自2010年以来,RNA表观遗传学概念提出后,随后几年这一领域的研究便如火如荼的开展起来,同时也取得了zhuo越的成果,其中包括m6A,m5C RNA甲基化修饰等,而我们要来谈一谈的是近发表在Molecular Cell (IF:14.714)上的一篇关于m1A RNA甲基化的文章,这是一类新型RNA修饰,想必大家也迫不及待地想看看科研研究成果了吧,话不多说,让我们来一探究竟。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。全国各地均有销售在线,请在官网留言咨询。武清区m1AmicroRNA甲基化测序
MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供,是在已发表实验方法的基础上开发而来,方法简述如下:片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用proteinA磁珠(ThermoFisher)在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂(ThermoFisher)进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒(NEB)建库,并在IlluminaHiseq测序仪上进行双端150bp测序。和平区m1A分析m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰。
云序生物技术优势:可单碱基分辨率检测m1A甲基化修饰。特异性高:m1ARNA-seq采用商业化m1A抗体,可特异性富集m1A修饰片段。一站式服务:客户只需提供细胞、组织、体液或总RNA,云序生物为您完成从m1ARNA-seq富集、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。专业的生物信息学分析:云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析要求。芝加哥大学等处的科学家在国际杂志Nature上发表的一项研究论文,该研究通过m1ARNA甲基化测序技术在真核生物mRNA中对m1A甲基化作用进行较全的分析,揭示了m1A修饰可以明显增强基因向蛋白质的表达过程。并且m1A修饰具有进化保守性,在人类、啮齿类动物及酵母中普遍存在。
2.m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测,发现了740个m1A修饰位点,其中473个位点位于mRNA和lncRNA,大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库,作者还排除了假阳性结果。另外,作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关,且这种正相关性在cap+1位置上更xian著,但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析,作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外,作者发现TRMT6/61A不仅是tRNAm1A甲基化酶复合物,也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。m1A pri-miRNA测序,m1A lncRNA测序,m1A mRNA测序。
案例2:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰,原文:Base-ResolutionMappingRevealsDistinctm1AMethylomeinNuclear-andMitochondrial-EncodedTranscripts,期刊:MolecularCell影响因子:15.59,本研究通过单碱基分辨率方法“m1A-MAP”鉴定了细胞核和线粒体中m1A甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR,小部分符合“GUUCRA”基序的m1A位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A修饰。此外,线粒体编码的转录本中也有大量的m1A甲基化修饰。该研究还表明,位于5’UTR区,尤其是转录本di一和第二位上的m1A可促进mRNA翻译,而位于编码区的m1A可抑制翻译作用。因此,m1A测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A甲基化修饰,还为进一步m1A甲基化功能验证提供了重要工具。近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。邢台m1A价格
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云序生物作为国内很早做m1A的科研平台,至今用户已发表10+篇m1A相关文章,其中多篇影响因子超过10分,成为国内m1A测序专业的服务平台。云序生物RNA修饰高通量测序产品覆盖面广,包括编码mRNA和非编码lncRNA,circRNA,microRNA等分子。云序生物既提供针对单个分子的m1A测序,也提供一次检测多种RNA分子m1A修饰的全转录组测序,此外公司长期致力于提供you质前沿表观研究测序产品,结合科研热点继m6A、m5C、m1A之后,隆重推出多款RNA新修饰,不仅有m7G测序,还包括m3C测序、ac4C乙酰化测序和2-O-甲基化测序,打造了全修饰和全分子覆盖的研究平台。武清区m1AmicroRNA甲基化测序
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