优势一:一站式服务。客户只需提供样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 优势二:超微量ctDNA 起始量要求。云序生物可以进行低至 10 ng 的 ctDNA 测序。 优势三:测序数据真实可靠。云序生物避免了传统 5mC 检测方法的 GC 覆盖度偏误,还拥有更完整的 DNA 读长,文库质量更加可靠。 优势四:严格质控流程:云序生物质控流程严格,层层把关,为客户提供高准确度的结果。 优势五:专业化生物信息分析:云序生物强大生物信息团队,满足客户个性化数据分析要求。云序生物环状DNA甲基化测序技术基于转座酶和m5C位点酶学转化方法。广西云序生物表观遗传组测序文章
为了研究 DPI,科学家发明了很多方法:凝胶阻滞、DNaseI 足迹实验、甲基化干扰、体内足迹、酵母单杂、ChIP-Seq 等。其中 ChIP-Seq 因其能真实、完整地反映结合在 DNA 序列上的靶蛋白,是目前全基因组水平研究 DPI 的标准实验技术。 ChIP-Seq 的基本过程包括甲醛交联将细胞内与 DNA 结合的蛋白固定,再裂解细胞,超声断裂 DNA,将 DNA-蛋白质复合物结合在特异性抗体上,再用可以结合抗体的 ProteinA 磁珠将抗体-蛋白-DNA 复合物抓取下来,之后将 DNA 与蛋白解离,将 DNA的片段补平,加 A,加接头,进行高通量测序。 然而,由于 ChIP-Seq 实验过程中的甲醛交联、染色质片段化、免疫共沉淀以及文库构建等步骤繁琐且条件难以控制,常规 ChIP-Seq 实验需要大量细胞,且实验重复性差、信噪比低。中国台湾平台表观遗传组测序内容cfDNA是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中的降解的DNA小片段。
技术简介 DNA甲基化能控制基因表达,因而在动植物的生长发育过程中发挥着关键的调控作用,并且与包括ai症在内的多种人类疾病密切相关,是表观遗传学研究的热点。 云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。配合强大的生信分析实力,我们提供的不仅是海量的测序数据,而且是根据您的研究目的,有针对性地挖掘提炼出取之即可用的结果及出版级图片。
云序优势 单碱基分辨 分辨率高,可以直接检测到发生甲基化的确切位点。 覆盖范围广: 检测>850,000个 CpG 位点,覆盖CpG岛、启动子、编码区、开放染色质和增强子等。 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或基因组DNA,云序生物为您完成从DNA富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 严格的质控: 云序生物对805K芯片测序实验的各个关键步骤进行严格的质控,全程监控实验质量,确保客户得到优zhi的数据。 专业的生物信息学分析 专业的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求。通过转座酶打开环状DNA的环形结构,并在DNA的片段的两端加上接头。
案例:hMeDIP-seq揭示了心机细胞发育与肥大过程中的基因表达与5hmC有关 DNA hydroxymethylation controls cardiomyocyte gene expression in development and hypertrophy[J].Greco C M, Kunderfranco P, Rubino M, et al . Nature Communications, 2016, 7:12418. 5-hmC(DNA羟甲基化)在基因体上富集能够激huo基因的转录调控,但对启动子和远端调节区的功能不太清楚。本文主要是以不同发育时间点和心肌肥大的心肌细胞为实验载体,主要剖析5-hmC在心肌细胞(CMC)基因组中的分布,并揭示了5-hmC在心脏发育和疾病中的作用机制。1)通过DNA羟甲基化测序,作者发现在心脏发育过程中,CMCs中的5-hmC在基因间区域逐渐减少,并向GB上富集(图1)。2)通过DNA羟甲基化和转录组关联分析,作者得出5-hmC是CMCs发育和肥大过程中的重要调控因子(图2)。作者还发现血浆中的胎儿 环状DNA 与母体 环状DNA 相比甲基化程度相对较低。海南修饰表观遗传组测序分析
而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。广西云序生物表观遗传组测序文章
CUT&Tag 是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法,相较于传统的 ChIP-Seq 具有以下优点:省时高效、所需的细胞量少、背景信号低、可重复性好等优点,甚至可用于单细胞水平测序。CUT&Tag 有望将蛋白与染色质 DNA 互相作用的研究变成了一种类似 PCR 反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有**性的意义。 在生物学研究中,DNA 与蛋白质之间的相互作用(DNA-Protein Interaction, DPI)是至关重要的,基因的表达、调控、复制、重组和修复,RNA的转运、翻译和调控,都离不开 DPI,几乎所有的生命活动都会涉及 DPI。广西云序生物表观遗传组测序文章
上海云序生物科技有限公司是一家上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的公司,是一家集研发、设计、生产和销售为一体的专业化公司。云序生物作为上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的企业之一,为客户提供良好的RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。云序生物始终以本分踏实的精神和必胜的信念,影响并带动团队取得成功。云序生物始终关注自身,在风云变化的时代,对自身的建设毫不懈怠,高度的专注与执着使云序生物在行业的从容而自信。