(human papillomavirus)染上以及酗酒、吸烟等因素都有可能导致舌鳞状细胞cancer(tongue squamous cell carcinoma, TSCC)的发生,恶性舌cancer的增长会严重影响到病人的吞咽、呼吸、语言等正常生理功能,严重影响病人的生活质量。南通大学吴昊团队应用全转录组测序技术对TSCC病人的舌ai组织进行环状RNA研究,这一工作为舌ai发病机制和医治研究提供更多理论依据和研究基础,对332个差异表达环状RNA富集分析结果表明,这些环状分子可能参与cancer相关信号通路的调控。环状RNA在未来可能成为一种新型的生物标志物。吉林RIP环状dna
中国医学科学院放射医学研究所刘强团队利用云序生物提供的全转录组测序服务成功揭示了circRNAs在小鼠空肠辐射后表达的变化,为研究circRNAs在辐射致肠损伤中的作用提供了靶分子。高质量的测序技术对每一个环状的表达都做到准确检测,生信分析可视化从宏观角度(染色体分布、成环位置)给出了所有对于放射处理后在小鼠空肠组织当中环状RNA分子的表达情况。筛选差异表达的环状RNA进行环状RNA定量PCR验证,GO分析揭示包括结合、催化、细胞因子和细胞分泌等GO条目均发生富集。KEGG分析预测结果显示差异环状RNA的靶基因与MAPK信号通路相关,理论与预测完全相符。海绵机制预测ceRNA网络图,按照海绵机制的反式调控方式,该网络中包括42个上调和48个下调的环状RNA分子,以及预测相互结合的22个靶基因mRNA。北京环状研究与mRNA相比,m6A甲基化修饰在环状RNA上更普遍。
1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣? 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速轰动了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项youxiu青年基金,两项重点项目,94项面上项目,62项青年基金项目,15项地区科学基金项目。比如中医学和药理学方向,相信未来其他类型的tumour和学科方向必定会争取更多的环状RNA课题资助。与此同时,生命科学方向环状RNA研究显得略微低调些,
河南农业大学的研究团队利用云序生物提供的环状RNA测序服务,在小麦幼苗叶片中鉴定出大约88个环状RNA分子,而在脱水胁迫幼苗中有62个环状RNA分子存在差异表达。在脱水反应的环状RNA分子中,有6个在小麦中作为26个相应的miRNA的海绵。利用qPCR验证16个环状RNA,包括6个miRNA海绵和10个随机选择的环状RNA, 其中14个环状RNA与测序结果趋势一致,反应测序数据的真实性可靠性。GO分析和KEGG分析揭示circRNAs潜在的生物学功能,例如所涉及的参与脱水反应过程,如光合作用,叶绿素代谢,氧化磷酸化,氨基酸生物合成、代谢以及植物激su信号转导和生长素生物合成等。并且揭示了环状RNA与小麦叶片脱水抗性相关功能基因表达之间关系。同一基因位置可以产生不同类型的环状RNA。
3.生物信息学分析,AZ处理相关环状RNA的功能预测 2013年两篇Nature文章揭示环状RNA具有miRNA海绵的功能,它可以吸附miRNA来调节相关基因的表达。此后,环状RNA的ceRNA功能机制正被人们广fan研究。研究人员通过生物信息学预测,发现282条AZ相关差异表达的环状RNA含有miRNA的结合位点,每个环状RNA的结合位点数从1到21不等。基于这些数据,研究人员根据它们的结合能力选出了5个miRNA。 然后他们随机选择了5个差异下调的环状RNA,并使用前5个预测的miRNA构建了circRNA-miRNA网络。可以看出每个环状RNA有多个miRNA结合位点,且一些环状RNA与同一miRNA的结合位点是相同的,暗示着环状RNA彼此之间的竞争性与miRNA结合。以上结果表明非洲爪蟾体内环状RNA可能存在的miRNA的海绵功能。2006年在果蝇中发现来自于Muscleblind的未知环状转录本。宁夏m6a环状
circRNA 早于20世纪70年代在RNA病毒中被发现。吉林RIP环状dna
环状RNA作为一种新发现的非编码RNA,在多种组织及疾病中发挥重要的生物学功能,然而关于其在红斑狼疮性肾炎中的研究鲜有报道。红斑狼疮性肾炎作为一种免疫缺陷性疾病,严重影响了患者的身体健康和生活质量。云序携手中国医科大学周华主任团队在Cell子刊“Molecular Therapy Nucleic Acids”上发表重要研究成果,通过全转录组测序构建了该疾病的环状RNA表达谱,并从313条差异表达结果中挑选感兴趣的环状RNA--CircHLA-C。前期,作者发现miR-150在该疾病中发挥着重要的调控作用,通过生信预测结果显示该环状能够通过竞争性吸附miR-150。吉林RIP环状dna
上海云序生物科技有限公司发展规模团队不断壮大,现有一支专业技术团队,各种专业设备齐全。专业的团队大多数员工都有多年工作经验,熟悉行业专业知识技能,致力于发展高通量测序,测序合成,科研,技术服务的品牌。公司不仅*提供专业的上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。,同时还建立了完善的售后服务体系,为客户提供良好的产品和服务。上海云序生物科技有限公司主营业务涵盖RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体,坚持“质量保证、良好服务、顾客满意”的质量方针,赢得广大客户的支持和信赖。