CUT&Tag 技术的基本原理为:在抗体引导下,ChiTag 酶在目的组蛋白修饰标志、或转录因子、或染色质调控蛋白结合染色质的局部进行目的 DNA 的片段化,同时添加测序接头,并释放到细胞外,而绝大部分无关的染色质还留在细胞核内,因而整个实验的信噪比大幅提高,同时简化了实验步骤。该方法可一管式高通量应用,并可与单细胞测序平台"无缝"结合。ChiTag 酶在打断基因组的同时加上接头,不需要繁琐的补平加 A 加接头,在一个工作日内可以完成从细胞到测序文库制备全流程。云序生物具有丰富样本处理经验,采用ctDNA提取试剂盒,富集效率高。技术表观遗传组测序价格
ChIP-Seq(Chromatin Immunoprecipitation Sequencing)因能真实、完整地反映靶蛋白与DNA序列的结合情况,因而成为研究DNA-蛋白相互作用的经典方法。但ChIP-Seq继承了ChIP的难点与局限性:需要大量细胞投入(106-107),甲醛交联易导致假阳性或假阴性,对染色质的完整性、免疫沉淀抗体的特异性较为敏感,整体实验步骤复杂耗时长,测序数据背景信号高等,这些难点使得低投入量、低丰度的靶蛋白、弱结合DNA-蛋白质的研究变得较为困难。湖南平台表观遗传组测序专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法。
人体血液循环系统中,含有不断流动的携带一定特征(包括突变,缺失,插入,重排,拷贝数异常,甲基化等)的,来自tumsor基因组的DNA的片段。这些DNA的片段来源于四个部分:1、坏死的tumsor细胞;2、凋亡的tumsor细胞;3、循环tumsor细胞;4、tumsor细胞分泌的外排体。自1977年人类发现ctDNA以来,对其的研究就从未中断过。在1994年,研究人员鉴定了来源于tumsor的含有cancer标志性突变的DNA。加上ctDNA的无创性和易获得性,在其中发现的tumsor标志物,被认为可以用于检测tumsor早期诊断,进展过程,预后判断及个性化用药指导。但是由于ctDNA在人体血液内含量极低,只有循环DNA的1%,甚至万分之一,其测序检测存在巨大的挑战。
技术优势 一站式服务:客户只需提供样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 特异性富集ctDNA的片段:云序生物具有丰富样本处理经验,采用ctDNA提取试剂盒,富集效率高。 严格质控流程:云序生物质控流程严格,层层把关,为客户提供高准确度的结果。 专业化生物信息分析:云序生物强大生物信息团队,满足客户个性化数据分析要求。 样本要求 1)样品类型:血清、血浆、体液等。其他样本类型请详询。 2)样品量: 血清,血浆:≥5 mL; 体液:请详询。 3)样品保存: 血清、血浆、体液样品,可用液氮速冻后-80℃保存,样品保存期间避免反复冻融。 4)样品运输:样品置于1.5 mL管中,封口膜封好,干冰运输。环状DNA连登《Nature》《Cell》等期刊,彻底颠覆了人们对基因遗传的传统认知。
案例2 :鼻细胞表观基因甲基化作为儿童哮chuan和气道炎症生物标志物的研究 期刊:Nature Communication 影响因子:11.878 本文作者研究团队首先借助850K甲基化芯片平台对547名儿童鼻孔细胞表观基因组做了DNA甲基化检测分析,并对当前的哮chuan、变应原致敏、变应性鼻炎、呼出气一氧化氮(FeNO)和肺功能进行了鼻表观基因组关联分析(EWAS)。结果显示DNA差异甲基化主要发生在哮chuan相关基因、参与Th2和嗜酸性反应的基因、以及可能改变呼吸上皮的通透性和功能的基因。作者还发现发现随着过敏和哮chuan生物标志物的升高,表观遗传年龄会加速。综上所述,鼻细胞外基因组甲基化可以作为哮chuan、过敏和气道气道炎症的敏感生物标志物,以及这些表型的特异性生物学过程。这种形式的DNA被称为环状DNA (extrachromosomal circular DNA)。宁夏技术表观遗传组测序分析
ctDNA特指来源于tumsour细胞的cfDNA,是液体活检主流方向。技术表观遗传组测序价格
乳腺ai转移确诊后,患者已经很少能够彻底痊愈。但是现在,我们可以利用含有tumsor染色体异质性的ctDNA来对乳腺ai进行检测。在H Saal教授的研究中,他们对20例早期确诊的原发性乳腺ai患者进行了监测和长期随访。通过NGS和液体数字PCR联合使用的方法,他们能够覆盖很多低信号的全基因组测序结果,并且first发现,在手术后,ctDNA监测是高度精确的,其成功监测预示了93%的复发病人以及100%的没有复发的病人。基于ctDNA的监测中,转移患者的平均生存期是11个月,而在患者的长期不进展期的时候,是没有检测到ctDNA的。因此,ctDNA能够预测不良生存期。这些发现表明,我们可以利用ctDNA来监测早期乳腺ai患者的转移情况,并帮助修改治疗方案,避免过度医治。技术表观遗传组测序价格
上海云序生物科技有限公司致力于商务服务,以科技创新实现***管理的追求。云序生物作为上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的企业之一,为客户提供良好的RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。云序生物不断开拓创新,追求出色,以技术为先导,以产品为平台,以应用为重点,以服务为保证,不断为客户创造更高价值,提供更优服务。云序生物始终关注自身,在风云变化的时代,对自身的建设毫不懈怠,高度的专注与执着使云序生物在行业的从容而自信。