目前热门的有三种,分别是:m6ARNA甲基化﹑m5CRNA甲基化﹑m1ARNA甲基化。而m1A RNA甲基化是一个新进入大家的视野的RNA甲基化修饰类型,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。我们为大家带来m1ARNA甲基化研究进展。1.Nature:真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究,2.Cell:ALKBH1介导的tRNA去甲基化调控翻译,3.NatureChemicalBiology:全转录组水平测序揭示可逆与动态的m1ARNA修饰,4.MolecularCell:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰:Base-Resolution。安徽,湖北,湖南,河南,河北,山东,陕西。西青区m1A环状RNA测序
这一分布规律与m6A(真核细胞mRNA中广fan的甲基化修饰)截然不同,后者主要集中在mRNA的靠后一个外显子上,并且对mRNA的翻译、定位、稳定性等多个过程进行调控。该研究进一步鉴定了m1A修饰的一个去甲基化酶ALKBH3,并发现了转录组中ALKBH3的近千个作用位点。因此,该研究不但揭示了m1A的广fan存在、绘制了转录组中m1ARNA修饰的谱图,也为m1A修饰参与基因表达调控的研究提供了重要工具。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,衡水m1Apri-miRNA测序今年9月份,何川教授团队在Nature Methods发布了m1A甲基化修饰。
RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6ARNA修饰的研究已进行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰,在这些领域的研究中也不断有高分文章的出现。云序生物是国内RNA修饰测序的专业者,可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务(m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。
案例2:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰,原文:Base-ResolutionMappingRevealsDistinctm1AMethylomeinNuclear-andMitochondrial-EncodedTranscripts,期刊:MolecularCell影响因子:15.59,本研究通过单碱基分辨率方法“m1A-MAP”鉴定了细胞核和线粒体中m1A甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR,小部分符合“GUUCRA”基序的m1A位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A修饰。此外,线粒体编码的转录本中也有大量的m1A甲基化修饰。该研究还表明,位于5’UTR区,尤其是转录本di一和第二位上的m1A可促进mRNA翻译,而位于编码区的m1A可抑制翻译作用。因此,m1A测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A甲基化修饰,还为进一步m1A甲基化功能验证提供了重要工具。m1a环状RNA,云序生物做的比较好,我做了。
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RNA甲基化富集峰可视化图。西青区m1A环状RNA测序
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