样本要求 样品类型: 细胞、组织、基因组DNA。其它类型样品请详询。 样品量: a)细胞 2×107 b)组织 200 mg c)DNA:>=10 µg,溶于无菌水或 TE(PH = 8)(OD 260/280值应在1.7~2.0 之间;RNA 应该去除干净;不得有其它个体或其它物种的DNA污染)。 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL Eppendorf管中,封口膜封好,干冰运输,DNA可用冰袋运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块切块,液氮冻存后-80℃保存;DNA样品短期内可-20℃,避免反复冻融。样品置于1.5mL管中,封口膜封好,干冰运输。云南测序结果
m6ALncRNA测序:案例上的m6A甲基化影响细胞分化原文:N6-MethyladenosinemodificationoflincRNA1281iscriticallyrequiredformESCdifferentiationpotential期刊:NucleicAcidsResearch影响因子:11.56同济大学康九红团队研究发现在mESC细胞中,甲基化转移酶Mettl3能够调控lincRNA1281发生甲基化,并且与干细胞分化能力直接相关。揭示此过程主要发生在胞浆,且由let-7能够竞争性结合linc1281,从而降低其表达量,从机制上解释了m6A在不影响到表达水平的情况下如何影响生物学功能的问题。遗传测序全转录组根据注释信息,绘制富集峰在不同基因组特征上的比例图。
云序优势环状DNA检出率高:采用多种方法高效地富集环状DNA,环状DNA检出率高。专业的生物信息学分析:专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法,满足客户的各类深入数据分析需求。一站式服务:客户只需提供细胞、组织或基因组DNA,云序生物为您完成从样品准备、环状DNA富集、文库制备、上机测序到数据分析整套服务流程。目前,环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物,还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。可以预见的是,环状DNA将迅速成为新的科研热点,甚至会对传统遗传学和基因组学带来性影响。
云序优势 适用于血清血浆等微量样品: 此法减少DNA损失,并保留原始表达量,不同环状DNA间表达量比较更准确 专业的生物信息学分析: 专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法,满足客户的各类深入数据分析需求。 一站式服务: 客户只需提供血清血浆,云序生物为您完成从样品准备、环状DNA富集、文库制备、上机测序到数据分析整套服务流程。 样本要求 样品类型: 血清血浆。 样品量: 血清血浆:5mL 样品运输及保存: EDTA抗凝,样品干冰运输。勿用肝素管取样(绿色盖子抗凝管)。m1A 环状RNA测序,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术。
血清血浆环状DNA测序游离于染色体基因组之外的DNA(extrachromosomalDNA,ecDNA)被发现常常以环状的形式存在,这种形式的DNA被称为环状DNA(extrachromosomalcircularDNA,eccDNA)。目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA,而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。传统观点认为真核基因组通常形成稳定的线性染色体。但新的研究表明:无论是在正常体细胞还是cancer细胞中,都存在大量染色体外环状DNA。目前,环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物,还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。采用多种方法高效地富集环状DNA,环状DNA检出率高。天津测序文章
云序生物acRIP-seq实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程。云南测序结果
案例2:2’-O-RNA甲基化酶FTSJ3协助HIV病 毒逃避宿主细胞免疫识别机制 原文:FTSJ3 is an RNA 2’-O-methyltransferase recruited by HIV to avoid innate immune sensing 期刊:Nature 影响因子:41.6 外国研究人员首先借助蛋白互作实验证实TRBP蛋白能够在不依赖于DICER酶的作用下与FTSJ3结合,形成复合物,因此推测,FTSJ3是一种2'-O-甲基化转移酶。接着,体外和体内实验表明FTSJ3就是一种通过TRBP被招募到HIV RNA上的2'-O-甲基化转移酶。通过优化的2’-O-RNA甲基化测序手段,证实在HIV病 毒遗传信息的特定位置上存在依赖于FTSJ3的2'-O-甲基化修饰。综上,该研究证实TRBP-FTSJ3复合物通过招募到HIV病 毒RNA发生2'-O-甲基化从而解释了HIV病 毒逃避宿主细胞先天免疫识别的机制。云南测序结果
上海云序生物科技有限公司依托可靠的品质,旗下品牌高通量测序,测序合成,科研,技术服务以高质量的服务获得广大受众的青睐。是具有一定实力的商务服务企业之一,主要提供RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等领域内的产品或服务。我们强化内部资源整合与业务协同,致力于RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等实现一体化,建立了成熟的RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体运营及风险管理体系,累积了丰富的商务服务行业管理经验,拥有一大批专业人才。公司坐落于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2,业务覆盖于全国多个省市和地区。持续多年业务创收,进一步为当地经济、社会协调发展做出了贡献。