PCR实验技术中的反向PCR(InversePCR)介绍:反向PCR起初设计用于确定临近未知区域的序列。反向PCR有助于研究一个基因的启动子序列;致*染色体重排如基因融合、异位或转移;及病毒基因的整合。之所以称为反向PCR,是因为引物设计用于向两边延伸而不像常规PCR中朝着彼此延伸。如今,反向PCR常用于定点突变,复制一个具有预期突变的目的质粒。在研究基因组DNA未知序列的传统实验流程中,限制性内切酶消化和连接先于反向PCR,接着对PCR扩增子进行测序。对于gDNA消化,需选择一种限制性内切酶进行酶切以获得合适长度可自连的片段。同时,所选择的内切酶不应该切割已知序列,所以连接发生于侧翼的未知序列之间。使用低浓度的酶切DNA的片段以助于片段自连而非多个片段连接。片段自连完成后,通过反向PCR扩增DNA的位置区域。获得的扩增子两端包含一部分已知序列。之后通过测序以鉴定临近已知序列的未知区域。实时荧光定量PCR是什么原理?黑龙江高质量pcr多少钱
PCR设计引物应遵循以下原则:①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。②引物扩增跨度:以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC比较好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。⑤引物3'端的碱基,特别是较末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。⑥引物中有或能加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列比较好有适宜的酶切位点,这对酶切分析或分子克隆很有好处。⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。引物量:每条引物的浓度0.1~1umol或10~100pmol,以比较低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。河北高效pcr多少钱英瀚斯生物pcr检测,提供原始数据和完整报告。
长片段PCR通常指扩增大于5kb的DNA的片段。长片段PCR传统上使用TaqDNA聚合酶(为了快速延伸)和高保真酶(为了准确度)的混合物。随着高合成能力、高保真DNA聚合酶的发明,长片段PCR现在可在短时间内高准确性的完成。通过与一个强DNA结合蛋白的结合,聚合酶可获得高扩增能力,可在短时间内扩增长片段(如>20kbgDNA的片段)。初次之外,极高保真度(如>100xTaq)可确保长片段扩增的低错误率。当扩增>10kb的片段时,PCR实验方案可能需要在以下5个关键位置进行适当优化:确保使用高质量、高纯度的DNA样本。如果DNA聚合酶的热稳定较低,使用更多量的DNA聚合酶以弥补多次循环中的聚合酶活性损失。降低退火和延伸步骤的温度,以助于引物结合。适当增加PCR步骤的时间,以促进模板DNA的完全分离及引物的结合。适当增加PCR延伸时间确保目的片段的全长扩增。
PCR出现非特异性扩增带的原因分析:PCR扩增后出现的条带与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现特异性扩增带与非特异性扩增带。非特异性条带的出现,其原因:一是引物与靶序列不完全互补、或引物聚合形成二聚体。二是Mg2+离子浓度过高、退火温度过低,及PCR循环次数过多有关。其次,是酶的质和量,往往一些来源的酶易出现非特异条带而另一来源的酶则不出现,酶的量过多有时也会出现非特异性扩增。其对策有:①必要时,重新设计引物。②减低酶的量或调换另一来源的酶。③降低引物量,适当增加模板量,减少循环次数。④适当提高退火温度或采用二温度点法(93℃变性,65℃左右退火与延伸,也叫两步法)。pcr仪的使用说明是什么?
PCR反应的比较大特点是具有较大扩增能力与极高的灵敏性,但令人头疼的问题是易污染,极其微量的污染即可造成假阳性的产生。主要原因有:1、标本间交叉污染;2、PCR试剂的污染;3、PCR扩增产物污染;4、实验室中克隆质粒的污染。一个好的实验室,要时刻注意污染的监测,考虑有无污染是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染。1、阳性对照:在建立PCR反应实验室及一般的检验单位都应设有PCR阳性对照,它是PCR反应是否成功、产物条带位置及大小是否合乎理论要求的一个重要的参考标志。2、阴性对照:每次PCR实验务必做阴性对照。它包括:(1)标本对照:被检的标本是血清就用鉴定后的正常血清作对照;被检的标本是组织细胞就用相应的组织细胞作对照。(2)试剂对照:在PCR试剂中不加模板DNA或RNA,进行PCR扩增,以监测试剂是否污染。3、重复性试验。4、选择不同区域的引物进行PCR扩增。pcr检测样本的保存要求与方法?山西有哪些pcr公司
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PCR反应的特异性决定因素为:①引物与模板DNA特异正确的结合;②碱基配对原则;③TaqDNA聚合酶合成反应的忠实性;④靶基因的特异性与保守性。其中引物与模板的正确结合是关键。引物与模板的结合及引物链的延伸是遵循碱基配对原则的。聚合酶合成反应的忠实性及TaqDNA聚合酶耐高温性,使反应中模板与引物的结合(复性)可以在较高的温度下进行,结合的特异性明显增加,被扩增的靶基因片段也就能保持很高的正确度。再通过选择特异性和保守性高的靶基因区,其特异性程度就更高。黑龙江高质量pcr多少钱
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