江苏环状DNA介绍

染色体外环状DNA(EccDNA)是指起源于染色体的环状DNA，但一旦产生，这些DNA很可能独li于染色体DNA。1964年Alix Bassel和Yasuo Hoota首先发现了位于细胞核内的eccDNA，被称为双分钟(Dms)。Eccdnabest初是通过核型鉴定为独li于染色体存在于ai细胞中的dna，但由于技术的进步，特别是下一代测序和生物信息学的进步，eccna已经成为一种新的分子，其众多的特征和功能被发现。 EccDNA的长度足以容纳它们自己的复制起点，能够编码氨基酸，并且已经在tumour组织中观察到，在ai症医治中，它们best常含有ai基因或与耐药相关的基因。EccDNA的其他功能，如在衰老和异质性中的功能，以及可能的作用，包括剂量补偿，已经逐渐被发现。已知ai细胞内的基因型多样性和基因组可塑性受到基因组不稳定和基因组改变的影响。EccDNA可以通过其多样性（包括结构，功能和数量多样性）快速重塑基因组，从而有效地推动ai症和生命的进化。eccDNA,DNA检测利器，云序生物为您提供一站式服务。江苏环状DNA介绍

研究组织、细胞的环状DNA测序常用Circle-seq技术，Circle-seq测序中就包含柱纯化去除线性DNA，具体步骤是柱纯化去除基因组DNA、外切酶对柱纯化后产物进行酶消化、滚环扩增放大环状DNA信号以及best后建库测序。因此，相对于大量存在的基因组DNA，环状DNA在细胞中的含量非常少，所以从样品中提取总DNA后，第一步需要通过柱纯化去除基因组DNA，以免测序中基因组DNA占据大部分数据量。柱纯化这一步骤十分关键，既要best大限度地去除基因组DNA, 又需best大限度保留环状DNA分子，尤其是避免丢失掉超长和超短的环状DNA。西藏环状DNA文章测序后首先可以得到一个详尽的环状DNA注释表格。

环状DNA具有线性DNA不具备的动力学和拓扑学特点,因此环状DNA作为DNA纳米技术的重要组成部分被人们很大关注。Zheng等[4]以单链环状DNA为基本单元成功制备了DNA纳米管结构;多个课题组以单链环状DNA为原料,制备了2个或多个DNA环相互穿套的连环结构(Catenane),并将其制备成可控的分子开关或分子机器等。相对于线性DNA,环状DNA不易被核酸外切酶降解,在溶液中单一分散、不易聚合,这些特性决定了其在药物运输、基因调控、疾病诊断和基因医治等领域的应用更具优越性。

案例1：母体血浆中染色体外环状DNA的鉴定与特性分析 作者观察到在孕妇的血浆中存在染色体外环状DNA (环状DNA)，并通过限制性内切酶和Tn5转座酶处理后的改良的测序方法，在孕妇的血浆中鉴定出了环状DNA分子。他们发现血浆的环状DNA分子比线性的长，在这些环状DNA分子中，胎儿来源的环状DNA短于母体来源的环状DNA。此外，环状DNA的闭合圆形结构可能允许抗外切酶，因此这些分子比它们的线性对应物具有更高的稳定性。这些特性为环状DNA的研究和生物标志物的开发提供了机会。专业的生物信息学团队，开发了高效识别分析环状DNA的算法，满足客户的各类深入数据分析需求。

为了寻找eccDNA基因组来源，研究者选用了非ai细胞系mESC作为研究对象，以确保正常的基因组状态。随后，采用前述的方法分离纯化了高纯度的eccDNA，并采用平行的两种不同方法（滚环扩增+单分子纳米孔测序、Tn5转座酶片段化后PCR扩增+illumina高通量测序）对eccDNA进行了测序，两种方法均发现，eccDNA的来源序列普遍分布于整个基因组上，在各条常染色体上表现出高度均匀分布特征。云序生物是国内best早提供eccDNA测序服务的公司，云序在2018年已就启动了组织细胞eccDNA测序服务的开发，环状RNA CDR1as破坏p53/MDM2复合体，抑制胶质瘤的形成。黑龙江云序环状DNA研究

母系来源的eccDNA比胚胎来源的eccDNA分子长度也更长。江苏环状DNA介绍

云序eccDNA测序优势一站式服务客户只需提供细胞、组织或基因组DNA，云序生物为您完成从eccDNA富集，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。eccDNA检出率高采用多种方法高效地富集eccDNA，eccDNA检出率高。专业的生物信息学分析专业的生物信息学团队，开发了高效识别分析eccDNA的算法，满足客户的各类深入数据分析需求。样本要求样品类型：细胞、组织、基因组DNA。其它类型样品请详询。样品量：a）细胞2×107b）组织100mgc）DNA：每个样品总量不少于10ug，溶于无菌水或TE（PH=8）（OD260/280值应在1.7～2.0之间；RNA应该去除干净；不得有其它个体或其它物种的DNA污染）。样品运输及保存：样品运输：样品置于1.5mLEppendorf管中，封口膜封好，干冰运输，DNA可用冰袋运输。样品保存：细胞样品或新鲜组织块切块，液氮冻存后-80℃保存；DNA样品短期内可-20℃，避免反复冻融。江苏环状DNA介绍

上海云序生物科技有限公司成立于2015-03-02，同时启动了以高通量测序，测序合成，科研，技术服务为主的RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体产业布局。是具有一定实力的商务服务企业之一，主要提供RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体等领域内的产品或服务。同时，企业针对用户，在RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体等几大领域，提供更多、更丰富的商务服务产品，进一步为全国更多单位和企业提供更具针对性的商务服务服务。上海云序生物科技有限公司业务范围涉及上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立，坐落于上海漕河泾新兴技术开发区，专注于表观修饰以及转录组领域，依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术，集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。等多个环节，在国内商务服务行业拥有综合优势。在RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体等领域完成了众多可靠项目。