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m5C RNA是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。利用高通量测序手段验证了非编码RNA以及部分mRNA中m5C存在,但是在不同物种、不同组织中m5C修饰分布图谱尚没有系统性报道。云序生物率先开展m5C RNA甲基化测序服务,采用经典重亚硫 酸盐处理的方式进行测序。在全转录范围内及tRNA水平查看基因m5C甲基化修饰水平。 通过高通量测序和生物信息分析,识别甲基化富集的基因组区域。 富集峰识别后,得到的是一堆基因组位置信息,通过生物信息分析利用邻近基因对富集峰进行注释,并根据峰中点相对于已知基因的位置,将富集峰为启动子峰、上游峰、内含子峰、外显子峰、基因间峰。 RNA甲基化组揭示了m6A介导的DNA去甲基化酶基因SlDML2在番茄果实成熟中的调控作用。dna 转录 甲基化与基因表达

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云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 样本要求: 样品类型: 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量: a) 细胞:2×107 b) 组织:100 mg-1 g c) RNA:30-300 μg(OD260/280:1.6-2.3;RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7) 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。甘肃甲基化文章近两年高影响因子文章不断,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点。

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云序优势 单碱基分辨 可对2’-O-RNA甲基化修饰进行单碱基定位。 高通量检测 可对全转录组范围内的2’-O-RNA位点进行高通量地平行检测。 全分子覆盖 可较全地对mRNA、LncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的2’-O-RNA甲基化位点进行检测。 一站式服务 客户需提供组织或细胞,云序生物一站式完成RNA抽提,样品预处理,建库,测序,数据分析全套流程。 专业的生物信息学分析 专业的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求。

LncRNA m6Am-Exo-seq 测序服务 云序生物在国内shou批引入 m6Am-Exo-seq 测序服务,利用 5’ 核酸外切酶消除非目的性的 RNA 的片段上 m6A 修饰的信号干扰,选择性地获取 mRNA以及 LncRNA 的 5’ 帽子结构下游 m6Am 修饰富集区域的序列信息。接下来,我们对选择性获取到的 m6Am 修饰的 RNA 的片段进行反转录建库和高通量测序(测序结果将同时包含 mRNA 和 LncRNA)。通过后续的生物信息学分析,可以区分来自 mRNA 和 LncRNA 的测序片段,从而较全揭示 LncRNA和mRNA 的 m6Am 修饰位点,并推测其可能的生物学功能。 m6A 修饰就是真核生物 mRNA 中较常见存在的一种修饰形式,得到了常见的关注和研究。

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m6A修饰在植物中是必不可少的。在这里,作者证明了在水稻中表达转基因人RNA去甲基化酶FTO可以使温室条件下的粮食产量增加3倍以上。在田间试验中,转基因FTO在水稻和马铃薯中的表达使产量和生物量增加了约50%。此外,FTO的存在促进了根分生组织细胞增殖和分蘖芽的形成,提高了光合效率和抗旱性,但对成熟细胞大小、茎分生组织细胞增殖、根直径、株高或倍性没有影响。FTO介导了植物RNA中大量的m6A去甲基化(在poly(A) RNA中约7%的去甲基化,在非核糖体核RNA中m6A下降约35%),诱导染色质开放和转录激huo。因此,调控植物RNA m6A甲基化是一种很有前景的策略,可明显提高植物的生长和作物产量。m6A甲基化是番茄果实mRNA中普遍存在的修饰。福建ctDNA甲基化

m7G RNA甲基化修饰作为一类新型RNA甲基化。dna 转录 甲基化与基因表达

m6A甲基化已经被证明与植物对病原体的抗性有关。然而,小麦(Triticum aestivum) 全转录组m6A谱及其在小麦抗小麦黄花叶病毒(WYMV)中的潜在生物学功能尚未见报道。这项研究是shou次鉴定两个不同抗WYMV小麦品种的转录组m6A修饰谱。通过对m6A-MeRIP-seq数据的分析,作者在WYMV感ran的抗病小麦品种(WRV)和WYMV感ran的敏感小麦品种(WSV)中鉴定出25752个共有m6A峰和30582个共有m6A基因,这些峰主要富集在编码序列3‘UTR区和终止密码子中。GO分析和RNA测序数据显示,m6A和mRNA水平均发生明显变化的基因与植物防御反应有关。dna 转录 甲基化与基因表达

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