吉林测序分析

组织细胞环状DNA测序： 游离于染色体基因组之外的DNA (extrachromosomal DNA，ecDNA)被发现常常以环状的形式存在，这种形式的DNA被称为环状DNA (extrachromosomal circular DNA，eccDNA）。目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA, 而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。目前研究表明，环状DNA是从染色体上断裂、环化或者额外复制产生的序列，其剪切加工机理主要提出有两种可能：（1）通过染色体异位同源重组环化（intrachromatid ectopic homologous recombination，HR）；（2）通过非同源染色体末端连接环化（nonhomologous end-joining，NHEJ）。环状DNA形成是一个复杂的过程，更多环化方式有待探索。云序生物环状RNA测序服务，采用Cloudseq CircRNA Enrichment Kit。吉林测序分析

案例1：孕妇血浆中胎儿环状DNA的特征是：呈甲基化状态原文：CharacteristicsofFetalExtrachromosomalCircularDNAinMaternalPlasma:MethylationStatusandClearance期刊：ClinicalChemistry影响因子：8.322近期，NIPT之父卢煜明教授团队开发了一种环状DNA甲基化分析的测序方案，通过对不同产后时间点的胎儿环状DNA含量的评估，研究了胎儿环状DNA的体外clear效率。作者还发现血浆中的胎儿环状DNA与母体环状DNA相比甲基化程度相对较低。此外，和胎儿线性DNA类似，胎儿环状DNA在分娩后从母血中迅速clear。总之，该团队基于转座酶和m5C位点酶学转化方法开发出了环状DNA甲基化测序技术，并揭示了孕妇血浆中的胎儿环状DNA甲基化状况，为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。宁夏服务测序云序生物可进一步提供高精度的O8G氧化图谱。

案例2：cancer基因与邻近增强子的环化共扩增 原文：Morton AR, Dogan-Artun N, Faber ZJ, et al. Functional enhancers shape extrachromosomal oncogene amplifications. Cell. 2019 Nov 27;179(6):1330-1341 期刊：Cell 影响因子：36.22 本文作者利用染色体外环状DNA测序探讨了cancer基因及其邻近增强子通过环状染色体外DNA的形式进行扩增事件，研究过程中发现了EGFR基因在成胶质细胞瘤中存在与其上游约130kb的非编码序列共同扩增的特征，EGFR基因案例表明tumour细胞中的cancer基因通过高级扩增与环化而形成的对自身调控活性的增强，是一个十分有效的促cancer机制。总之，这项研究综合利用各项计算分析和实验手段，率先揭示了增强子在cancer基因环化扩增介导的促cancer效应中所发挥的重要作用，这一机制也为抗tumour和诊断提供新的方向和理论依据。

技术简介DNA甲基化能控制基因表达，因而在动植物的生长发育过程中发挥着关键的调控作用，并且与包括ai症在内的多种人类疾病密切相关，是表观遗传学研究的热点。云序生物提供的MeDIP测序服务，将甲基化DNA免疫共沉淀技术（MeDIP）和高通量测序相结合，能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱，并比较不同样品中的甲基化分布差异。配合强大的生信分析实力，我们提供的不仅是海量的测序数据，而且是根据您的研究目的，有针对性地挖掘提炼出取之即可用的结果及出版级图片。在RIP-Seq中，富集峰表示全部活跃转录的区域(相对于对照IgG)。

案例1：母体血浆中染色体外环状DNA的鉴定与特性分析 原文：Identification and characterization of extrachromosomal circular DNA in maternal plasm 期刊：Proc Natl Acad Sci 影响因子：11.201 作者观察到在孕妇的血浆中存在染色体外环状DNA (环状DNA)，并通过限制性内切酶和Tn5转座酶处理后的改良的测序方法，在孕妇的血浆中鉴定出了环状DNA分子。他们发现血浆的环状DNA分子比线性的长，在这些环状DNA分子中，胎儿来源的环状DNA短于母体来源的环状DNA。此外，环状DNA的闭合圆形结构可能允许抗外切酶，因此这些分子比它们的线性对应物具有更高的稳定性。这些特性为环状DNA的研究和生物标志物的开发提供了机会。RIP-Seq将RIP技术与高通量测序相结合，能够高通量地检测与特定蛋白结合的RNA。江苏测序全转录组

测序适用于大多数物种：可以检测几乎任何动植物的环状RNA。吉林测序分析

云序优势环状DNA检出率高：采用多种方法高效地富集环状DNA，环状DNA检出率高。专业的生物信息学分析：专业的生物信息学团队，开发了高效识别分析环状DNA的算法，满足客户的各类深入数据分析需求。一站式服务：客户只需提供细胞、组织或基因组DNA，云序生物为您完成从样品准备、环状DNA富集、文库制备、上机测序到数据分析整套服务流程。目前，环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物，还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。可以预见的是，环状DNA将迅速成为新的科研热点，甚至会对传统遗传学和基因组学带来性影响。吉林测序分析

上海云序生物科技有限公司是一家集研发、生产、咨询、规划、销售、服务于一体的服务型企业。公司成立于2015-03-02，多年来在RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体行业形成了成熟、可靠的研发、生产体系。公司主要经营RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体等产品，产品质量可靠，均通过商务服务行业检测，严格按照行业标准执行。目前产品已经应用与全国30多个省、市、自治区。上海云序生物科技有限公司研发团队不断紧跟RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体行业发展趋势，研发与改进新的产品，从而保证公司在新技术研发方面不断提升，确保公司产品符合行业标准和要求。RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体产品满足客户多方面的使用要求，让客户买的放心，用的称心，产品定位以经济实用为重心，公司真诚期待与您合作，相信有了您的支持我们会以昂扬的姿态不断前进、进步。