东城区m1A测序

m1A修饰作为一类新型RNA甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。与m6A RNA检测方式一致，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术，抗体富集的技术原理如下：将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RAN片段，对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。云序生物作为国内较早做m1A的科研平台，至今用户已发表10+篇m1A相关文章，其中多篇影响因子超过10分，成为国内m1A测序专业的服务平台。云序生物RNA修饰高通量测序产品覆盖面广，包括编码mRNA和非编码lncRNA，circRNA，microRNA等分子。m1A-MAP揭示核编码和线粒体编码转录本上不同类型的m1A甲基化组。东城区m1A测序

何川教授助力m1A甲基化修饰研究。2019年9月23日，美国芝加哥大学Bryan C. Dickinson团队与何川团队在Nature Methods上发表“Evolution of a reverse transcriptase to map N1-methyladenosine in humanmessenger RNA”研究成果，该项研究开发并验证了一个逆转录酶进化平台，可快速选择逆转录酶，使其在逆转录过程中越过RNA修饰位点，并使其发生突变，从而特异性识别RNA修饰。该平台首先被应用到了对m1A修饰的检测，在测序过程中产生突变标记，终实现单碱基识别m1A，为m1A生物学的研究提供了新的工具、分析方法和数据集。河北区遗传m1A继m6A、m5C、m1A之后，云序隆重推出多款RNA新修饰类型。

RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程，目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼，而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰，在这些领域的研究中也不断有高分文章的出现。云序生物是国内RNA修饰测序的ling跑者，可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。

本研究是由北京大学生命科学学院伊成器研究组领衔，联合化学与分子工程学院王初课题组、分子医学研究所陈晓伟课题组以及美国康奈尔大学钱书兵课题组等单位的一篇研究论文。论文报道的是一项新型RNA甲基化的测序技术，作者将其命名为m1A-MAP。通过这项技术，可在全转录组水平上单碱基分辨鉴定m1A（1-甲基腺嘌呤）修饰位点，作者还通过m1A-MAP绘制了人细胞核和线粒体转录组中不同类型的m1A甲基化组。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，RNA甲基化富集峰可视化图。

案例1：真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究,原文：The dynamic N1-methyladenosine methylome in eukaryotic messenger RNA,期刊：Nature 影响因子：41.456,芝加哥大学等处的科学家在国际杂志Nature上发表的一项研究论文，该研究通过m1A RNA甲基化测序技术在真核生物mRNA中对m1A甲基化作用进行细致的分析，揭示了m1A修饰可以明显增强基因向蛋白质的表达过程。并且m1A修饰具有进化保守性，在人类、啮齿类动物及酵母中普遍存在。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。目前对m1A甲基化修饰研究的报道是发表在Molecular Cell上的一篇论文。门头沟区m1ARNA甲基化测序

m1A修饰作为一类新型RNA甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。东城区m1A测序

1. m1A-MAP技术及其在tRNA中的验证,利用m1A会导致错配的特性，采用去甲基化酶AlkB来实现m1A去甲基化，对比(-)去甲基化酶和(+)去甲基化酶的结果，捕捉碱基突变的信号，来实现m1A RNA修饰位点单碱基分辨率的鉴定，为了增加检测灵敏度，作者还利用抗体富集的方式来特异性富集m1A的RNA的片段，作者将这个方法命名为m1A-MAP。在哺乳动物中，已知tRNA第9，14和58位会发生m1A RNA修饰，通过这个技术，细胞质中tRNAAsp(GUC)第9位及tRNA第58位都被检测到m1A RNA修饰，以上结果都证实该方法确实可有效单碱基分辨率的鉴定m1A RNA修饰位点。东城区m1A测序

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