这一分布规律与m6A(真核细胞mRNA中广fan的甲基化修饰)截然不同,后者主要集中在mRNA的靠后一个外显子上,并且对mRNA的翻译、定位、稳定性等多个过程进行调控。该研究进一步鉴定了m1A修饰的一个去甲基化酶ALKBH3,并发现了转录组中ALKBH3的近千个作用位点。因此,该研究不但揭示了m1A的广fan存在、绘制了转录组中m1A RNA修饰的谱图,也为m1A修饰参与基因表达调控的研究提供了重要工具。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,上海云序生物,一家专业做测序,试剂盒的良心企业。宁河区m1AmRNA测序
合作单位包括超过200家科研院所和高校、150余家医院等,与中国科学院,北京大学,复旦大学,上海交通大学,同济大学,浙江大学,山东大学,华南农业大学,华中农业大学等高校和研究院所建立了良好的合作关系,获得业内高度认可。未来,公司将致力于高通量技术在疾病预测、诊断、个性化医疗等方面的应用和开发,致力于为国内外科研和医疗用户提供国际先进的高通量检测系统解决方案。2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域。和平区m1AlncRNA测序m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。
此研究由云序生物合作客户华南农业大学余义勋课题组完成的,该课题组利用m1A-seq & RNA-seq(本实验云序提供)技术对矮牵牛花瓣中含m1A修饰的RNA进行全转录组分析,发现乙烯处理降低了花瓣mRNA m1A峰的水平。另外还发现矮牵牛tRNA特异性甲基转移酶61A (PhTRMT61A)的沉默降低了体内和体外mRNA的m1A水平,定位于细胞核内的PhTRMT61A被抑制会导致叶片发育异常。这些研究结果显示RNA m1A修饰可以作为表观转录组调控机制并在植物生长发育中起着重要作用。矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,云序生物热门RNA修饰—m5C甲基化。
案例3:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰-Base-Resolution,期刊:Molecular Cell 影响因子:13.84,本研究通过单碱基分辨率方法的m1A RNA甲基化测序技术鉴定了细胞核和线粒体中m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR,小部分符合“GUUCRA”基序的m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外,线粒体编码的转录本中也有大量的m1A 甲基化修饰。该研究还表明,位于5’UTR 区,尤其是转录本di一和第二位上的m1A 可促进mRNA 翻译,而位于编码区的m1A 可抑 制翻译作用。因此,m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A 甲基化修饰,还为进一步m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。全转录组水平测序揭示可逆与动态的m1A RNA修饰。
2. m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测,发现了740个m1A修饰位点,其中473个位点位于mRNA和lncRNA,大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库,作者还排除了假阳性结果。另外,作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关,且这种正相关性在cap+1位置上更xian著,但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析,作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外,作者发现TRMT6/61A不仅是tRNA m1A甲基化酶复合物,也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。今年9月份,何川教授团队在Nature Methods发布了m1A甲基化修饰。宁河区m1AmRNA测序
云序m1A RNA-seq采用商业化m1A抗体,可特异性富集m1A修饰片段。宁河区m1AmRNA测序
为了探寻m6A修饰与结直肠ai(CRC)的糖酵解代谢的相关性,采用qPCR检测结直肠ai患者体内脱氧葡萄糖吸收(FDG uptake)和m6A修饰相关酶表达的情况,发现Mettl3(m6A甲基化转移酶)的表达与FDG摄取存在明显的相关性。同时检测到在CRC体内Mettl3高表达和葡萄糖代谢强烈保持一致,那么在结直肠ai患者体内FDG和Mettl3的变化是否影响甲基化整体水平的变化呢?作者采用多种方法检测高FDG CRC和低FDG CRC患者体内甲基化水平,结果表明m6A修饰水平在这些FDG摄取较高的CRC患者中也xian著升高。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。宁河区m1AmRNA测序
上海云序生物科技有限公司主营品牌有高通量测序,测序合成,科研,技术服务,发展规模团队不断壮大,该公司服务型的公司。云序生物是一家私营有限责任公司企业,一直“以人为本,服务于社会”的经营理念;“诚守信誉,持续发展”的质量方针。公司始终坚持客户需求优先的原则,致力于提供高质量的RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。云序生物自成立以来,一直坚持走正规化、专业化路线,得到了广大客户及社会各界的普遍认可与大力支持。