湖北m6a环状DNA测序

样本要求 样品类型： 组织、细胞、体液或总RNA样品。其它类型样品请咨询工作人员。 样品量： a)细胞：2×106 b)组织：50 mg c)体液：全血、血清、血浆 2-3 ml 脑脊液：5 ml 尿液：50 ml d)总RNA：2 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5 无明显降解，电泳检测样品特征性条带完整清晰，无明显弥散或拖尾 ) 样品运输及保存： 样品运输：样品置于1.5mL管中，封口膜封好，干冰运输。 样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存;血液样品应使用EDTA抗凝，不可用肝素;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。目前发现的circRNA主要来源于基因外显子。湖北m6a环状DNA测序

研究思路： 本文首先基于高通量手段比较了小鼠中LT-HSC，ST-HSC和MPPs中全转录组变化，共发现156种明显性差异表达的circRNAs。表达量验证证实9个circRNA在LT-HSC中明显性上调。在细胞表型层面，发现只有干扰D430042O09Rik转录的circRNA——Cia-cGAS后，可明显改变造血干细胞的亚群分布，作者因此锚定Cia-cGAS进行机制分析。作者通过Cas-9基因敲除策略成功构建了Cia-cGAS基因敲除小鼠，在Cia-cGAS基因敲除小鼠中LT-HSC明显性减少，I型IFN表达升高。通过RNA Pull-down实验，作者发现Cia-cGAS可以与cGAS结合，cGAS-RIP实验反向证实二者之间具有直接的相互作用。后续，作者通过生信预测结合EMSA实验分析了Cia-cGAS与cGAS相互作用的位点信息。酶学研究证明，Cia-cGAS可通过结合cGAS并抑制其活性。分析环状文章环状 RNA 呈封闭环状结构，在生物体中稳定存在。

“一站到底”！云序生物环状RNA研究从做谱（环状RNA测序、全转录组测序、环状RNA甲基化测序）到机制研究（RNA Pull Down、RIP），为您更全的覆盖差异环状RNA分子筛选到下游分子机制验证的重要研究环节。此外，云序生物自行建立并维护的环状RNA数据库circDB凭借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点，支持许多客户发表环状RNA成果。在过去的时间里云序生物和各位生命科学领域的**学者、医护工作者共同进步成长，探索未知的奥秘。回首过去，从表观遗传学到表观转录组学，从基因组到蛋白质组，从细胞内到外泌体，云序生物依托于高通量测序技术为越来越多的临床与基础生物研究者提供了高质量的科研服务。在我们的共同努力下，相信在新的一年里云序客户会发表更多的高分文章。

近期，云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组包含了外泌体和环状RNA两大科研热点，应用云序生物提供的全转录组测序服务，通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》（影响因子5.19）上发表了世界first小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA研究的一篇文章。 研究背景： 大脑创伤（TBI）具有极高的发病率和致死率，会不同程度地危害身体健康，目前对其致病机理，尤其是对神经系统造成伤害的分子机理尚不知晓。环状RNA可直接与蛋白质结合。

环状RNA作为研究持续火热的明星分子，不同于对其丰富的表达谱研究，环状RNA功能机制研究还处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制，部分circRNA可竞争性结合miRNA，解除miRNA对靶基因的抑制作用，上调靶基因的表达。其实，环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白，分别在转录前、后及翻译水平严格调控细胞生殖生长等过程。云序曾对环状RNA经典研究思路进行过详细解析（2018国自然研究热点一环状RNA研究深度剖析），感兴趣的老师可以查询浏览。circRNA主要由外显子构成，少部分由内含子环化形成。山东ac4c环状

m6A环状RNA测序，云序生物提供成熟m6A RNA甲基化MeRIP-seq服务。湖北m6a环状DNA测序

作为明星分子，环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度？从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑：上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究，整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上，云序客户此前更是先后发表了全世界first斑马鱼环状RNA、first篇小麦环状RNA和first篇鸡环状RNA文章，如今首篇非洲爪蟾的环状RNA文章新鲜出炉了！这一成果今年年初发表在《Chemosphere》（影响因子4.2）上！湖北m6a环状DNA测序

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