和平区m1ARNA甲基化测序

案例1：真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究,原文：The dynamic N1-methyladenosine methylome in eukaryotic messenger RNA,期刊：Nature 影响因子：41.456,芝加哥大学等处的科学家在国际杂志Nature上发表的一项研究论文，该研究通过m1A RNA甲基化测序技术在真核生物mRNA中对m1A甲基化作用进行细致的分析，揭示了m1A修饰可以明显增强基因向蛋白质的表达过程。并且m1A修饰具有进化保守性，在人类、啮齿类动物及酵母中普遍存在。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。云序生物为您完成从m1A RNA-seq富集、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。和平区m1ARNA甲基化测序

m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。研究表明，m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰，近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。与m6A RNA检测方式一致，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术，抗体富集的技术原理如下：将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RAN片段，对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。大同分析m1A伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量，发现其存在于各种细胞系中。

MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供，是在已发表实验方法的基础上开发而来，方法简述如下：片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用protein A磁珠（Thermo Fisher）在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂（Thermo Fisher）进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒（NEB）建库，并在Illumina Hiseq测序仪上进行双端150bp测序。

目前热门的有三种，分别是：m6A RNA甲基化﹑m5C RNA甲基化﹑m1A RNA甲基化。而m1A RNA甲基化是一个新进入大家的视野的RNA甲基化修饰类型，即 RNA 分子腺嘌呤第 1 位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。我们为大家带来m1A RNA甲基化研究进展。1. Nature：真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究,2.Cell：ALKBH1介导的tRNA去甲基化调控翻译,3. Nature Chemical Biology：全转录组水平测序揭示可逆与动态的m1A RNA修饰,4.Molecular Cell:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰： Base-Resolution。RNA甲基化位点motif分析。

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Molecular Cell:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰：Base-Resolution。和平区m1ARNA甲基化测序

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