案例2:METTL1通过m7G甲基化促进let-7MicroRNA的加工原文:METTL1Promoteslet-7MicroRNAProcessingviam7GMethylation期刊:MolecularCell影响因子:14.25剑桥大学戈登研究所和病理学系中心,借助m7GRNA甲基化测序技术,识别了A549细胞中miRNA具有m7G甲基化修饰。该研究发现Mettl1调控的pri-let7m7G修饰通过改变pri-let7中G-四重结构,进一步调控pre-let7和let7的表达,影响肺ai细胞迁移。该研究揭示了Mettl1依赖的m7G甲基化修饰可以作为调控miRNA结构、生物发生和细胞迁移的一种新的RNA修饰。将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育。湖北ac4C RNA乙酰化甲基化
RNA 修饰在基因表达调控中扮演着非常重要的角色。m6A 修饰就是真核生物 mRNA 中较常见存在的一种修饰形式,得到了常见的关注和研究。除此之外,还存在着一种分子结构上非常相似的 RNA 修饰形式:m6Am——在 m6A 修饰的基础上,同一个腺苷酸残基的核糖的 2’ 羟基也被甲基化,产生 2’ 甲氧基结构(2’-O-CH3)。与 m6A 的常见分布所不同的是,m6Am 修饰的分布主要局限于 mRNA 5’ 帽子结构下游的较早核苷酸残基上发生。该位点的 m6Am 修饰在进化上高度保守,无论是在斑马鱼、小鼠还是人类细胞中均有发现。江西甲基化利器研究表明,m7G RNA甲基化修饰存在于各类分子中。
案例1:拟南芥花叶根组织m6ARNA甲基化谱原文:Transcriptome-widehigh-throughputdeepm6A-seqrevealsuniquedifferentialm6AmethylationpatternsbetweenthreeorgansinArabidopsisthaliana期刊:GenomeBiology影响因子:13.21西北农林科技大学联合中科院和普渡大学,借助m6ARNA甲基化测序技术,对比拟南芥花,叶,根组织中(每种组织有两个生物学重复)m6ARNA甲基化情况。结果发现检测组织中m6ARNA甲基化修饰程度比人类高10%左右,占转录组的83%。
案例:mRNA中胞嘧啶核苷乙酰化促进其翻译效率原文:AcetylationofCytidineinmRNAPromotesTranslationEfficiency期刊:Cell影响因子:36.22美国ai症研究所(NCI)和弗雷德里克实验室,发现下调NAT10(RNA乙酰化酶)能够抑制Hela细胞的行为;并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修饰,下调NAT10后,ac4C的总体水平下降;为了进一步探究ac4C的功能,作者对WT和下调NAT10的Hela细胞进行acRIP-seq和mRNA测序,发现ac4C的peak主要富集在mRNA的CDS区,同时下调NAT10能够降低ac4C在mRNA中的定点表达,并与靶mRNA的下调有很大关系;作者又进一步发现ac4C乙酰化修饰能够通过延长mRNA的半衰期并促进mRNA的稳定性,同时也能够通过ac4Cpeak中的密码子偏好性表达,决定并影响mRNA的解码效率,促进底物翻译。这些发现不仅扩大了mRNA修饰范围(包括乙酰化残基),也确立了ac4C在mRNA翻译调控中的作用。采用类似ELISA抑 制竞争免疫的方法,实验样本和RNA甲基化标准品与RNA甲基化抗体共孵育。
样品类型 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量 组织:100 mg – 1 g 细胞:2× 107 个以上 RNA:30-300 μg (OD260/280:1.6-2.3;RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7) 样品保存与运输 样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成 5-10 mg 的小块),可用 TRIzol 或 RNA 保护剂处理,液氮冻存后,-80℃ 保存, RNA 样品可溶于乙醇或 RNA-free 的超纯水中,-80℃ 保存,样品保存期间避免反复冻融。 样品运输:样品置于 1.5 mL 离心管中,封口膜封好,埋在盛有干冰的泡沫盒中运输。适用于m6A RNA甲基化谱研究,快速筛选m6A RNA甲基化靶基因。新疆甲基化芯片
ctDNA 的 5mC 甲基化修饰研究仍然是一个未被充分探索的领域。湖北ac4C RNA乙酰化甲基化
云序生物对O8GRNA氧化化检测手段为O8G-IP-Seq技术,技术原理如下:将O8G特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有O8G修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本只含有打断的RNA的片段,并不添加O8G特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取的O8G片段的背景。对比免疫共沉淀(IP)样本和对照样本(Input)中的序列片段,将O8G氧化修饰位点定位到转录组上,并根据RNA-seq数据,计算样本中O8G氧化程度及对RNA表达水平的影响。湖北ac4C RNA乙酰化甲基化
云序生物,2015-03-02正式启动,成立了RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等几大市场布局,应对行业变化,顺应市场趋势发展,在创新中寻求突破,进而提升高通量测序,测序合成,科研,技术服务的市场竞争力,把握市场机遇,推动商务服务产业的进步。业务涵盖了RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等诸多领域,尤其RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体中具有强劲优势,完成了一大批具特色和时代特征的商务服务项目;同时在设计原创、科技创新、标准规范等方面推动行业发展。我们在发展业务的同时,进一步推动了品牌价值完善。随着业务能力的增长,以及品牌价值的提升,也逐渐形成商务服务综合一体化能力。公司坐落于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2,业务覆盖于全国多个省市和地区。持续多年业务创收,进一步为当地经济、社会协调发展做出了贡献。