CUT&Tag技术的基本原理为:在抗体引导下,ChiTag酶在目的组蛋白修饰标志、或转录因子、或染色质调控蛋白结合染色质的局部进行目的DNA的片段化,同时添加测序接头,并释放到细胞外,而绝大部分无关的染色质还留在细胞核内,因而整个实验的信噪比大幅提高,同时简化了实验步骤。该方法可一管式高通量应用,并可与单细胞测序平台"无缝"结合。ChiTag酶在打断基因组的同时加上接头,不需要繁琐的补平加A加接头,在一个工作日内可以完成从细胞到测序文库制备全流程。并揭示了孕妇血浆中的胎儿环状DNA甲基化状况。中国澳门修饰表观遗传组测序研究
技术简介DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine,5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,一种新的DNA甲基化修饰类型—DNA-6mA甲基化已经成为表观遗传学领域的研究热点。云序生物率先开发了DNA-6mA测序技术—6mA-IP-seq。其原理类似于MeDIP的免疫共沉淀测序技术,利用特异性抗体富集6mA的片段,扩增后进行高通量测序及甲基化分析,以较小的数据量,快速地绘制全基因组DNA甲基化水平的图谱。吉林云序生物表观遗传组测序案例还在tumsour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。
案例2:良性和恶性外周神经鞘膜瘤的比较甲基化组分析 Feber, A., G. A. Wilson, et al. "Comparative methylome analysis of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors." Genome Res 21(4): 515-24. MeDIP测序可以对基因组中的甲基化区进行无偏差的分析,而不只局限于基因启动子和CpG岛。本文通过MeDIP测序对恶性外周神经鞘膜瘤、良性神经纤维瘤和正常雪旺细胞中的甲基化组进行了比较分析,找到了101,466个ai症特异性差异甲基化区(cDMRs)。数据表明:这些cDMRs在两类卫星重复序列(SATR1 和ARL a)中明显富集;此外,高甲基化cDMRs在CpG岛岸、非CpG岛相关启动子中明显富集,而低甲基化cDMRs在SINE重复序列中明显富集。通过与基因表达数据的联合分析发现:与CpG岛岸cDMRs相关的基因的表达模式可以区分疾病表型。
云序优势单碱基分辨分辨率高,可以直接检测到发生甲基化的确切位点。覆盖范围广:检测>850,000个CpG位点,覆盖CpG岛、启动子、编码区、开放染色质和增强子等。一站式服务:客户只需提供细胞、组织或基因组DNA,云序生物为您完成从DNA富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。严格的质控:云序生物对805K芯片测序实验的各个关键步骤进行严格的质控,全程监控实验质量,确保客户得到优zhi的数据。专业的生物信息学分析专业的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求。ai症组中ctDNA甲基化水平与正常组差异明显。
技术优势一站式服务:客户只需提供样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。特异性富集ctDNA的片段:云序生物具有丰富样本处理经验,采用ctDNA提取试剂盒,富集效率高。严格质控流程:云序生物质控流程严格,层层把关,为客户提供高准确度的结果。专业化生物信息分析:云序生物强大生物信息团队,满足客户个性化数据分析要求。样本要求1)样品类型:血清、血浆、体液等。其他样本类型请详询。2)样品量:血清,血浆:≥5mL;体液:请详询。3)样品保存:血清、血浆、体液样品,可用液氮速冻后-80℃保存,样品保存期间避免反复冻融。4)样品运输:样品置于1.5mL管中,封口膜封好,干冰运输。由此可见,由于其结构和表达的特异性,环状DNA可以影响细胞生命活动。河北技术表观遗传组测序平台
目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA, 而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。中国澳门修饰表观遗传组测序研究
在过去十年中,对非小细胞肺ai(NSCLC)的理解发生了重要的变化。现在证实,NSCLC具有不同的分子亚型。现在医生认为,针对NSCLC的个性化医治,应该是利用这些分子亚型匹配相对应的靶向疗法。表皮生长因子(EGFR)突变和ALK易位被认为是NSCLC医治很有效的靶点。但是EGFR和ALK的突变数量是多种多样的,并且我们检测到的突变类型还在不断地增加。因此,现代科学家们利用基于NGS的ctDNA技术,从患者血液中可以获得ROS1,BRAF,KRAS,HER2-,c-MET,RET,PIK3CA,FGFR1和DDR2的突变信息,从而利用这些突变信息为患者选择合适的靶向疗法。中国澳门修饰表观遗传组测序研究
上海云序生物科技有限公司公司是一家专门从事RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体产品的生产和销售,是一家服务型企业,公司成立于2015-03-02,位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2。多年来为国内各行业用户提供各种产品支持。在孜孜不倦的奋斗下,公司产品业务越来越广。目前主要经营有RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等产品,并多次以商务服务行业标准、客户需求定制多款多元化的产品。高通量测序,测序合成,科研,技术服务为用户提供真诚、贴心的售前、售后服务,产品价格实惠。公司秉承为社会做贡献、为用户做服务的经营理念,致力向社会和用户提供满意的产品和服务。上海云序生物科技有限公司以市场为导向,以创新为动力。不断提升管理水平及RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体产品质量。本公司以良好的商品品质、诚信的经营理念期待您的到来!