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云序优势一站式服务客户只需提供组织、细胞、体液样品或RNA,云序生物为您完成从ac4CRNA富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。抗体富集效率高acRIP-seq的富集效率是决定数据质量的关键,云序生物acRIP-seq实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程,具有极高的效率和特异性。分子全覆盖可检测mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多类RNA分子ac4C乙酰化位点。严格的质控云序生物对acRIP-seq实验每一步骤均设有关键质控,全程监控实验质量,保证客户得到数据。专业的生物信息学分析云序生物拥有专业的生物信息分析团队,帮助客户进行实验数据的挖掘。RNA乙酰化测序与转录组联合应用可整合RNA乙酰化数据和转录组数据进行生物信息学关联分析,揭示RNA乙酰化对基因表达调控的影响,深入挖掘RNA乙酰化的功能。RNA去甲基化可以提高水稻和马铃薯植株的产量和生物量。山东超微量RNA甲基化

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RNAm6A甲基化是RNA较关键的内部修饰之一,是真核生物丰富和调节遗传信息的一种保守的转录后机制。m6A修饰具有多种生物学功能,如调控mRNA翻译、转录以及稳定性等。目前,已在多种植物中发现这种RNA修饰,参与调控不同植物的各方面生物学功能。其中,拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与m6A甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化普遍存在于拟南芥各个发育期,并揭示了RNA甲基化相关酶在特殊发育时期,如开花,叶片形成,种子发育,根部生长等过程中发挥重要作用。m5C RNA甲基化机制研究表明,m7G RNA甲基化修饰存在于各类分子中。

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在本研究中,作者对两个玉米(Zeamays)自交系转录组范围内的m6AmRNA分布和多聚体分析进行了平行分析,以评估m6A修饰与翻译状态的整体相关性。m6A位点普遍分布于数千个蛋白编码基因中,局限于一个共识基序内,主要富集于3’UTR区,且m6A修饰在调节替代聚腺苷酸位点的选择中发挥作用。更重要的是,m6A修饰根据其强度和基因位置显示了与翻译状态的多方面相关性。此外,在m6A修饰中观察到大量的种内变异,这种自然变异部分是由基因特异性表达和选择性剪接驱动的。总之,这些发现为鉴定玉米中受m6A修饰的转录本提供了宝贵的资源,并为更好地理解m6A在介导基因表达调控中的自然变异铺平了道路。

PNAS|8-oxoG在mRNA中的积累可以改变哺乳动物细胞中的蛋白质翻译发表时间:2018年4月17号影响因子:9.412PNAS杂志发表了来自国家老年医学中心、北京医院研究的一篇有关O8G氧化修饰改变哺乳动物细胞中蛋白合成的研究成果。文章题目为“Transcriptionalmutagenesismediatedby8-oxoGinducestranslationalerrorsinmammaliancells”。哺乳动物细胞内形成的活性氧可以在mRNA中产生8-oxoG修饰,这一氧化修饰在基因表达过程中会导致碱基错配。本研究首先构建了一种基于超敏荧光素酶Gluc(Gussialuciferase)的报告基因检测系统,通过第二代测序技术发现当RNA中8-oxoG含量增加使U-to-G位点增加,从而诱导表达淀粉样前体蛋白的淀粉样β肽(老年痴呆的重要标志物)。该研究结果表明,8-oxoG在mRNA中的积累可以改变哺乳动物细胞中的蛋白质合成。本论文的发表为深入氧化修饰与蛋白合成间的分子机理提供了全新的研究思路!2’-O-RNA甲基化修饰在mRNA、tRNA、rRNA、miRNA等分子上分布。

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案例1:m6Am测序揭示了人类转录组中m6Am甲基化的动态性原文:m6Am-seqrevealsthedynamicm6Ammethylationinthehumantranscriptome期刊:NatureCommunication影响因子:13.78北京大学的研究人员开辟了一种新型的m6Am修饰RNA的测序方法,使用抗体拉取5’帽子片段富集m6Am修饰的RNA区域,再在特定生化环境条件下使用FTO酶来区分m6Am与m6A修饰,进而可达到精细至单碱基水平的m6AmRNA测序。使用该方法对人类转录组测序的结果显示,m6Am修饰的分布主要局限于mRNA5’帽子下游的翻译起始位点,并且多数具有BCA的序列motif特征(B=C/U/G)。对细胞施予热激、低氧等应激性刺激时,细胞转录组的m6Am水平有明显上升,说明RNA的m6Am动态修饰可能参与了细胞应激性反应。针对低氧环境刺激的进一步GO分析显示,m6Am水平升高的基因与内质网应激调节的生物学过程有关。近两年高影响因子文章不断,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点。环状DNA甲基化分析

miRNA的生物合成和生物学功能、tRNA稳定性、18S rRNA的核内加工及成熟。山东超微量RNA甲基化

案例2:METTL1通过m7G甲基化促进let-7MicroRNA的加工原文:METTL1Promoteslet-7MicroRNAProcessingviam7GMethylation期刊:MolecularCell影响因子:14.25剑桥大学戈登研究所和病理学系中心,借助m7GRNA甲基化测序技术,识别了A549细胞中miRNA具有m7G甲基化修饰。该研究发现Mettl1调控的pri-let7m7G修饰通过改变pri-let7中G-四重结构,进一步调控pre-let7和let7的表达,影响肺ai细胞迁移。该研究揭示了Mettl1依赖的m7G甲基化修饰可以作为调控miRNA结构、生物发生和细胞迁移的一种新的RNA修饰。山东超微量RNA甲基化

上海云序生物科技有限公司是以提供RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体为主的私营有限责任公司,公司成立于2015-03-02,旗下高通量测序,测序合成,科研,技术服务,已经具有一定的业内水平。公司承担并建设完成商务服务多项重点项目,取得了明显的社会和经济效益。多年来,已经为我国商务服务行业生产、经济等的发展做出了重要贡献。

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