案例1:小肠腺ai的特异性甲基化组图谱本文通过MeDIP测序研究了小鼠模型小肠腺ai起始过程中的甲基化变化,发现了13,000多个与小肠腺ai发生相关的差异甲基化区(DMRs)。进一步分析发现:组蛋白修饰复合物PRC2的靶基因在高甲基化DMRs中明显富集,说明组蛋白修饰与DNA甲基化密切相关。此外,在不同类型细胞中,通过重亚硫酸盐焦磷酸测序证实:这些DMRs是腺ai细胞中全新形成的,而不是通过小肠干细胞或未分化隐窝细胞中已有甲基化模式的扩展形成的。更为有趣的是,作者发现了一些DMRs,它们在小鼠腺ai和人类结肠ai间是保守的,并因此找到了一些在结肠ai中受表观遗传修饰的基因,揭示了甲基化修饰作为临床分子标志物的潜力。但新的研究表明:无论是在正常体细胞还是ai细胞中,都存在大量染色体外环状DNA。海南表观遗传组测序内容
而NGS技术能够检测基因突变。靶向深度测序和基于捕获物测序的方法可以在指定区域进行检测。重要的是,外显子血浆DNA分析开辟了一种新的机遇,即其可以描述突变组的特征,而不需要关注之前或者现在存在的突变。基于NGS的ctDNA全基因组测序,不仅可以发现染色体重组,易位等情况,其对tumsor标记物还具有敏感性和特异性。同时,在选定的情况下,基于NGS的ctDNA测序还能发现体细胞拷贝数的畸变。正是基于以上优势,NGS在ctDNA检测中,开始扮演越来越重要的角色。而基于NGS的ctDNA检测的效果,也在很多临床实验中得到了证实。辽宁修饰表观遗传组测序是什么目前,环状DNA不但可以作为一种新型特异的tumsour标志物。
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法,是新一代超微量ChIP-Seq技术,适用于无ChIP级别抗体的蛋白研究。与传统的ChIP-Seq研究方法相比,该技术无需交联、超声打断、末端抹平和接头连接等操作,因此具有省时高 效、所需的样品量少、背景信号低和可重复性好等优点,甚至可用于单细胞水平测序。CUT&Tag有望将蛋白质-DNA互作的研究变成一种类似PCR反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有**性的意义。
均一的双核苷酸分布由于“GC覆盖度偏误”的存在,在连续双核苷酸的检出效率方面,WGBS对于不同的双核苷酸存在较严重的偏误,而EM-seq则能展示出均一的覆盖情况。更强的匹配率和更低的重复率相比于WGBS,EM-seq测序结果与参考基因组的匹配率更高,同时重复率更低。用更少的测序检出更多的CpG岛同等测序覆盖深度的情形下,EM-seq所发现的CpG数目要远多于WGBS,在这其中有很大比例的CpG位点是只能能用EM-seq法才能检测到的。云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。云序生物质控流程严格,层层把关,为客户提供高准确度的结果。
人体血液循环系统中,含有不断流动的携带一定特征(包括突变,缺失,插入,重排,拷贝数异常,甲基化等)的,来自tumsor基因组的DNA的片段。这些DNA的片段来源于四个部分:1、坏死的tumsor细胞;2、凋亡的tumsor细胞;3、循环tumsor细胞;4、tumsor细胞分泌的外排体。自1977年人类发现ctDNA以来,对其的研究就从未中断过。在1994年,研究人员鉴定了来源于tumsor的含有cancer标志性突变的DNA。加上ctDNA的无创性和易获得性,在其中发现的tumsor标志物,被认为可以用于检测tumsor早期诊断,进展过程,预后判断及个性化用药指导。但是由于ctDNA在人体血液内含量极低,只有循环DNA的1%,甚至万分之一,其测序检测存在巨大的挑战。血清、血浆、体液样品,液氮速冻后-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。宁夏平台表观遗传组测序分子
为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。海南表观遗传组测序内容
技术优势一站式服务:客户只需提供血清血浆,云序生物为您完成环状DNA富集,甲基化位点转化,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。一箭双雕的结果:同时检测环状DNA及其甲基化状况,节约样品,性价比高。专业的生物信息学分析:专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法,且能单碱基分辨甲基化修饰位点,满足客户的各类深入数据分析需求。样本要求样品类型:血清血浆或其它体液样品样品量:血清血浆:>5mL样品运输及保存:EDTA抗凝,样品干冰运输。勿用肝素管取样(绿色盖子抗凝管)。海南表观遗传组测序内容
上海云序生物科技有限公司正式组建于2015-03-02,将通过提供以RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等服务于于一体的组合服务。旗下高通量测序,测序合成,科研,技术服务在商务服务行业拥有一定的地位,品牌价值持续增长,有望成为行业中的佼佼者。我们强化内部资源整合与业务协同,致力于RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等实现一体化,建立了成熟的RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体运营及风险管理体系,累积了丰富的商务服务行业管理经验,拥有一大批专业人才。值得一提的是,云序生物致力于为用户带去更为定向、专业的商务服务一体化解决方案,在有效降低用户成本的同时,更能凭借科学的技术让用户极大限度地挖掘高通量测序,测序合成,科研,技术服务的应用潜能。