更重要的是,m6A修饰根据其强度和基因位置显示了与翻译状态的多方面相关性。此外,在m6A修饰中观察到大量的种内变异,这种自然变异部分是由基因特异性表达和选择性剪接驱动的。总之,这些发现为鉴定玉米中受m6A修饰的转录本提供了宝贵的资源,并为更好地理解m6A在介导基因表达调控中的自然变异铺平了道路。环状RNA也会被m6A甲基化修饰,并会促进环状RNA编码蛋白这一有趣的结论。甲基化基因
案例1:m6Am测序揭示了人类转录组中m6Am甲基化的动态性原文:m6Am-seqrevealsthedynamicm6Ammethylationinthehumantranscriptome期刊:NatureCommunication影响因子:13.78北京大学的研究人员开辟了一种新型的m6Am修饰RNA的测序方法,使用抗体拉取5’帽子片段富集m6Am修饰的RNA区域,再在特定生化环境条件下使用FTO酶来区分m6Am与m6A修饰,进而可达到精细至单碱基水平的m6AmRNA测序。使用该方法对人类转录组测序的结果显示,m6Am修饰的分布主要局限于mRNA5’帽子下游的翻译起始位点,并且多数具有BCA的序列motif特征(B=C/U/G)。对细胞施予热激、低氧等应激性刺激时,细胞转录组的m6Am水平有明显上升,说明RNA的m6Am动态修饰可能参与了细胞应激性反应。针对低氧环境刺激的进一步GO分析显示,m6Am水平升高的基因与内质网应激调节的生物学过程有关。rDNA甲基化利器云序生物率先开展m5C RNA甲基化测序服务,采用经典重亚硫 酸盐处理的方式进行测序。
案例1:人类mRNA上2’-O-RNA甲基化转录组图谱 原文:Nm-seq maps 2’-O-methylation sites in human mrna with base precision 期刊:Nature Methods 影响因子:26.9 美国芝加哥大学研究团队利用2’-O-RNA甲基化测序手段,检测mRNA分子上的甲基化位点。与m6A RNA甲基化测序数据相比,2’-O-RNA甲基化位点主要分布在转录组CDS区,其中近一半在剪接位点附近,相当一部分在内含子中发现Nm位点。三分之一的2’-O-RNA甲基化位点在AGAUC处存序列偏好性,并且跟随了5个碱基的A或G碱基高分布。有趣的是,2’-O-RNA甲基化位点富含三种氨基酸的编码密码子。总的来说,该文章揭示了2’-O-RNA甲基化在人类细胞中的分布特征。
云序优势单碱基分辨m7GRNA甲基化单碱基测序方式,可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。抗体富集效率高m7GMeRIP测序方式,采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程,具有极高的效率和特异性。高通量检测可对全转录组范围内的m7G位点进行高通量地平行检测。全分子覆盖地对环状RNA、mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G位点进行检测。一站式服务客户需提供组织或细胞,云序生物一站式完成RNA抽提,样品预处理,建库,测序,数据分析流程。专业的生物信息学分析专业的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求Nature正刊发表文章,证实发生m6A RNA甲基化修饰可以调控mRNA稳定性。
RNAm6A甲基化是RNA较关键的内部修饰之一,是真核生物丰富和调节遗传信息的一种保守的转录后机制。m6A修饰具有多种生物学功能,如调控mRNA翻译、转录以及稳定性等。目前,已在多种植物中发现这种RNA修饰,参与调控不同植物的各方面生物学功能。其中,拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与m6A甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化普遍存在于拟南芥各个发育期,并揭示了RNA甲基化相关酶在特殊发育时期,如开花,叶片形成,种子发育,根部生长等过程中发挥重要作用。m6A 修饰就是真核生物 mRNA 中较常见存在的一种修饰形式,得到了常见的关注和研究。m7G RNA甲基化机制
云序生物自2018年推出了超微量RNA甲基化测序。甲基化基因
案例3:m6ARNA去甲基化酶ALKBH5通过结合lncRNA促进胶质瘤细胞期刊:CancerCell影响因子:27.43近年来,m6ARNA修饰的研究已成为当今生命科学领域前沿研究之一,不断有高影响分子文章问世。m6ARNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰,此时人们更关心m6ARNA修饰与重大疾病之间的相关性。近期CancerCell报道了m6ARNA去甲基化酶ALKBH5在神经胶质瘤中具有生理作用。在本研究中,去甲基化酶ALKBH5在恶性胶质瘤干性样细胞表达上调,而ALKBH5高表达的胶质细胞瘤患者预后生存率更差。通过敲低ALKBH5,meRIP鉴定m6ARNA甲基化修饰模式,基因芯片检测差异表达>2倍的基因,终筛选到与细胞周期调控相关的FOXM1基因,其在GSCs的自我修复和tumsour形成中起到关键作用。甲基化基因
上海云序生物科技有限公司一直专注于上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。,是一家商务服务的企业,拥有自己**的技术体系。目前我公司在职员工以90后为主,是一个有活力有能力有创新精神的团队。公司业务范围主要包括:RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等。公司奉行顾客至上、质量为本的经营宗旨,深受客户好评。一直以来公司坚持以客户为中心、RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体市场为导向,重信誉,保质量,想客户之所想,急用户之所急,全力以赴满足客户的一切需要。