样本要求 样品类型 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量 a) 细胞:1×108 b) 组织:500 mg - 5g c) RNA:100 μg - 300 μg (OD260/280:1.6-2.3; RNA无明显降解) 样品运输及保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 ctDNA 的甲基化检测,同时结合了 ctDNA 测序于 DNA 甲基化测序的优势。甘肃甲基化表达
样品要求 样品类型 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量 a)细胞:≥2×107 b)组织:500mg - 1g c) RNA:30μg - 300μg d) 超微量满足500ng - 30μg 样品运输与保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 6mADNA甲基化筛选m6A除了分布在 mRNA 中,也出现在很多非编码 RNA中 ,如:环状RNA 、LncRNA等。
样本要求 样品类型 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 测序样品量 1.单碱基测序方式: a) 细胞:≥1×108 b) 组织:500 mg - 5 g c) RNA:100 μg - 300 μg 2. MeRIP测序方式: a) 细胞:≥2×107 b) 组织:100mg - 1g c) RNA:30 μg - 300 μg d) 超微量满足500 ng - 30 μg 样品运输及保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。
RNA 修饰在基因表达调控中扮演着非常重要的角色。m6A 修饰就是真核生物 mRNA 中较常见存在的一种修饰形式,得到了常见的关注和研究。除此之外,还存在着一种分子结构上非常相似的 RNA 修饰形式:m6Am——在 m6A 修饰的基础上,同一个腺苷酸残基的核糖的 2’ 羟基也被甲基化,产生 2’ 甲氧基结构(2’-O-CH3)。与 m6A 的常见分布所不同的是,m6Am 修饰的分布主要局限于 mRNA 5’ 帽子结构下游的较早核苷酸残基上发生。该位点的 m6Am 修饰在进化上高度保守,无论是在斑马鱼、小鼠还是人类细胞中均有发现。m7G RNA甲基化是在甲基化转移酶的作用下,使RNA鸟嘌呤(G)的第七位N上加上甲基的一种修饰。
案例3:m6A RNA去甲基化酶ALKBH5通过结合lncRNA促进胶质瘤细胞 期刊:Cancer Cell 影响因子:27.43 近年来,m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域前沿研究之一,不断有高影响分子文章问世。m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰,此时人们更关心m6A RNA修饰与重大疾病之间的相关性。近期Cancer Cell报道了m6A RNA去甲基化酶ALKBH5在神经胶质瘤中具有生理作用。在本研究中,去甲基化酶ALKBH5在恶性胶质瘤干性样细胞表达上调,而ALKBH5高表达的胶质细胞瘤患者预后生存率更差。通过敲低ALKBH5,meRIP鉴定m6A RNA甲基化修饰模式,基因芯片检测差异表达>2倍的基因,终筛选到与细胞周期调控相关的FOXM1基因,其在GSCs的自我修复和tumsour形成中起到关键作用。科学家们发现了一种可逆的RNA甲基化—m6A。山东m6A RNA甲基化
Nature正刊发表文章,证实发生m6A RNA甲基化修饰可以调控mRNA稳定性。甘肃甲基化表达
LncRNA m6Am-Exo-seq 测序服务 云序生物在国内shou批引入 m6Am-Exo-seq 测序服务,利用 5’ 核酸外切酶消除非目的性的 RNA 的片段上 m6A 修饰的信号干扰,选择性地获取 mRNA以及 LncRNA 的 5’ 帽子结构下游 m6Am 修饰富集区域的序列信息。接下来,我们对选择性获取到的 m6Am 修饰的 RNA 的片段进行反转录建库和高通量测序(测序结果将同时包含 mRNA 和 LncRNA)。通过后续的生物信息学分析,可以区分来自 mRNA 和 LncRNA 的测序片段,从而较全揭示 LncRNA和mRNA 的 m6Am 修饰位点,并推测其可能的生物学功能。 甘肃甲基化表达