样品类型:组织、细胞、血清血浆或DNA样品。样品量:a)细胞:2×107b)组织:200mgc)血清血浆:5mLd)DNA:>=10µg,溶于无菌水或TE(PH=8)(OD260/280值应在1.7~2.0之间;RNA应该去除干净;不得有其它个体或其它物种的DNA污染)。样品运输及保存:样品运输:样品置于1.5mLEppendorf管中,封口膜封好,干冰运输,DNA可用冰袋运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块切块,液氮冻存后-80℃保存;DNA样品短期内可-20℃,避免反复冻融。环状DNA是一种生物界普遍存在的DNA形式。云南环状DNA文章
样本要求样品类型:细胞、组织、基因组DNA。其它类型样品请详询。样品量:a)细胞2×107b)组织200mgc)DNA:>=10µg,溶于无菌水或TE(PH=8)(OD260/280值应在1.7~2.0之间;RNA应该去除干净;不得有其它个体或其它物种的DNA污染)。样品运输及保存:样品运输:样品置于1.5mLEppendorf管中,封口膜封好,干冰运输,DNA可用冰袋运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块切块,液氮冻存后-80℃保存;DNA样品短期内可-20℃,避免反复冻融。技术环状DNA介绍目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA, 而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。
eccDNA以颠覆传统认知的方式重新走到科研舞台的中心,必将在未来的一段时间掀起一场有关基因扩增、转录的大讨论。我们已经习惯了观察基因的缺失、突变、插入和移位,eccDNA的产生从新的角度让科研工作者去思考基因组存在的动态性和多样性。由此,tumour的异质性、tumour微环境、液体活检和耐药性等相关研究必定会围绕eccDNA展开更多集中式的研究和探索,有理由相信这次2019年年末的Nature和Cell文章的发表将成为里程碑式的作品,推动未来三到五年内有关eccDNA研究的新方向。
云序生物是国内best早提供eccDNA测序服务的公司,云序在2018年已就启动了组织细胞eccDNA测序服务的开发,随后又在国内first发血清血浆环状DNA测序服务。迄今为止,我们已经完成上千例样品的eccDNA测序,积累了丰富的项目经验,样品类型涵盖:组织﹑细胞﹑血清﹑血浆﹑尿液等,物种涵盖:人﹑小鼠﹑大鼠﹑拟南芥﹑果蝇﹑酵母﹑非洲爪蟾等。云序生物采用A&ABiotechnology公司的环状DNA纯化柱,是绝大部分环状DNA高分文章中所使用的纯化柱,并且云序生物是该品牌在国内的总代理。今年,云序生物又在港中大教授卢煜明(Y.M.DennisLo)发表的Tn5转座酶法的基础上,在全国范围内率先推出了血清血浆eccDNA甲基化测序服务。云序组织细胞环状DNA测序服务,采用多种方法高效地富集和扩增环状DNA,极大地提高了环状DNA的检出率。
目前已经报道的基于高通量测序方法研究eccDNA的报道都是基于PaulS.Mischel团队开发的AmpliconArchitect软件,基于二代全基因组测序数据(5-10X覆盖深度),该软件可自动比对基因组,寻找断点信息,并结合SV和CNV的分析结果生成eccDNA的分析结果。不过需要注意的是,目前该软件的license是收费的。不过还可以考虑通过提取环状DNA和滚环扩增的方式获得eccDNA,并进行后续的测序和组装,这时候相对于对软件依赖的限制就相对较小了,但是对于线性DNA背景的排除依然是个问题,在基因组DNA的提取、扩增、质控及后续分析方面还需要诸多探索。但新的研究表明:无论是在正常体细胞还是ai细胞中,都存在大量染色体外环状DNA。青海文章 环状DNA
可以预见的是,环状DNA将迅速成为新的科研热点,甚至会对传统遗传学和基因组学带来**性影响。云南环状DNA文章
就DNA损伤修复而言,研究发现致ai物会提高eccDNA的水平,同时一些特异的DNA损伤修复蛋白是eccDNA形成所必需的,但是还有一些是非必需的。best后,虽然我们在上述eccDNA推测的形成机制中提到的大多是与DNA复制有关的,但事实上,不发生DNA复制的情况下,eccDNA也可以存在。所以说,eccDNA的形成并不是一个简单过程,而是可能由多种因子,多种蛋白,并且有一个复杂的调控机制参与的过程,具有很重要的生物学功能。云序生物是国内best早提供eccDNA测序服务的公司,云序在2018年已就启动了组织细胞eccDNA测序服务的开发。云南环状DNA文章
上海云序生物科技有限公司是以提供RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体内的多项综合服务,为消费者多方位提供RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体,公司位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2,成立于2015-03-02,迄今已经成长为商务服务行业内同类型企业的佼佼者。公司主要提供上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。等领域内的业务,产品满意,服务可高,能够满足多方位人群或公司的需要。云序生物将以精良的技术、优异的产品性能和完善的售后服务,满足国内外广大客户的需求。