2020年6月18日云序用户山大二院在Frontiers in Oncology (IF=4.85)上发表了一篇题目RNA-Seq Profiling of Serum Exosomal Circular RNAs Reveals Circ-PNN as a Potential Biomarker for Human Colorectal Cancer的文章,该文章通过运用了云序生物外泌体全转录组测序探究了环状RNA作为结肠ai分子标志物的可能性。 结肠ai(CRC)是第三大常见恶性tumour,早期CRC患者存活率远高于晚期患者,tumour的早期诊断对改善预后至关重要。近年来有许多研究发现,外泌体作为普遍存在于体液中的一种微囊泡,含有大量DNA、RNA和蛋白等分子,可以反应他们来源细胞的信息。许多ai细胞来源的外泌体内的分子具有成为cancer分子标志物的潜力。这其中,环状RNA由于其稳定性高,被作为多种cancer的分子标志物研究过。在这篇文章中,作者通过对50个患者和50和健康人血清中外泌体环状RNA的研究,提出了其中circ-PNN作为CRC诊断分子标志物的可能。circRNA主要由外显子构成,少部分由内含子环化形成。安徽m1A环状RNA pull down
云序生物—环状RNA研究优势 云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的测序公司,自行建立的环状RNA数据库circDB,借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点为客户提供好的服务。云序积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病。云序生物提供系统性环状RNA服务,从筛选(circRNA测序)到验证(qPCR)再到机制研究(RIP、RNA pull-down、ChIP、双荧光素酶实验)以及上游表观调控(m6A甲基化等各类RNA修饰研究),为您更全的覆盖环状RNA上下游分子机制验证的重要研究环节。除了提供组织和细胞的样本类型测序之外,我们还提供体液、血清血浆、外泌体石蜡样本等特殊样本的测序服务。回首过去,从国内发出circRNA测序到全转录组测序概念提出,到m6A等RNA甲基化测序平台出现,再到如今的eccDNA测序服务,我们一直在紧跟国际科研热点方向进行测序技术的创新。江西m7G环状RNA pull down环状RNA可直接与蛋白质结合。
云序环状RNA课题技术服务四大模块: 一、 环状RNA筛选: 1.1 circRNA测序 1.2全转录组测序(同时检测circRNA、lncRNA、mRNA) 二、环状RNA验证 2.1 qRT-PCR 对选定目标RNA分子可进行qPCR检测服务,包括引物设计与表达鉴定。 2.2 Sanger测序与RNase R酶耐受实验 对选定的环状RNA分子进行反式剪切位点引物设计,扩增后Sanger测序验证环状;使用RNase R酶处理环状RNA分子,验证环状RNA分子稳定性。 三、 CircRNA功能机制研究 3.1 RIP测序/qPCR 针对目标蛋白抗体把蛋白-RNA复合物沉淀下来,并对复合物上的RNA进行测序或对目标RNA进行qRCR表达分析。
云序专注于环状RNA研究,前期环状RNA筛选,云序提供全转录组及环状RNA测序相关服务;环状RNA验证,云序提供qPCR,RNaseR及Sanger测序等服务;文中环状RNA机制研究金钥匙——环状RNA Pull Down及RIP 环状RNA测序,云序均可提供全套服务!新年伊始,云序客户更是在环状RNA领域接连发表高分文章,包括世界首篇小鼠大脑创伤外泌体环状RNA文章;世界首篇非洲爪蟾环状RNA文章以及世界首篇红斑狼疮性肾炎环状RNA文章等等。云序致力于帮助客户在环状RNA研究领域占得先机,拔得头筹!m6A RNA-seq的富集效率是决定数据质量的关键。
样本要求 样品类型: 组织、细胞、体液或总RNA样品。其它类型样品请咨询工作人员。 样品量: a)细胞:2×106 b)组织:50 mg c)体液:全血、血清、血浆 2-3 ml 脑脊液:5 ml 尿液:50 ml d)总RNA:2 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5 无明显降解,电泳检测样品特征性条带完整清晰,无明显弥散或拖尾 ) 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;血液样品应使用EDTA抗凝,不可用肝素;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。环状 RNA 呈封闭环状结构,在生物体中稳定存在。河南m5c环状测序
环状RNA pull down体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。安徽m1A环状RNA pull down
云序优势 适用于任何物种: 可以检测几乎所有动植物的环状RNA。 适用于降解样品: 可以检测部分降解的样品的环状RNA。 有效数据量高: 通过商业化kit富集环状RNA,极大地提高了有效数据比例。 性价比高:能够用较低的成本检测更多的环状RNA。 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织、体液或总RNA,云序生物为您完成从样品准备、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。 专业化的生物信息学分析: 云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析要求。安徽m1A环状RNA pull down
上海云序生物科技有限公司位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2。公司业务涵盖RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等,价格合理,品质有保证。公司将不断增强企业重点竞争力,努力学习行业知识,遵守行业规范,植根于商务服务行业的发展。云序生物秉承“客户为尊、服务为荣、创意为先、技术为实”的经营理念,全力打造公司的重点竞争力。