海淀区m1A全转录组测序

1. m1A-MAP技术及其在tRNA中的验证,利用m1A会导致错配的特性，采用去甲基化酶AlkB来实现m1A去甲基化，对比(-)去甲基化酶和(+)去甲基化酶的结果，捕捉碱基突变的信号，来实现m1A RNA修饰位点单碱基分辨率的鉴定，为了增加检测灵敏度，作者还利用抗体富集的方式来特异性富集m1A的RNA的片段，作者将这个方法命名为m1A-MAP。在哺乳动物中，已知tRNA第9，14和58位会发生m1A RNA修饰，通过这个技术，细胞质中tRNAAsp(GUC)第9位及tRNA第58位都被检测到m1A RNA修饰，以上结果都证实该方法确实可有效单碱基分辨率的鉴定m1A RNA修饰位点。继m6A、m5C、m1A之后，云序隆重推出多款RNA新修饰类型。海淀区m1A全转录组测序

MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供，是在已发表实验方法的基础上开发而来，方法简述如下：片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用protein A磁珠（Thermo Fisher）在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂（Thermo Fisher）进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒（NEB）建库，并在Illumina Hiseq测序仪上进行双端150bp测序。保定m1AlncRNA测序云序m1A RNA-seq采用商业化m1A抗体，可特异性富集m1A修饰片段。

RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程，目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼，而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰，在这些领域的研究中也不断有高分文章的出现。云序生物是国内RNA修饰测序的ling跑者，可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。

此研究由云序生物合作客户华南农业大学余义勋课题组完成的，该课题组利用m1A-seq & RNA-seq（本实验云序提供）技术对矮牵牛花瓣中含m1A修饰的RNA进行全转录组分析，发现乙烯处理降低了花瓣mRNA m1A峰的水平。另外还发现矮牵牛tRNA特异性甲基转移酶61A (PhTRMT61A)的沉默降低了体内和体外mRNA的m1A水平，定位于细胞核内的PhTRMT61A被抑制会导致叶片发育异常。这些研究结果显示RNA m1A修饰可以作为表观转录组调控机制并在植物生长发育中起着重要作用。矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,云序生物热门RNA修饰—m5C甲基化。安徽，湖北，湖南，河南，河北，山东，陕西。

样本要求:样品类型：组织、细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。样品量：细胞： > 1×108,组织： > 5 g ,总RNA：> 300 μg (OD260/280≥1.8；OD260/230≥1.5；无明显降解，电泳检测样品特征性条带完整清晰，无明显弥散或拖尾 28S：18S≥1.5或者RIN≥7）,样品运输及保存：样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。样品保存：细胞样品或新鲜组织块（切成5-10 mg的小块），可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后，-80℃保存，RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，样品保存期间避免反复冻融。细胞样品或新鲜组织块（切成5-10 mg的小块），可用TRIZOL或RNA保护剂处理。石家庄遗传m1A

目前对m1A甲基化修饰研究的报道是发表在Molecular Cell上的一篇论文。海淀区m1A全转录组测序

该研究还表明，位于 5’UTR 区，尤其是转录本di一和第二位上的 m1A 可促进 mRNA 翻译，而位于编码区的 m1A 可抑制翻译作用。因此，m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的 m1A 甲基化修饰，还为进一步 m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。m1A 修饰作为一类新型 RNA 甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。云序生物作为m1A RNA甲基化研究的先驱者，能够为客户提供专业和优zhi的m1A RNA甲基化测序服务。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，海淀区m1A全转录组测序

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