ac4c样品要求样品类型细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。样品量a)细胞:≥2×107b)组织:500mg-1gc)RNA:30μg-300μgd)超微量满足500ng-30μg样品运输与保存样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。目前,环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物,还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。云序生物采用商业化RIP试剂盒,保证了RIP实验的成功率和稳定性。云南测序平台
m5C全转录组测序m5C RNA是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。利用高通量测序手段验证了非编码RNA以及部分mRNA中m5C存在,但是在不同物种、不同组织中m5C修饰分布图谱尚没有系统性报道。云序生物率先开展m5C RNA甲基化测序服务,采用经典重亚硫 酸盐处理的方式进行测序。在全转录范围内及tRNA水平查看基因m5C甲基化修饰水平。 样品运输与保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。上海云序生物测序microRNA甲基化云序生物为您完成m5C RNA-Seq全套实验服务。
案例3:拟南芥m5CRNA甲基化谱及TRM4B酶对根的影响原文:Transcriptome-WideMappingofRNA5-MethylcytosineinArabidopsismRNAsandNoncodingRNAs期刊:ThePlantCell影响因子:8.23与上篇不同,本研究团队采用m5CRNA甲基化测序研究拟南芥中m5C甲基化谱,在种子,幼芽,根中发现了1000多个特异性的位点。敲低RNAm5C甲基转移酶TRM4B,造成tRNA稳定性的降低。研究人员还证实TRM4B突变体的初级根比野生型更短,同时对氧化的应激反应更敏感。
案例1:全外显子测序在ai症研究中的应用 胰腺导管腺ai(PDA)的预后非常差,因此对其病原学的研究以及靶向干预医治非常必要。本文对109个显微切割的PDA组织样品进行了全外显子测序。研究表明:环境压力以及DNA修复基因的改变与不同的突变谱有关联。许多ai基因/抑ai基因位点发生了拷贝数变化,但只有MYC基因拷贝数扩增与比较差的预后以及腺鳞ai亚型相关。此外,作者还在PDA中发现了多个新的突变基因,其中一些与预后相关。RBM10突变往往预示着较长的生存期。90%以上的样品中发生了KRAS的突变,但只有密码子Q61的等位突变与较长的生存期相关。此外,Wnt信号通路,染色质重塑信号通路,Hedgehog信号通路,DNA修复和细胞周期相关的基因也被发现有较高的突变频率。这些数据表明了不同PDA样品的基因组多样性,并且找到了一些与预后相关的基因以及医治靶点。云序生物的测序服务包括m6a,m5c,m7g,m1a服务。
LC-MS/MS检测核酸修饰水平实验原理:云序生物建立了一种基于LC-MS/MS平台的核酸修饰分析方法,定量4类DNA修饰(5-mdC、5-hmdC、5-fodC、6-mdA)和9类RNA修饰(m5C、m6A、Am、Gm、Cm、Um、m1A、m7G、ac4C),为表观遗传研究提供理想的技术平台。液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)能够很好的检测到极性高、稳定性差的化合物,并能够对物质进行精确的定量。LC-MS/MS法是目前所有总体甲基化水平分析方法中能够对含量极低的修饰碱基进行准确定性定量的方法;而将LCMS/MS法与一定的样品前处理方法相结合,能够更好地对各类生物样品中的DNA/RNA修饰进行检测。采用多种方法高效地富集环状DNA,环状DNA检出率高。上海测序价格
RNA抽提,RNA质控,环状RNA特异性引物设计,环状RNA逆转录。云南测序平台
组织细胞环状DNA测序: 游离于染色体基因组之外的DNA (extrachromosomal DNA,ecDNA)被发现常常以环状的形式存在,这种形式的DNA被称为环状DNA (extrachromosomal circular DNA,eccDNA)。目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA, 而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。目前研究表明,环状DNA是从染色体上断裂、环化或者额外复制产生的序列,其剪切加工机理主要提出有两种可能:(1)通过染色体异位同源重组环化(intrachromatid ectopic homologous recombination,HR);(2)通过非同源染色体末端连接环化(nonhomologous end-joining,NHEJ)。环状DNA形成是一个复杂的过程,更多环化方式有待探索。云南测序平台
上海云序生物科技有限公司是一家集研发、生产、咨询、规划、销售、服务于一体的服务型企业。公司成立于2015-03-02,多年来在RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体行业形成了成熟、可靠的研发、生产体系。公司主要经营RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等产品,产品质量可靠,均通过商务服务行业检测,严格按照行业标准执行。目前产品已经应用与全国30多个省、市、自治区。上海云序生物科技有限公司研发团队不断紧跟RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体行业发展趋势,研发与改进新的产品,从而保证公司在新技术研发方面不断提升,确保公司产品符合行业标准和要求。RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体产品满足客户多方面的使用要求,让客户买的放心,用的称心,产品定位以经济实用为重心,公司真诚期待与您合作,相信有了您的支持我们会以昂扬的姿态不断前进、进步。