宁夏甲基化差异

案例1：哺乳动物mRNA内m7G甲基化转录组图谱 期刊：Molecular Cell 影响因子：14.25 由于全部种类的反转录酶均无法将RNA m7G位点逆转录成对应发生碱基突变的cDNA，为了准确的探究RNA内m7G甲基化情况，何川团队利用m7G自带正电荷的特征，开发了新的m7G单碱基深度测序方法。该方法能够将RNA内含m7G位点转化为另一种可产生反转录碱基变异的新位点，并依据碱基变异率估计m7G位点的甲基化水平。此方法随后也被证实可检测18S rRNA中的1639位内含m7G位点以及可揭示人类细胞tRNA中的22个46位内含m7G位点。并观测到其在mRNA分布、富集的共有序列及其它统计特征与m7G-MeRIP-seq数据基本保持一致。该文章不仅揭示了m7G甲基化在人类细胞中的分布特征，同时还发现METTL1是一种甲基转移酶，它在mRNA中催化了m7G甲基化修饰，并表明m7G的内部甲基化可以影响mRNA的翻译。RNA去甲基化可以提高水稻和马铃薯植株的产量和生物量。宁夏甲基化差异

云序生物对O8GRNA氧化化检测手段为O8G-IP-Seq技术，技术原理如下：将O8G特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有O8G修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本只含有打断的RNA的片段，并不添加O8G特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取的O8G片段的背景。对比免疫共沉淀（IP）样本和对照样本（Input）中的序列片段，将O8G氧化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，计算样本中O8G氧化程度及对RNA表达水平的影响。云南甲基化水平目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术。

技术原理 为了系统性揭示RNA O8G氧化修饰，云序生物提供了成熟的 RNA O8G氧化MeRIP-Seq技术服务。技术原理如下：将RNA O8G氧化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有O8G氧化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RNA的片段。对照样本用于消除非特异性抓取O8G氧化片段的背景。对比免疫共沉淀IP样本和Input样本中的序列片段，将O8G氧化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，计算样本中O8G氧化程度。 配合专业的生物信息学分析，云序生物可进一步提供高精度的O8G氧化图谱，帮助客户揭示O8G氧化在生物学功能和潜在的作用机制。

目前还没有一种完善的方法可以在单碱基分辨率下对每个转录本进行m6A的鉴定，这对评估m6A丰度是必要的。作者开发了一种新的方法，称为Nanom6A，用于在单碱基分辨率下鉴定和定量m6A修饰，使用基于XGBoost模型的纳米孔直接RNA测序。并使用MeRIP-Seq和m6A-REF-seq验证了此方法，证实了较高的准确性。利用这种方法，作者进行了毛果杨茎分化木质部中转录组范围的m6A修饰定量分析，揭示了不同的可变聚腺苷酸化(APA)量会导致不同的m6A修饰比例。ctDNA 的 5mC 甲基化修饰研究仍然是一个未被充分探索的领域。

样本要求1）样品类型：细胞、新鲜组织或RNA样品。2）样品量：细胞：2×107组织：500mg-1gRNA：30-300μg，浓度不低于100ng/μL3）RNA质量要求：OD260/280：1.8~2.1浓度≥100ng/μlRNA无明显降解（28S:18S≥1.5或者RIN≥7）4）样品保存：新鲜组织可用RNA保护剂处理或液氮冻存后，-80℃保存。细胞样品，离心收集细胞沉淀后用PBS洗2遍，直接-80℃保存；RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存。样品保存Note:样品保存期间避免反复冻融。5）样品运输：样品置于1.5mlEppendorf管或冻存管中，封口膜封好，装在塑料袋中，干冰运输。m6A 修饰就是真核生物 mRNA 中较常见存在的一种修饰形式，得到了常见的关注和研究。tRNA甲基化表达

适用于m6A RNA甲基化谱研究，快速筛选m6A RNA甲基化靶基因。宁夏甲基化差异

云序优势单碱基分辨m7GRNA甲基化单碱基测序方式，可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。抗体富集效率高m7GMeRIP测序方式，采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程，具有极高的效率和特异性。高通量检测可对全转录组范围内的m7G位点进行高通量地平行检测。全分子覆盖地对环状RNA、mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G位点进行检测。一站式服务客户需提供组织或细胞，云序生物一站式完成RNA抽提，样品预处理，建库，测序，数据分析流程。专业的生物信息学分析专业的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析需求宁夏甲基化差异

上海云序生物科技有限公司是国内一家多年来专注从事RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体的老牌企业。公司位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2，成立于2015-03-02。公司的产品营销网络遍布国内各大市场。公司现在主要提供RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体等业务，从业人员均有RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体行内多年经验。公司员工技术娴熟、责任心强。公司秉承客户是上帝的原则，急客户所急，想客户所想，热情服务。公司秉承以人为本，科技创新，市场先导，和谐共赢的理念，建立一支由RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体**组成的顾问团队，由经验丰富的技术人员组成的研发和应用团队。上海云序生物科技有限公司以诚信为原则，以安全、便利为基础，以优惠价格为RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体的客户提供贴心服务，努力赢得客户的认可和支持，欢迎新老客户来我们公司参观。