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2.环状RNA定量PCR及RNase R耐受实验,验证环状RNA的表达和结构 为了验证测序结果的准确性,研究人员随机选取了8条差异表达的环状RNA,利用“divergent primers”进行环状RNA定量PCR检测和RNase R耐受性实验。所有环状RNA的表达都能够被定量PCR实验检测到,并且定量PCR结果与测序结果趋势一致,表明环状RNA测序结果准确性非常高。所有环状RNA都能抵抗RNase R的消化,进一步证实了这些RNA的环形结构。云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的测序公司,自行建立的环状RNA数据库circDB,借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点为客户提供好的服务。环状RNA哪家做得好,还是上海松江区的云序生物比较好。四川m1A环状rna

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作为明星分子,环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度?从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑:上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究,整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上,云序客户此前更是先后发表了全世界first斑马鱼环状RNA、first篇小麦环状RNA和first篇鸡环状RNA文章,如今首篇非洲爪蟾的环状RNA文章新鲜出炉了!这一成果今年年初发表在《Chemosphere》(影响因子4.2)上!宁夏环状环状RNA测序环状RNA不同物质间进化上具有保守性。

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研究指出,环状RNA能够调控来源基因的表达。为了进一步了解小麦差异表达环状RNA的功能,研究人员对它们的来源基因进行GO(Gene Ontology)分析。结果显示在脱水作用下,差异表达的环状RNA的来源基因可能在不同的生物进程和分子功能方面发挥作用。2013年两篇Nature文章揭示环状RNA具有miRNA海绵的功能,它可以吸附miRNA来调节基因的表达。研究人员对不同样本之间差异表达的62种环状RNA进行靶miRNA的结合预测。发现其中6种环状RNA具有潜在的miRNA结合位点。随后,研究人员对这些miRNA下游靶基因进行功能预测,分析结果显示靶基因参与的信号通路都与脱水应激反应相关,暗示着这6种差异表达的环状RNA可能通过miRNA海绵机制发挥作用。

云序专注于环状RNA研究,前期环状RNA筛选,云序提供全转录组及环状RNA测序相关服务;环状RNA验证,云序提供qPCR,RNaseR及Sanger测序等服务;文中环状RNA机制研究金钥匙——环状RNA Pull Down及RIP 环状RNA测序,云序均可提供全套服务!新年伊始,云序客户更是在环状RNA领域接连发表高分文章,包括世界首篇小鼠大脑创伤外泌体环状RNA文章;世界首篇非洲爪蟾环状RNA文章以及世界首篇红斑狼疮性肾炎环状RNA文章等等。云序致力于帮助客户在环状RNA研究领域占得先机,拔得头筹!环状RNA可直接与蛋白质结合。

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为了更全检测小麦中所有环状RNA的表达情况,研究人员分别对PEG和水处理后的小麦幼苗叶子进行环状RNA测序,共发现了88条环状RNA。通过对环状RNA的基因组来源进行分析,发现环状RNA可分为5类,其中基因间(intragenic)产生的环状RNA占大多数。接下来,研究人员系统分析了不同样本之间环状RNA的表达情况,发现62条环状RNA差异表达,这暗示着这些环状RNA可能在脱水应激中发挥作用。为了验证测序结果的准确性,研究人员挑选了16条环状RNA,利用“divergent primers”进行环状RNA定量PCR检测。环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子。四川ac4c环状RNA测序

m6A RNA-seq的富集效率是决定数据质量的关键。四川m1A环状rna

研究三:环状RNA分子功能机制 在确定Cia-cGAS具有明显细胞表型之后,作者围绕其分子机制展开了详细的探索。为了找到Cia-cGAS影响下游的靶基因,作者在敲除Cia-cGAS后进行转录组分析,发现差异表达的基因与IFN-α下游靶基因是一致的。且当Cia-cGAS敲除后I型IFN mRNAs 表达量也明显增高。结果,作者证实cia-cGAS通过调控I型IFN通路影响LT-HSC静息状态。接下来,作者针对Cia-cGAS在该通路中的作用机理进行了详细解析。作者直接采用RNA Pull Down技术手段找到与Cia-cGAS相互作用的功能蛋白。基于这一技术手段,作者发现Cia-cGAS与cGAS蛋白具有明显相互作用。cGAS RIP实验反向证实二者之间具有真实的相互作用。免疫荧光及FISH实验证实Cia-cGAS及cGAS细胞内共定位表达。基于EMSA等技术手段,作者找到了二者相互作用位点。后续作者补充大量生理生化实验,结果揭示LT-HSC中Cia-cGAS结合并抑制cGAS的活性,结果通过拮抗cGAS催化产物I型IFN来维持HSCs静息状态。四川m1A环状rna

上海云序生物科技有限公司位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2。公司业务涵盖RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等,价格合理,品质有保证。公司从事商务服务多年,有着创新的设计、强大的技术,还有一批**的专业化的队伍,确保为客户提供良好的产品及服务。云序生物立足于全国市场,依托强大的研发实力,融合前沿的技术理念,飞快响应客户的变化需求。

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