m6A是真核生物中较常见的RNA修饰,被认为是一种新的表观遗传标记,参与多种生物过程。m6A调控几种主要人类病毒性疾病的模式和功能已经有报道。然而,m6A在植物病害暴发中的分布模式和作用尚不清楚。在此,作者分析了两种破坏性的病毒感ran水稻植株中的m6A修饰情况。发现m6A甲基化主要与病毒gan染水稻植株中表达不活跃的基因有关。作者还检测到同一基因上不同的m6A峰分布,这可能是水稻条纹病毒和水稻黑条纹矮病毒感ran之间存在不同抗病毒模式的原因。有趣的是,病毒感ran后水稻m6A甲基化水平增加。m7G RNA甲基化单碱基测序方式,可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。外泌体甲基化 作用
Nature | miR-1的位置特异性氧化导致心脏肥大 发表时间:2020年8月5日 影响因子:42.778 Nature上发表的来自韩国高丽大学Sung Wook团队的一篇研究在氧化还原相关疾病心肌肥大的大鼠模型中对氧化的miRNA进行了特异性测序研究。 作者在氧化还原相关疾病心肌肥大的大鼠模型中对氧化的microRNA(miRNA)进行了特异性测序。结果发现8-氧代鸟嘌呤2(o8G)修饰是选择性地在miRNA的特殊区域(位置2-8)产生的,并通过o8G-A碱基互补配对来调节其他mRNA。用肾上腺素能激动剂医治后主要在miR-1(7o8G-miR-1)的第7位诱导了o8G氧化修饰。单独引入的7o8G-miR-1或7U-miR-1(其中7位的G被U取代)足以引起小鼠心脏肥大,o8G-miR-1的mRNA靶基因在受影响的表型中起作用,反之对小鼠心肌细胞7o8G-miR-1的特异性抑制可减轻心脏肥大。o8G-miR-1也与心肌病患者有关。本研究表明miRNA的位置特异性氧化可以作为表观转录机制来协调病理生理学氧化还原介导的基因表达,为研究氧化修饰在病理生理学中的作用提供了新的思路。mRNA甲基化测序RNA去甲基化可以提高水稻和马铃薯植株的产量和生物量。
云序优势 单碱基分辨 m7G RNA甲基化单碱基测序方式,可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。 抗体富集效率高 m7G MeRIP测序方式,采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程,具有极高的效率和特异性。 高通量检测 可对全转录组范围内的m7G位点进行高通量地平行检测。 全分子覆盖 地对环状RNA、mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G位点进行检测。 一站式服务 客户需提供组织或细胞,云序生物一站式完成RNA抽提,样品预处理,建库,测序,数据分析流程。 专业的生物信息学分析 专业的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求
在本研究中,作者对两个玉米(Zeamays)自交系转录组范围内的m6AmRNA分布和多聚体分析进行了平行分析,以评估m6A修饰与翻译状态的整体相关性。m6A位点普遍分布于数千个蛋白编码基因中,局限于一个共识基序内,主要富集于3’UTR区,且m6A修饰在调节替代聚腺苷酸位点的选择中发挥作用。更重要的是,m6A修饰根据其强度和基因位置显示了与翻译状态的多方面相关性。此外,在m6A修饰中观察到大量的种内变异,这种自然变异部分是由基因特异性表达和选择性剪接驱动的。总之,这些发现为鉴定玉米中受m6A修饰的转录本提供了宝贵的资源,并为更好地理解m6A在介导基因表达调控中的自然变异铺平了道路。种种研究迹象表明m6A 存在于很多物种中,占到了 RNA甲基化修饰的80%。
样品要求 样品类型 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量 a)细胞:≥2×107 b)组织:500mg - 1g c) RNA:30μg - 300μg d) 超微量满足500ng - 30μg 样品运输与保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 m7G RNA甲基化修饰作为一类新型RNA甲基化。外泌体甲基化 作用
对m6A RNA甲基化,目前较流行的检测手段为m6A-Seq技术。外泌体甲基化 作用
m5C RNA是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。利用高通量测序手段验证了非编码RNA以及部分mRNA中m5C存在,但是在不同物种、不同组织中m5C修饰分布图谱尚没有系统性报道。云序生物率先开展m5C RNA甲基化测序服务,采用经典重亚硫 酸盐处理的方式进行测序。在全转录范围内及tRNA水平查看基因m5C甲基化修饰水平。 通过高通量测序和生物信息分析,识别甲基化富集的基因组区域。 富集峰识别后,得到的是一堆基因组位置信息,通过生物信息分析利用邻近基因对富集峰进行注释,并根据峰中点相对于已知基因的位置,将富集峰为启动子峰、上游峰、内含子峰、外显子峰、基因间峰。 外泌体甲基化 作用
上海云序生物科技有限公司总部位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2,是一家上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的公司。云序生物拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队,以高度的专注和执着为客户提供RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。云序生物始终以本分踏实的精神和必胜的信念,影响并带动团队取得成功。云序生物始终关注自身,在风云变化的时代,对自身的建设毫不懈怠,高度的专注与执着使云序生物在行业的从容而自信。