海南甲基化

案例2:m5CRNA甲基化基因组分布图谱原文：Distinct5-methylcytosineprofilesinpoly(A)RNAfrommouseembryonicstemcellsandbrain期刊：GenomeBiology影响因子：13.21近期刊登了解析RNAm5C在不同组织细胞的分布图谱相关文章。研究人员选取小鼠胚胎干细胞（ESC）和脑组织（n=3）作为实验样本，利用m5CRNA甲基化测序技术对两组样本中的总RNA和胞核RNA进行检测。结果表明，ESC中总RNA5mC的分布频率比脑组织的分布频率更高。研究人员将m5C位点和不同的基因组区域（CDS,5’-UTR,3’-UTR等）进行了关联分析。结果表明，总RNA中m5C位点更倾向于分布在转录起始位点。脑组织和ESC中，3’-UTR区m5C的分布区别很大，这暗示着3’-UTR区的RNAm5C修饰可能与细胞功能和细胞类型密切相关。ctDNA 的甲基化检测，同时结合了 ctDNA 测序于 DNA 甲基化测序的优势。海南甲基化

云序优势 一站式服务： 客户只需提供细胞、组织或RNA，云序生物为您完成从MeRIP富集，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。 样本要求： 样品类型： 细胞、组织或RNA，其他样本类型请电询。 样品量： a) 细胞：2×107 b) 组织：100 mg-1 g c) RNA：30-300 μg（OD260/280：1.6-2.3；RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7） 样品运输及保存： 样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。 样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。甲基化分析m6A甲基化主要通过减少IAP mRNA的半衰期而起作用。

云序优势单碱基分辨m7GRNA甲基化单碱基测序方式，可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。抗体富集效率高m7GMeRIP测序方式，采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程，具有极高的效率和特异性。高通量检测可对全转录组范围内的m7G位点进行高通量地平行检测。全分子覆盖地对环状RNA、mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G位点进行检测。一站式服务客户需提供组织或细胞，云序生物一站式完成RNA抽提，样品预处理，建库，测序，数据分析流程。专业的生物信息学分析专业的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析需求

研究还发现，m6Am 修饰是一个可逆的动态修饰，当细胞遭遇热激、低氧等应激性刺激时 m6Am 水平上升，说明 m6Am 可能在细胞应激反应中扮演了重要角色。近来也有研究发现，除了 mRNA 的较早编码核苷酸残基以外，在 snRNA 内部也有 m6Am 甲基化修饰的分布。虽然 m6Am 修饰早在 1975 年就已经被人类发现，但由于检验手段的匮乏，科学家难以区分出 m6A 修饰与 m6A 修饰，因此直到近年来 m6Am 测序技术逐渐发展成熟，才为进一步深入研究 m6Am 这一重要的 RNA 修饰铺平了道路。云序生物为您带来一种基于酶学方法的 DNA 甲基化测序技术 EM-seq。

原文：METTL4catalyzesm6AmmethylationinU2snRNAtoregulatepre-mRNAsplicing期刊：NecleicAcidsResearch影响因子：16.48新加坡南洋理工大学的研究人员通过人类全转录组RNA甲基化测序，在Mettl4敲除组与野生型对照组之间寻找出m6Am相对甲基化水平的差异位点，其中U2snRNA的第30位RNA残基有明显的m6Am修饰水平差异。进一步的FLAG-tag融合蛋白实验证明，METTL4蛋白直接催化了U2snRNA上的m6Am甲基化修饰的发生。METTL4过表达实验发现，其催化的RNA内部m6Am修饰位点具有HMAGKD的序列motif特征（H=A/C/U,M=A/C,K=G/U,D=A/G/U）。在Mettl4敲除的人类细胞中，因为U2snRNA无法完成m6Am修饰，故而对snRNA的pre-mRNA剪接功能产生了诸多影响。m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译，以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。dna羟甲基化的检测方法

而随后Cell Research也发表文章，证实环状RNA也会被m6A甲基化修饰。海南甲基化

技术原理 为了系统性揭示RNA O8G氧化修饰，云序生物提供了成熟的 RNA O8G氧化MeRIP-Seq技术服务。技术原理如下：将RNA O8G氧化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有O8G氧化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RNA的片段。对照样本用于消除非特异性抓取O8G氧化片段的背景。对比免疫共沉淀IP样本和Input样本中的序列片段，将O8G氧化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，计算样本中O8G氧化程度。 配合专业的生物信息学分析，云序生物可进一步提供高精度的O8G氧化图谱，帮助客户揭示O8G氧化在生物学功能和潜在的作用机制。海南甲基化

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