m1A RNA甲基化筛选

云序生物对O8G RNA氧化化检测手段为O8G-IP-Seq技术，技术原理如下： 将O8G特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有O8G修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本只含有打断的RNA的片段，并不添加O8G特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取的O8G片段的背景。对比免疫共沉淀（IP）样本和对照样本（Input）中的序列片段，将O8G氧化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，计算样本中O8G氧化程度及对RNA表达水平的影响。云序生物自2018年推出了超微量RNA甲基化测序。m1A RNA甲基化筛选

案例1: m6Am 测序揭示了人类转录组中 m6Am 甲基化的动态性 原文：m6Am-seq reveals the dynamic m6Am methylation in the human transcriptome 期刊：Nature Communication 影响因子：13.78 北京大学的研究人员开辟了一种新型的 m6Am 修饰 RNA 的测序方法，使用抗体拉取 5’ 帽子片段富集 m6Am 修饰的 RNA 区域，再在特定生化环境条件下使用 FTO 酶来区分 m6Am 与 m6A 修饰，进而可达到精细至单碱基水平的 m6Am RNA 测序。使用该方法对人类转录组测序的结果显示，m6Am 修饰的分布主要局限于 mRNA 5’ 帽子下游的翻译起始位点，并且多数具有 BCA 的序列 motif 特征（B=C/U/G）。对细胞施予热激、低氧等应激性刺激时，细胞转录组的 m6Am 水平有明显上升，说明 RNA 的 m6Am 动态修饰可能参与了细胞应激性反应。针对低氧环境刺激的进一步 GO 分析显示，m6Am 水平升高的基因与内质网应激调节的生物学过程有关。山西甲基化检测种种研究迹象表明m6A 存在于很多物种中，占到了 RNA甲基化修饰的80%。

m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。研究表明，m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰，近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。 与m6A RNA检测方式一致，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术，抗体富集的技术原理如下：将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RAN片段，对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。

m6A修饰在植物中是必不可少的。在这里，作者证明了在水稻中表达转基因人RNA去甲基化酶FTO可以使温室条件下的粮食产量增加3倍以上。在田间试验中，转基因FTO在水稻和马铃薯中的表达使产量和生物量增加了约50%。此外，FTO的存在促进了根分生组织细胞增殖和分蘖芽的形成，提高了光合效率和抗旱性，但对成熟细胞大小、茎分生组织细胞增殖、根直径、株高或倍性没有影响。FTO介导了植物RNA中大量的m6A去甲基化(在poly(A) RNA中约7%的去甲基化，在非核糖体核RNA中m6A下降约35%)，诱导染色质开放和转录激huo。因此，调控植物RNA m6A甲基化是一种很有前景的策略，可明显提高植物的生长和作物产量。RNA m6A甲基化是RNA较关键的内部修饰之一。

云序优势 一站式服务： 客户只需提供细胞、组织或RNA，云序生物为您完成从MeRIP富集，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。 优化的实验流程： MeRIP的富集效率是决定数据质量的关键，云序生物MeRIP实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程，具有极高的效率和特异性。 严格的质控： 云序生物对MeRIP实验的各个关键步骤进行严格的质控，全程监控实验质量，确保客户得到优zhi的数据。 专业的生物信息学分析： 云序生物具有强大的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析需求。 特异性高： 通过抗体特异性富集发生甲基化修饰的RNA的片段，以较低的成本实现转录组范围的RNA甲基化研究。RNA 修饰在基因表达调控中扮演着非常重要的角色。湖南甲基化调控

云序生物为您带来一种基于酶学方法的 DNA 甲基化测序技术 EM-seq。m1A RNA甲基化筛选

ac4C RNA乙酰化是在RNA ac4C修饰酶的作用下，使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰（N4-acetylcytidine）。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上，导致Watson-Crick碱基热稳定性增加，调控蛋白合成中的编码准确性；近期研究发现ac4C分布在人类转录组中，大多数位点出现在编码序列（CDS）内，并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前，ac4C RNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰，是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”！m1A RNA甲基化筛选