人、大鼠、小鼠来源的环状研究已经取得了一定进展,农学背景的云序客户也在自己擅长的生物标本中进行了环状RNA研究,证明了环状在多个物种当中都起到了重要的生物学作用。河南农业大学研究团队出环状分子可以调控小麦在环境压力下对光合作用、卟啉、叶绿素代谢、氧化磷酸化以及氨基酸的生物合成等方面起到应答性的调控作用,天津医科大研究团队在快速心房起搏(rapid atrial pacing,RAP)犬模型的心房组织中探寻circRNA-miRNA网络,预测环状分子在离子通道活性和细胞骨架结构成分中起重要作用。莠去津(Atrazine, AZ)是一种环境内分泌干扰物,可以影响两栖动物发育过程。山东职业卫生研究中心研究团队通过比较AZ诱导发育异常组织和正常非洲爪蟾组织中环状分子的异常表达,推测环状分子可以参与wnt信号通路与孕酮介导的卵母细胞成熟信号通路。类似的,其他云序客户发表文章中还关注到了斑马鱼、鸡等其他物种当中环状RNA的重要生物学作用。circRNA分子呈封闭环状结构,不易被核酸外切酶RNaseR降解,比线性RNA更稳定。天津遗传环状
2020年6月18日云序用户山大二院在Frontiers in Oncology (IF=4.85)上发表了一篇题目RNA-Seq Profiling of Serum Exosomal Circular RNAs Reveals Circ-PNN as a Potential Biomarker for Human Colorectal Cancer的文章,该文章通过运用了云序生物外泌体全转录组测序探究了环状RNA作为结肠ai分子标志物的可能性。 结肠ai(CRC)是第三大常见恶性tumour,早期CRC患者存活率远高于晚期患者,tumour的早期诊断对改善预后至关重要。近年来有许多研究发现,外泌体作为普遍存在于体液中的一种微囊泡,含有大量DNA、RNA和蛋白等分子,可以反应他们来源细胞的信息。许多ai细胞来源的外泌体内的分子具有成为cancer分子标志物的潜力。这其中,环状RNA由于其稳定性高,被作为多种cancer的分子标志物研究过。在这篇文章中,作者通过对50个患者和50和健康人血清中外泌体环状RNA的研究,提出了其中circ-PNN作为CRC诊断分子标志物的可能。青海修饰环状RIP(RNA Immunoprecipitation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术。
ac4C RNA乙酰化是在RNA ac4C修饰酶的作用下,使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰(N4-acetylcytidine)。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上,导致Watson-Crick碱基热稳定性增加,调控蛋白合成中的编码准确性;近期研究发现ac4C分布在人类转录组中,大多数位点出现在编码序列(CDS)内,并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前,ac4C RNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”!
“一站到底”!云序生物环状RNA研究从做谱(环状RNA测序、全转录组测序、环状RNA甲基化测序)到机制研究(RNA Pull Down、RIP),为您更全的覆盖差异环状RNA分子筛选到下游分子机制验证的重要研究环节。此外,云序生物自行建立并维护的环状RNA数据库circDB凭借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点,支持许多客户发表环状RNA成果。在过去的时间里云序生物和各位生命科学领域的**学者、医护工作者共同进步成长,探索未知的奥秘。回首过去,从表观遗传学到表观转录组学,从基因组到蛋白质组,从细胞内到外泌体,云序生物依托于高通量测序技术为越来越多的临床与基础生物研究者提供了高质量的科研服务。在我们的共同努力下,相信在新的一年里云序客户会发表更多的高分文章。m5C环状RNA测序,是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。
莠去津(Atrazine, AZ)是一种影响两栖动物发育的环境内分泌干扰物质。山东职业卫生研究中心研究团队通过比较AZ诱导发育异常组织和正常非洲爪蟾组织中环状分子的异常表达,推测环状分子可以参与wnt信号通路与孕酮介导的卵母细胞成熟信号通路。非洲爪蟾睾丸组织云序生物全转录组测序,进行环状RNA筛选验证,生信预测发现部分差异明显的环状RNA在miRNA海绵中发挥作用。本研究证明AZ可以通过调节非洲爪蟾睾丸功能基因的表达来改变环状RNA,而环状RNA在发育中的雄性非洲爪蟾的AZ诱导睾丸变性中发挥作用。不同物种中鉴定的cirRNA数目是不一样的。m5c环状平台
目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术。天津遗传环状
环状RNA作为新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,其中大于10分的文章约60篇,是2018年的3倍左右。2019年关于环状RNA的国自然审批金额高达8000多万,环状RNA的火热程度可想而知。2020年国自然还未公布,但是小编预测环状RNA如果还是集中在吸附microRNA的ceRNA机制上,可能会造成**审美疲劳,影响中标率。环状RNA海绵机制并不是单一的环状RNA参与调控的机制。近期近期多篇关于环状RNA机制研究,揭示了环状RNA在tumour方向的研究进展。天津遗传环状
上海云序生物科技有限公司位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2。公司业务分为RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等,目前不断进行创新和服务改进,为客户提供良好的产品和服务。公司将不断增强企业重点竞争力,努力学习行业知识,遵守行业规范,植根于商务服务行业的发展。云序生物凭借创新的产品、专业的服务、众多的成功案例积累起来的声誉和口碑,让企业发展再上新高。