浙江microRNA甲基化

近年来，科学家们发现了一种可逆的RNA甲基化—m6A，即RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上发生甲基化修饰(N6-methyladenosine，m6A)。研究发现，m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰，m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译，以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。种种研究迹象表明m6A 存在于很多物种中，占到了 RNA甲基化修饰的80%。m6A除了分布在 mRNA 中，也出现在很多非编码 RNA中 ，如：环状RNA 、LncRNA等。Nature正刊发表文章，证实发生m6A RNA甲基化修饰可以调控mRNA稳定性。而随后Cell Research也发表文章，证实环状RNA也会被m6A甲基化修饰，并会促进环状RNA编码蛋白这一有趣的结论。核糖RNA在2’位置上发生甲基化的化学修饰。浙江microRNA甲基化

样本要求 样品类型 细胞、组织或RNA，其他样本类型请电询。 测序样品量 1.单碱基测序方式： a) 细胞：≥1×108 b) 组织：500 mg - 5 g c) RNA：100 μg - 300 μg 2. MeRIP测序方式： a) 细胞：≥2×107 b) 组织：100mg - 1g c) RNA：30 μg - 300 μg d) 超微量满足500 ng - 30 μg 样品运输及保存 样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。 样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存；RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。山东甲基化研究RNA去甲基化可以提高水稻和马铃薯植株的产量和生物量。

m6A甲基化已经被证明与植物对病原体的抗性有关。然而，小麦(Triticumaestivum)全转录组m6A谱及其在小麦抗小麦黄花叶病毒(WYMV)中的潜在生物学功能尚未见报道。这项研究是shou次鉴定两个不同抗WYMV小麦品种的转录组m6A修饰谱。通过对m6A-MeRIP-seq数据的分析，作者在WYMV感ran的抗病小麦品种(WRV)和WYMV感ran的敏感小麦品种(WSV)中鉴定出25752个共有m6A峰和30582个共有m6A基因，这些峰主要富集在编码序列3‘UTR区和终止密码子中。GO分析和RNA测序数据显示，m6A和mRNA水平均发生明显变化的基因与植物防御反应有关。

案例2：2’-O-RNA甲基化酶FTSJ3协助HIV病毒逃避宿主细胞免疫识别机制原文：FTSJ3isanRNA2’-O-methyltransferaserecruitedbyHIVtoavoidinnateimmunesensing期刊：Nature影响因子：41.6外国研究人员首先借助蛋白互作实验证实TRBP蛋白能够在不依赖于DICER酶的作用下与FTSJ3结合，形成复合物，因此推测，FTSJ3是一种2-O-甲基化转移酶。接着，体外和体内实验表明FTSJ3就是一种通过TRBP被招募到HIVRNA上的2-O-甲基化转移酶。通过优化的2’-O-RNA甲基化测序手段，证实在HIV病毒遗传信息的特定位置上存在依赖于FTSJ3的2-O-甲基化修饰。综上，该研究证实TRBP-FTSJ3复合物通过招募到HIV病毒RNA发生2-O-甲基化从而解释了HIV病毒逃避宿主细胞先天免疫识别的机制。适用于m6A RNA甲基化谱研究，快速筛选m6A RNA甲基化靶基因。

案例1:m6Am测序揭示了人类转录组中m6Am甲基化的动态性原文：m6Am-seqrevealsthedynamicm6Ammethylationinthehumantranscriptome期刊：NatureCommunication影响因子：13.78北京大学的研究人员开辟了一种新型的m6Am修饰RNA的测序方法，使用抗体拉取5’帽子片段富集m6Am修饰的RNA区域，再在特定生化环境条件下使用FTO酶来区分m6Am与m6A修饰，进而可达到精细至单碱基水平的m6AmRNA测序。使用该方法对人类转录组测序的结果显示，m6Am修饰的分布主要局限于mRNA5’帽子下游的翻译起始位点，并且多数具有BCA的序列motif特征（B=C/U/G）。对细胞施予热激、低氧等应激性刺激时，细胞转录组的m6Am水平有明显上升，说明RNA的m6Am动态修饰可能参与了细胞应激性反应。针对低氧环境刺激的进一步GO分析显示，m6Am水平升高的基因与内质网应激调节的生物学过程有关。Nature正刊发表文章，证实发生m6A RNA甲基化修饰可以调控mRNA稳定性。dna羟甲基化测试

除了拟南芥，在其他植物中如番茄、小麦、玉米以及高粱等均发现了RNA m6A甲基化修饰。浙江microRNA甲基化

在这篇文章中，发现番茄果实成熟过程中，mRNA m6A甲基化表现出与DNA甲基化相似的动态变化。RNA甲基组分析表明，m6A甲基化是番茄果实mRNA中普遍存在的修饰，且m6A位点富集于终止密码子周围和3'UTR区。在具有DNA超甲基化的成熟缺陷表观突变体无色非成熟(Cnr)的果实中，有1100多个转录本显示m6A水平升高，而只有134个转录本显示m6A水平降低，表明m6A的整体水平升高。m6A沉积通常与转录本丰度呈负相关。云序优势 一站式服务： 客户只需提供细胞、组织或RNA，云序生物为您完成从MeRIP富集，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。浙江microRNA甲基化

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