企业商机
表观遗传组测序基本参数
  • 品牌
  • 高通量测序,测序合成,科研,技术服务
  • 公司名称
  • 上海云序生物科技有限公司
  • 行业类型
  • 生物
  • 安全质量检测类型
  • 测序
  • 所在地
  • 北京,海南,上海,河北,广州,河南,湖北,深圳,成都,湖南,杭州,吉林,南京,江苏,天津,江西,武汉,辽宁,重庆,宁夏,安徽,青海,中国澳门,山东,福建,山西,甘肃,陕西,广东,四川,广西,中国台湾,贵州,西藏,内蒙古,黑龙江,浙江,云南,新疆,香港
  • 检测类型
  • 测序
表观遗传组测序企业商机

EM-seq 的优势相比于传统的WGBS 拥有多种优势: DNA 测序文库质量高、所需 DNA 起始量小 相比于WGBS,EM-seq 对 DNA 的损伤小,因此可以用更少 DNA 样品、更少的 PCR 轮数扩增出高质量的测序文库。云序生物提供的 EM-seq 服务,所需的 DNA 起始量可低至10ng。 DNA 文库的插入片段更长、更完整 相比于WGBS,EM-seq 处理后的 DNA的片段更完整,长度更长,避免产生测序缺口。出色的 GC 覆盖均一性 无论 GC 程度高低,EM-seq 的覆盖度都有均匀且优良的表现;相比之下,WGBS 测序文库高估了 AT 区,却低估了 GC 区,造成“GC 覆盖度偏误”。甚至会对传统遗传学和基因组学带来**性影响。云序表观遗传组测序价格

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CUT&Tag 有望将蛋白与染色质 DNA 互相作用的研究变成了一种类似 PCR 反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有**性的意义 在生物学研究中,DNA 与蛋白质之间的相互作用(DNA-Protein Interaction, DPI)是至关重要的,基因的表达、调控、复制、重组和修复,RNA 的转运、翻译和调控,都离不开 DPI,几乎所有的生命活动都会涉及 DPI。 早在十九世纪后期,科学家就通过显微镜观察到了蛋白质与 DNA 直接的相互作用,从那以后,他们开始深入探索蛋白质结合并控制 DNA 的作用机制。陕西平台表观遗传组测序内容云序生物质控流程严格,层层把关,为客户提供高准确度的结果。

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不同于已经得到深入研究的基因组 DNA 的表观遗传修饰,ctDNA 的 5mC 甲基化修饰研究仍然是一个未被充分探索的领域,对于科研者来说是一个尚待挖掘的金矿。既然如此,那我们是不是可以按图索骥,直接将基因组 DNA 甲基化修饰研究的传统方法照搬到 ctDNA 的5mC 甲基化修饰研究上来呢?答案是否定的:因为 ctDNA 含量低、缺乏染色质结构的保护,若直接将研究基因组 DNA 的 5mC 修饰的传统方法应用于 ctDNA,则会遇到南橘北枳的困境,云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。

本文作者利用850K芯片分别检测健康表皮、光化性角化病表皮、皮肤鳞状细胞ai表皮的DNA甲基化状态,发现AK甲基化显示出经典的tumsor甲基化的结构与cSCC的结构高度相似,通过降低DNA甲基化年龄、非CpG岛甲基化、干细胞相关的角蛋白和增强子甲基化模式进一步分析,证实了干细胞甲基化的典型特征。同时还发现这些特征只在一半的样本中检测到,而另一半则显示出与健康的表皮关系更密切。这些都表明AK 和 cSCC 存在两种亚型,并分别起源于不同的角质形成细胞分化阶段。总而言之,本文利用高通量技术手段研究鳞状细胞aiDNA甲基化在细胞分化过程中特征性分析,为其临床学的应用奠定了基础。后续进行文库构建与高通量测序,从而获得发生甲基化修饰的环状DNA。

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案例2 :鼻细胞表观基因甲基化作为儿童哮chuan和气道炎症生物标志物的研究 期刊:Nature Communication 影响因子:11.878 本文作者研究团队首先借助850K甲基化芯片平台对547名儿童鼻孔细胞表观基因组做了DNA甲基化检测分析,并对当前的哮chuan、变应原致敏、变应性鼻炎、呼出气一氧化氮(FeNO)和肺功能进行了鼻表观基因组关联分析(EWAS)。结果显示DNA差异甲基化主要发生在哮chuan相关基因、参与Th2和嗜酸性反应的基因、以及可能改变呼吸上皮的通透性和功能的基因。作者还发现发现随着过敏和哮chuan生物标志物的升高,表观遗传年龄会加速。综上所述,鼻细胞外基因组甲基化可以作为哮chuan、过敏和气道气道炎症的敏感生物标志物,以及这些表型的特异性生物学过程。传统观点认为真核基因组通常形成稳定的线性染色体。山东分析表观遗传组测序是什么

由此可见,由于其结构和表达的特异性,环状DNA可以影响细胞生命活动。云序表观遗传组测序价格

案例1:ctDNA羟甲基化可作为人类ai症诊断的分子标志物 期刊:Cell Research 影响因子:15 本篇文章的作者是复旦大学华山医院的刘杰教授课题组与芝加哥大学何川教授课题组合作通过检测不同ai症样本中ctDNA羟甲基化分布和水平。本文通过ctDNA羟甲基化检测技术,在全基因组范围内,检测ai症与健康人中ctDNA羟甲基化的水平。检测的ai症类型包括肠ai,胃ai,胰腺ai,肝ai,甲状腺ai,检测组织类型包括ai症及ai旁组织,血浆和白血球。结果发现,5hmC主要分布在基因组的转录活性区,可能与开放染色质和允许组蛋白修饰相关。同时,5hmC对特定ai症类型高敏感,如肠ai和胃ai。总的来说,ctDNA羟甲基化检测为日后通过血浆样本进行无创诊断奠定了良好的基础。云序表观遗传组测序价格

上海云序生物科技有限公司是一家上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的公司,致力于发展为创新务实、诚实可信的企业。云序生物深耕行业多年,始终以客户的需求为向导,为客户提供***的RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。云序生物继续坚定不移地走高质量发展道路,既要实现基本面稳定增长,又要聚焦关键领域,实现转型再突破。云序生物创始人李巍,始终关注客户,创新科技,竭诚为客户提供良好的服务。

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