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案例1:孕妇血浆中胎儿环状DNA的特征是:呈甲基化状态原文:CharacteristicsofFetalExtrachromosomalCircularDNAinMaternalPlasma:MethylationStatusandClearance期刊:ClinicalChemistry影响因子:8.322近期,NIPT之父卢煜明教授团队开发了一种环状DNA甲基化分析的测序方案,通过对不同产后时间点的胎儿环状DNA含量的评估,研究了胎儿环状DNA的体外clear效率。作者还发现血浆中的胎儿环状DNA与母体环状DNA相比甲基化程度相对较低。此外,和胎儿线性DNA类似,胎儿环状DNA在分娩后从母血中迅速clear。总之,该团队基于转座酶和m5C位点酶学转化方法开发出了环状DNA甲基化测序技术,并揭示了孕妇血浆中的胎儿环状DNA甲基化状况,为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。环状RNA的表达具有组织和疾病特异性,与组织发育、疾病的发生和发展密切相关。北京云序测序lncRNA

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云序生物提供两种m7GRNA甲基化测序服务:(1)m7GRNA甲基化单碱基测序,可对m7G修饰进行高通量检测和单碱基定位;(2)MeRIP测序,可通过m7G特异性抗体,抓取有甲基化修饰的片段进行测序,对m7G修饰进行高通量测序和peak峰定位。此外,云序生物针对m7GRNA甲基化开发了多款产品,可实现对mRNA、LncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G甲基化修饰水平的全多方面检测。目前,环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物,还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。湖北修饰测序云序生物可进一步提供高精度的O8G氧化图谱。

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m6ALncRNA测序:案例上的m6A甲基化影响细胞分化原文:N6-MethyladenosinemodificationoflincRNA1281iscriticallyrequiredformESCdifferentiationpotential期刊:NucleicAcidsResearch影响因子:11.56同济大学康九红团队研究发现在mESC细胞中,甲基化转移酶Mettl3能够调控lincRNA1281发生甲基化,并且与干细胞分化能力直接相关。揭示此过程主要发生在胞浆,且由let-7能够竞争性结合linc1281,从而降低其表达量,从机制上解释了m6A在不影响到表达水平的情况下如何影响生物学功能的问题。

案例1:拟南芥花叶根组织m6A RNA甲基化谱 原文:Transcriptome-wide high-throughput deep m6 A-seq reveals unique differential m6 A methylation patterns between three organs in Arabidopsis thaliana 期刊:Genome Biology 影响因子:13.21 西北农林科技大学联合中科院和普渡大学,借助m6A RNA甲基化测序技术,对比拟南芥花,叶,根组织中(每种组织有两个生物学重复)m6A RNA甲基化情况。结果发现检测组织中m6A RNA甲基化修饰程度比人类高10%左右,占转录组的83%。环状DNA是从染色体上断裂、环化或者额外复制产生的序列。

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云序优势一站式服务:客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。优化的实验流程:MeRIP的富集效率是决定数据质量的关键,云序生物MeRIP实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程,具有极高的效率和特异性。严格的质控:云序生物对MeRIP实验的各个关键步骤进行严格的质控,全程监控实验质量,确保客户得到优zhi的数据。专业的生物信息学分析:云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求。特异性高:通过抗体特异性富集发生甲基化修饰的RNA的片段,以较低的成本实现转录组范围的RNA甲基化研究。云序生物提供一站式环状RNA实时定量PCR技术服务。遗传测序microRNA甲基化

云序生物专注做测序服务,PCR,质谱检测。北京云序测序lncRNA

样本要求 样品类型: 细胞、组织、基因组DNA。其它类型样品请详询。 样品量: a)细胞 2×107 b)组织 200 mg c)DNA:>=10 µg,溶于无菌水或 TE(PH = 8)(OD 260/280值应在1.7~2.0 之间;RNA 应该去除干净;不得有其它个体或其它物种的DNA污染)。 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL Eppendorf管中,封口膜封好,干冰运输,DNA可用冰袋运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块切块,液氮冻存后-80℃保存;DNA样品短期内可-20℃,避免反复冻融。北京云序测序lncRNA

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