长片段PCR通常指扩增大于5kb的DNA的片段。长片段PCR传统上使用TaqDNA聚合酶(为了快速延伸)和高保真酶(为了准确度)的混合物。随着高合成能力、高保真DNA聚合酶的发明,长片段PCR现在可在短时间内高准确性的完成。通过与一个强DNA结合蛋白的结合,聚合酶可获得高扩增能力,可在短时间内扩增长片段(如>20kbgDNA的片段)。初次之外,极高保真度(如>100xTaq)可确保长片段扩增的低错误率。当扩增>10kb的片段时,PCR实验方案可能需要在以下5个关键位置进行适当优化:确保使用高质量、高纯度的DNA样本。如果DNA聚合酶的热稳定较低,使用更多量的DNA聚合酶以弥补多次循环中的聚合酶活性损失。降低退火和延伸步骤的温度,以助于引物结合。适当增加PCR步骤的时间,以促进模板DNA的完全分离及引物的结合。适当增加PCR延伸时间确保目的片段的全长扩增。做pcr,样本该如何保存?河北什么是pcr实验
PCR反应的特异性强,其决定因素为:①引物与模板DNA特异正确的结合;②碱基配对原则;③TaqDNA聚合酶合成反应的忠实性;④靶基因的特异性与保守性。其中引物与模板的正确结合是关键。引物与模板的结合及引物链的延伸是遵循碱基配对原则的。聚合酶合成反应的忠实性及TaqDNA聚合酶耐高温性,使反应中模板与引物的结合(复性)可以在较高的温度下进行,结合的特异性明显增加,被扩增的靶基因片段也就能保持很高的正确度。再通过选择特异性和保守性高的靶基因区,其特异性程度就更高。云南什么是pcr有没有做pcr检测比较快比较好的公司?
PCR实验技术中的高GC含量PCR(GC-richPCR)介绍:具有高GC含量(>65%)的模板由于G和C碱基间的强氢键影响,比较难以扩增。高GC含量序列同时也涉及二级结构。因此,高GC含量序列可使DNA聚合酶在扩增时卡住,从而影响了DNA的合成。为了扩增高GC含量片段,双链模板必须分离,以便引物结合及DNA聚合酶读取序列。为了克服强GC相互作用,较常用的方法是依靠PCR添加剂或共溶剂来帮助DNA变性(图6A),如DMSO。这些试剂通常会降低引物的Tm,所以退火温度也需做相应的调整。高合成能力的DNA聚合酶由于其与模板的强结合能力,有助于高GC含量模板的PCR扩增(图6B)。高热稳定性DNA聚合酶也有益于高GC含量PCR扩增,因为更高的变性温度(如98℃代替95℃)可促进解链和PCR扩增。
PCR的假阳性主要原因之一出现非特异性扩增带:PCR扩增后出现的条带与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现特异性扩增带与非特异性扩增带。非特异性条带的出现,其原因:一是引物与靶序列不完全互补、或引物聚合形成二聚体。二是Mg2+离子浓度过高、退火温度过低,及PCR循环次数过多有关。其次是酶的质和量,往往一些来源的酶易出现非特异条带而另一来源的酶则不出现,酶量过多有时也会出现非特异性扩增。其对策有:必要时重新设计引物。减低酶量或调换另一来源的酶。降低引物量,适当增加模板量,减少循环次数。适当提高退火温度或采用二温度点法(93℃变性,65℃左右退火与延伸)。PCR的假阳性主要原因之一出现片状拖带或涂抹带:PCR扩增有时出现涂抹带或片状带或地毯样带。其原因往往由于酶量过多或酶的质量差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多引起。其对策有:减少酶量,或调换另一来源的酶。②减少dNTP的浓度。适当降低Mg2+浓度。增加模板量,减少循环次数。英瀚斯生物,可承接各类荧光定量pcr检测。
PCR实验技术中的不对称PCR(AsymmetricPCR)介绍:不对称PCR的基本原理是采用不等量的引物产生大量的单链DNA(ss-DNA)。这两种引物分别称为限制性引物与非限制性引物;其比较好比例一般为1:50~1:100,关键是限制引物的量。限制性引物太多太少,均不利于ss-DNA.不对称PCR反应过程:一般来说,在不对称PCR反应中,在开始的20-25个循环中,两个比率不对称的扩增引物产生出双链DNA,当限量的那个引物耗光后,随后的5-10个循环就产生出ssDNA.产生的ds-DNA与ss-DNA由于分子量不同,可以通过电泳分离。英瀚斯分子生物学检测平台,信得过的pcr检测。湖北荧光定量pcr实验
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PCR实验技术中的定量PCR介绍:由于序列扩增的产量依赖于模板DNA的量,所以PCR常用于对样品中DNA进行定量,常用的应用是基因表达的定量。终点法PCR是一种可能的方法,但其有较大的缺点,通过凝胶电泳来检测产量,检测的灵敏度非常有限。更重要的是,使用终点PCR是在PCR反应结束后进行定量,此时扩增已经达到平台期,DNA凝胶染色的强度与DNA起始量不成线性关系。尽管如此,通过终点法PCR可以对基因表达进行半定量,可以使用一系列稀释程度不同的DNA样本作为模板起始量,或者在特定的PCR循环处获取扩增产物,然后通过凝胶显色强度来估计基因的表达量。河北什么是pcr实验
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