江西测序结果

m6A环状RNA测序:近年来，科学家们发现了一种可逆的RNA甲基化—m6A，即RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上的甲基化修饰（N6-methyladenosine，m6A）。研究发现，m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰， m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译，在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。 目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术，云序生物提供成熟m6A RNA甲基化MeRIP-seq服务，技术原理如下： 将甲基化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序。云序生物利用启动子区(TSS-2000-TSS+2000)差异富集峰对应的基因进行GO功能分析。江西测序结果

案例1：全外显子测序在ai症研究中的应用 胰腺导管腺ai(PDA)的预后非常差，因此对其病原学的研究以及靶向干预医治非常必要。本文对109个显微切割的PDA组织样品进行了全外显子测序。研究表明：环境压力以及DNA修复基因的改变与不同的突变谱有关联。许多ai基因/抑ai基因位点发生了拷贝数变化，但只有MYC基因拷贝数扩增与比较差的预后以及腺鳞ai亚型相关。此外，作者还在PDA中发现了多个新的突变基因，其中一些与预后相关。RBM10突变往往预示着较长的生存期。90%以上的样品中发生了KRAS的突变，但只有密码子Q61的等位突变与较长的生存期相关。此外，Wnt信号通路，染色质重塑信号通路，Hedgehog信号通路，DNA修复和细胞周期相关的基因也被发现有较高的突变频率。这些数据表明了不同PDA样品的基因组多样性，并且找到了一些与预后相关的基因以及医治靶点。广西平台测序云序生物mRNA测序服务针对不同样品类型采用差异化的技术策略。

案例1：拟南芥花叶根组织m6A RNA甲基化谱 原文：Transcriptome-wide high-throughput deep m6 A-seq reveals unique differential m6 A methylation patterns between three organs in Arabidopsis thaliana 期刊：Genome Biology 影响因子：13.21 西北农林科技大学联合中科院和普渡大学，借助m6A RNA甲基化测序技术，对比拟南芥花，叶，根组织中（每种组织有两个生物学重复）m6A RNA甲基化情况。结果发现检测组织中m6A RNA甲基化修饰程度比人类高10%左右，占转录组的83%。

案例1：母体血浆中染色体外环状DNA的鉴定与特性分析 原文：Identification and characterization of extrachromosomal circular DNA in maternal plasm 期刊：Proc Natl Acad Sci 影响因子：11.201 作者观察到在孕妇的血浆中存在染色体外环状DNA (环状DNA)，并通过限制性内切酶和Tn5转座酶处理后的改良的测序方法，在孕妇的血浆中鉴定出了环状DNA分子。他们发现血浆的环状DNA分子比线性的长，在这些环状DNA分子中，胎儿来源的环状DNA短于母体来源的环状DNA。此外，环状DNA的闭合圆形结构可能允许抗外切酶，因此这些分子比它们的线性对应物具有更高的稳定性。这些特性为环状DNA的研究和生物标志物的开发提供了机会。m1A 环状RNA测序，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术。

样本要求 样品类型 细胞、组织或RNA，其他样本类型请电询。 测序样品量 1.单碱基测序方式： a) 细胞：≥1×108 b) 组织：500 mg - 5 g c) RNA：100 μg - 300 μg 2. MeRIP测序方式： a) 细胞：≥2×107 b) 组织：100mg - 1g c) RNA：30 μg - 300 μg d) 超微量满足500 ng - 30 μg 样品运输及保存 样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。 样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存；RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。云序优势 适用于任何物种：可以检测几乎任何动植物的环状RNA。中国台湾遗传测序

云序生物提供一站式环状RNA实时定量PCR技术服务。江西测序结果

案例1：m5C RNA甲基化调控mRNA出核新机制 原文：5-methylcytosine promotes mRNA export — NSUN2 as the methyltransferase and ALYREF as an m5C reader 期刊：Cell Research 影响因子：15.60 中科院汪海林等研究团队揭示了m5C修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。研究人员建立了改进的RNA m5C单碱基分辨率高通量测序与生物信息分析技术，以此揭示mRNA m5C的分布规律，并绘制了精细的m5C修饰图谱，发现m5C在mRNA的翻译起始位点下游有明显富集，并且主要分布于CG富集区域。通过分析对比人和小鼠不同组织，发现m5C在mRNA上的分布特征在哺乳动物中十分保守，而在不同组织中修饰的基因具有特异性。研究团队同时发现，在小鼠睾丸发育过程中，动态的m5C修饰基因明显富集于精子发育相关功能，提示m5C修饰参与生殖发育调控。江西测序结果