技术简介 DNA甲基化能控制基因表达,因而在动植物的生长发育过程中发挥着关键的调控作用,并且与包括ai症在内的多种人类疾病密切相关,是表观遗传学研究的热点。 云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。配合强大的生信分析实力,我们提供的不仅是海量的测序数据,而且是根据您的研究目的,有针对性地挖掘提炼出取之即可用的结果及出版级图片。且能单碱基分辨甲基化修饰位点,满足客户的各类深入数据分析需求。陕西修饰表观遗传组测序价格
案例1:ctDNA羟甲基化可作为人类ai症诊断的分子标志物 期刊:Cell Research 影响因子:15 本篇文章的作者是复旦大学华山医院的刘杰教授课题组与芝加哥大学何川教授课题组合作通过检测不同ai症样本中ctDNA羟甲基化分布和水平。本文通过ctDNA羟甲基化检测技术,在全基因组范围内,检测ai症与健康人中ctDNA羟甲基化的水平。检测的ai症类型包括肠ai,胃ai,胰腺ai,肝ai,甲状腺ai,检测组织类型包括ai症及ai旁组织,血浆和白血球。结果发现,5hmC主要分布在基因组的转录活性区,可能与开放染色质和允许组蛋白修饰相关。同时,5hmC对特定ai症类型高敏感,如肠ai和胃ai。总的来说,ctDNA羟甲基化检测为日后通过血浆样本进行无创诊断奠定了良好的基础。河南项目表观遗传组测序分析目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA。
ctDNA/cfDNA 之所以引起学界这么大的研究热情,与其在临床上广阔的应用前景是分不开的。相比于目前tumsor诊断当中普遍使用的组织活检,ctDNA 测序对患者的伤害小,且可以多次、实时地进行提取检测,在临床运用上具有极大的优势,有助于ai症的早发现、早医治,被誉为“液体切片活检”。ctDNA 的甲基化检测,同时结合了 ctDNA 测序于 DNA 甲基化测序的优势,在ai症检测方面提供更好的特异性和灵敏度。在 2021 年,已有 ctDNA/cfDNA 甲基化测序相关的商业化产品面市
案例1:小肠腺ai的特异性甲基化组图谱 本文通过MeDIP测序研究了小鼠模型小肠腺ai起始过程中的甲基化变化,发现了13,000多个与小肠腺ai发生相关的差异甲基化区(DMRs)。进一步分析发现:组蛋白修饰复合物PRC2的靶基因在高甲基化DMRs中明显富集,说明组蛋白修饰与DNA甲基化密切相关。此外,在不同类型细胞中,通过重亚硫 酸盐焦磷酸测序证实:这些DMRs是腺ai细胞中全新形成的,而不是通过小肠干细胞或未分化隐窝细胞中已有甲基化模式的扩展形成的。更为有趣的是,作者发现了一些DMRs,它们在小鼠腺ai和人类结肠ai间是保守的,并因此找到了一些在结肠ai中受表观遗传修饰的基因,揭示了甲基化修饰作为临床分子标志物的潜力。客户只需提供血清血浆,云序生物为您完成环状DNA富集,甲基化位点转化。
案例2:解析转录因子结合 原文:Cell-type specific and combinatorial usage of diverse transcription factors revealed by genome-wide binding studies in multiple human cells 期刊:Genome Research 影响因子:10.10 本文通过ChIP测序系统性地调查了11种不同类型人类细胞中3种转录因子(CTCF、RNAPII和MYC)与基因组的结合情况。结果表明:CTCF主要结合在基因间区,而RNAPII和MYC则偏向于结合在启动子区。CTCF结合位点在不同类型细胞中往往没有多大变化,而MYC的结合则呈现强烈的细胞特异性。MYC和RNAPII在很多区域共定位,并具有很多共同的靶基因。此外,通过整合转录组测序数据发现:转录因子结合与潜在靶基因的表达正相关,多个转录因子的组合结合,尤其是MYC和RNAPII的同时结合与基因高表达有着很强的关联性。云序生物率先推出ctDNA甲基化测序服务,需1ng ctDNA既可进行测序。黑龙江云序生物表观遗传组测序文章
作者还发现血浆中的胎儿 环状DNA 与母体 环状DNA 相比甲基化程度相对较低。陕西修饰表观遗传组测序价格
1)样品类型:tumsor患者的血浆、血清或 cfDNA。 血浆和血清相比较而言,推荐使用血浆,以减少淋巴细胞来源的 cfDNA 干扰。 2)样品量:血浆>5mL;血清>10mL;cfDNA>10 ng。 3)血浆提取: 使用 EDTA 抗凝管收集全血,切勿冷冻保存,只能在 2-8℃ 冰箱短暂存放,并尽快进行低温离心获取血浆。 若不能进行低温离心,则需要使用添加专有稳定剂的 STRECK 无创管来保存全血,可在常温条件下离心。 为了消除残留的细胞,血浆需要进行二次离心:first在 4℃ 条件下以 1600g 离心 10 分钟;第二次在 4℃ 条件下以 16000g 离心 10 分钟。 4)样品保存:血浆、血清样品液氮速冻后 -80℃ 冰箱保存。样品保存期间避免反复冻融。 5)样品运输:封口膜封好样品,干冰运输。陕西修饰表观遗传组测序价格
上海云序生物科技有限公司是一家上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的公司,致力于发展为创新务实、诚实可信的企业。云序生物拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队,以高度的专注和执着为客户提供RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。云序生物始终以本分踏实的精神和必胜的信念,影响并带动团队取得成功。云序生物始终关注自身,在风云变化的时代,对自身的建设毫不懈怠,高度的专注与执着使云序生物在行业的从容而自信。