湖北m7G环状平台

为了更全检测小麦中所有环状RNA的表达情况，研究人员分别对PEG和水处理后的小麦幼苗叶子进行环状RNA测序，共发现了88条环状RNA。通过对环状RNA的基因组来源进行分析，发现环状RNA可分为5类，其中基因间（intragenic）产生的环状RNA占大多数。接下来，研究人员系统分析了不同样本之间环状RNA的表达情况，发现62条环状RNA差异表达，这暗示着这些环状RNA可能在脱水应激中发挥作用。为了验证测序结果的准确性，研究人员挑选了16条环状RNA，利用“divergent primers”进行环状RNA定量PCR检测。环状RNA可以抵抗核酸外切酶的降解作用。湖北m7G环状平台

云序环状RNA课题技术服务四大模块: 一、 环状RNA筛选： 1.1 circRNA测序 1.2全转录组测序（同时检测circRNA、lncRNA、mRNA） 二、环状RNA验证 2.1 qRT-PCR 对选定目标RNA分子可进行qPCR检测服务，包括引物设计与表达鉴定。 2.2 Sanger测序与RNase R酶耐受实验 对选定的环状RNA分子进行反式剪切位点引物设计，扩增后Sanger测序验证环状；使用RNase R酶处理环状RNA分子，验证环状RNA分子稳定性。 三、 CircRNA功能机制研究 3.1 RIP测序/qPCR 针对目标蛋白抗体把蛋白-RNA复合物沉淀下来，并对复合物上的RNA进行测序或对目标RNA进行qRCR表达分析。 湖北m7G环状平台circRNA的类型比想象的要复杂，可以来自基因组上多种基因结构。

胶质瘤作为较常见的颅内恶性tumour占颅脑tumour的40%~50%，电磁辐射等其他环境致cancer因素会导致胶质瘤的发生，尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤医治手段，但是多形性胶质母细胞瘤（GBM）的强侵袭、增殖能力仍给病人的医治造成很大的困难。上海第二军医大学附属长征医院研究者通过环状RNA测序，从环状RNA角度对胶质瘤的发生和发展进行了研究， 共发现206个上调环状和1205个下调环状，其中扩大样本量qPCR验证（13例正常、68例疾病）后将目标锁定在circBRAF。该环状转录自BRAF基因，虽然在正常人样本当中BRAF基因编码的环状cricBRAF分子mRNA分子水平无明显差异，但是在疾病样本当中circBRAF有明显上调，KM曲线结合临床资料表明该环状的高表达能一定程度上预示着疾病的恶性程度和预后情况。

ac4C RNA乙酰化是在RNA ac4C修饰酶的作用下，使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰（N4-acetylcytidine）。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上，导致Watson-Crick碱基热稳定性增加，调控蛋白合成中的编码准确性；近期研究发现ac4C分布在人类转录组中，大多数位点出现在编码序列（CDS）内，并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前，ac4C RNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰，是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”！环状RNA pull down体外转录法标记生物素RNA探针，然后与胞浆蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白质复合物。

近期，云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组包含了外泌体和环状RNA两大科研热点，应用云序生物提供的全转录组测序服务，通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》（影响因子5.19）上发表了世界first小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA研究的一篇文章。 研究背景： 大脑创伤（TBI）具有极高的发病率和致死率，会不同程度地危害身体健康，目前对其致病机理，尤其是对神经系统造成伤害的分子机理尚不知晓。circRNA主要由外显子构成，少部分由内含子环化形成。辽宁环状环状RNA测序

m7G RNA甲基化是在甲基化转移酶的作用下，使RNA鸟嘌呤（G）的第七位N上加上甲基的一种修饰。湖北m7G环状平台

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