安徽云序生物表观遗传组测序

技术优势 一站式服务： 客户只需提供血清血浆，云序生物为您完成环状DNA富集，甲基化位点转化，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。 一箭双雕的结果： 同时检测环状DNA及其甲基化状况，节约样品，性价比高。 专业的生物信息学分析： 专业的生物信息学团队，开发了高效识别分析环状DNA的算法，且能单碱基分辨甲基化修饰位点，满足客户的各类深入数据分析需求。 样本要求 样品类型： 血清血浆或其它体液样品 样品量： 血清血浆：>5 mL 样品运输及保存： EDTA抗凝，样品干冰运输。勿用肝素管取样（绿色盖子抗凝管）。后续进行文库构建与高通量测序，从而获得发生甲基化修饰的环状DNA。安徽云序生物表观遗传组测序

云序生物为您带来一种基于酶学方法的 DNA 甲基化测序技术 EM-seq（Enzymatic Methyl-seq），该方法结合使用多种酶，在保证 5mC 和 5hmC 在 Illumina 测序中仍被识别为 C 的前提条件下，将未发生修饰的胞嘧啶（C）转化为尿嘧啶（U），并在后续的扩增和测序过程中被识别为胸腺嘧啶（T）。EM-seq 有效弥补了 Bis-Seq 需要极端反应条件的缺陷，可以普遍应用于包含 ctDNA 在内的微量脆弱 DNA 样品。同时，EM-seq 得到的测序结果与 WGBS 得到的转化序列相同，因此可以使用相同的数据分析流程。运用 EM-seq 技术，需低至 10 ng 的 DNA 样品便可进行单碱基精度的全基因组 5mC 修饰测序。云南文章 表观遗传组测序内容近日，Nature杂志上发表了颠覆性研究成果：在tumsour中，主要的ai基因转录本是直接来自于环状DNA的。

cfDNA（Cell free DNA）是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中的降解的DNA小片段，是一种新型的分子标记物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指来源于tumsor细胞的cfDNA，是液体活检主流方向。 报道表明：ctDNA羟甲基化不但可以作为tumsor分子标志物，还可用于追溯tumsor细胞的组织来源。在医疗大趋势下，ctDNA羟甲基化检测既具有极高的科研价值，又具备推进医疗临床实践的巨大潜能，为实现tumsor临床医治的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA羟甲基化测序，凭一管液体就可以进行tumsor诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等，是里程碑式的新型液体活检技术。

全基因组重亚硫酸盐测序法（Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS）一度是 DNA 5mC 测序的金标，可以将未经化学修饰的胞嘧啶（C）转化为尿嘧啶（U），并在后续的扩增和测序过程中被读取为胸腺嘧啶（T），同时保持甲基化修饰的 5mC 和羟甲基化修饰的 5hmC 在测序中仍被读取为 C。然而，WGBS 法需要极端的温度和化学环境，容易造成 DNA 的断裂降解；并且，WGBS 法对未经化学修饰的胞嘧啶（C）具有高比例的破坏力，致使 GC 富集区相比于 AT 富集区更容易丢失，在测序文库中造成“GC 覆盖度偏误”。 由于 ctDNA 含量低、稳定性差，若采用 WGBS 法对 ctDNA 进行 5mC 测序，将会难以避免地带来很多负面影响： 经化学处理后所得的 DNA 总量低，难以满足测序文库所需的量； DNA 丢失严重，覆盖度低，容易造成测序缺口（gap）； GC 检测覆盖程度不均一，未能反应真实情况。该技术可以同时检测环状DNA和环状DNA的甲基化修饰状态。

案例1：ctDNA羟甲基化可作为人类ai症诊断的分子标志物 期刊：Cell Research 影响因子：15 本篇文章的作者是复旦大学华山医院的刘杰教授课题组与芝加哥大学何川教授课题组合作通过检测不同ai症样本中ctDNA羟甲基化分布和水平。本文通过ctDNA羟甲基化检测技术，在全基因组范围内，检测ai症与健康人中ctDNA羟甲基化的水平。检测的ai症类型包括肠ai，胃ai，胰腺ai，肝ai，甲状腺ai，检测组织类型包括ai症及ai旁组织，血浆和白血球。结果发现，5hmC主要分布在基因组的转录活性区，可能与开放染色质和允许组蛋白修饰相关。同时，5hmC对特定ai症类型高敏感，如肠ai和胃ai。总的来说，ctDNA羟甲基化检测为日后通过血浆样本进行无创诊断奠定了良好的基础。并揭示了孕妇血浆中的胎儿环状DNA甲基化状况。山东平台表观遗传组测序分析

而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。安徽云序生物表观遗传组测序

在过去十年中，对非小细胞肺ai（NSCLC）的理解发生了重要的变化。现在证实，NSCLC具有不同的分子亚型。现在医生认为，针对NSCLC的个性化医治，应该是利用这些分子亚型匹配相对应的靶向疗法。表皮生长因子（EGFR）突变和ALK易位被认为是NSCLC医治很有效的靶点。但是EGFR和ALK的突变数量是多种多样的，并且我们检测到的突变类型还在不断地增加。因此，现代科学家们利用基于NGS的ctDNA技术，从患者血液中可以获得ROS1，BRAF，KRAS，HER2-，c-MET，RET，PIK3CA，FGFR1和DDR2的突变信息，从而利用这些突变信息为患者选择合适的靶向疗法。安徽云序生物表观遗传组测序

上海云序生物科技有限公司是一家上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立，坐落于上海漕河泾新兴技术开发区，专注于表观修饰以及转录组领域，依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术，集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的公司，是一家集研发、设计、生产和销售为一体的专业化公司。云序生物深耕行业多年，始终以客户的需求为向导，为客户提供***的RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体。云序生物不断开拓创新，追求出色，以技术为先导，以产品为平台，以应用为重点，以服务为保证，不断为客户创造更高价值，提供更优服务。云序生物创始人李巍，始终关注客户，创新科技，竭诚为客户提供良好的服务。