近十几年来，随着转基因技术的发展和应用，转基因斑马鱼也逐渐应用于水质监测，其对污染物的作用反应快，可在短时间内调查水污染状况或用于特定污染物的检测。将目标质粒注射到斑马鱼体内，斑马鱼经过筛选得到稳定的转基因品系，通过观察荧光蛋白可以用来快速检测不同的环境污染物：
银纳米粒子因其***作用而广泛应用于洗涤剂和废物处理领域，为了研究银纳米粒子对环境和健康的影响，来自新加坡国立大学化学系的研究者用斑马鱼作用模式生物评价了银纳米粒子对斑马鱼的毒性，结果显示银纳米粒子可造成斑马鱼胚胎死亡、体轴异常、脊索扭曲、血流减慢、心包水肿、心律不齐等：与常规物理和化学检测手段相比，应用斑马鱼进行环境监测和化学品研究能实现快速、高效、灵敏、成本低等优点。 斑马鱼实验周期短，大部分实验能够在一周内完成。福建斑马鱼实验中心长沙
斑马鱼在环境检测与化学品风险评估中的应用
斑马鱼早在1930年左右就已经在欧洲用于环境监测。目前OECD和ISO颁布的使用斑马鱼进行环境毒性测试的相关标准已经有10项。
ISO-15088-2008
Determinationoftheacutetoxicityofwastewatertozebrafisheggs
OECD化学品鱼类（斑马鱼）毒性测试标准：
OECD203（1992）Fishacutetoxicitytest
OECD204（1984）Fishprolongedtoxicitytest:14-daystudy
OECD210（1992）Fishearlylife-stagetoxicitytest
OECD305（1996）Bioconcentra-tion:Flowthroughfishtest
OECD212（1998）Fishshort-termtoxicitytestonembryoandsac-frystages
OECD215（2000）Fishjuvenilegrowthtest
OECD229（2009）Fishshort-termreproducti-onassay
OECD230（2009）21-Dayfishscreeningassay:AShort-TermScreeningforOestrogenicandAndrogenicActivity,andAromataseInhibition
OECD236（2013）FishEmbryoToxicity(FET)Test安徽斑马鱼实验中心长沙化学品斑马鱼胚胎和卵黄囊仔鱼阶段的短期毒性试。
斑马鱼由于养殖方便、繁殖周期短、产卵量大、胚胎体外受精、体外发育、胚体透明，已成为生命科学研究的新宠。全球范围内有超过1500个斑马鱼实验室。利用斑马鱼，可以研究生命科学的基础问题，揭示胚胎和组织***发育的分子机理；可以构建人类的各种疾病和**模型，建立药物筛选和***的研究平台；可以建立毒理学和水产育种学模型，研究和解决环境科学和农业科学的重大问题。
目前我国有250个以上的实验室利用斑马鱼开展相关科学研究。为进一步加强国内斑马鱼研究人员之间的交流，在2011年广州举办的第二届全国斑马鱼研讨会上，包括孟安明院士在内的全国斑马鱼研究学术集体商定，今后的全国性斑马鱼会议采取“PI大会”和“研究大会”的形式交替隔年举行，并决定自今年起固定在水生所召开“全国斑马鱼PI大会”。此次举行的斑马鱼PI大会也作为国家斑马鱼资源中心在水生所揭牌后所召开的一次学术庆祝大会。
在国际上，斑马鱼模式生物的使用正逐渐拓展和深入到生命体的多种系统（例如，神经系统、免疫系统、心血管系统、生殖系统等）的发育、功能和疾病（例如，神经退行性疾病、遗传性心血管疾病、糖尿病等）的研究中，并已应用于小分子化合物的大规模新药筛选。我国开展斑马鱼相关的研究无论在规模还是在重视程度上都远远落后于国际形势发展的需要。推动和发展斑马鱼模式生物在我国生命科学研究中的***使用是本中心的宗旨。在国家科技部重大科学研究计划的支持下，我们汇集优势，整合我国现有的斑马鱼主要研究力量，在未来几年内逐步建立全国共享的斑马鱼模式动物研究技术和资源库，向国内同行提供斑马鱼资源、信息和技术支撑。本着提高服务效率和质量为原则，我们在上海和北京分别建立国家斑马鱼模式动物南方中心和北方中心。南方中心依托于中国科学院上海生命科学研究院，北方中心依托于北京大学和清华大学。两个中心本着优势互补的原则，共同开发研究技术和资源，以辐射状向国内研究人员提供服务，积极推进我国斑马鱼相关科学研究。斑马鱼在工业实验室中常被用作毒理学检验。
斑马鱼基因突变技术服务：包括插入诱变和ENU化学诱变技术。
斑马鱼转基因资源库和突变体资源库服务：包括研制、收集和分发各种斑马鱼转基因品系和突变体
信息服务：包括建立斑马鱼资源信息网络数据库和提供斑马鱼基因组生物信息学分析服务。
转基因斑马鱼的制备主要采用两种方法：通过Tol2转座子构建组织特异性表达报告基因的方法；利用特定基因的启动子/增强子驱动报告基因在特定细胞组织中表达的方法。
首先构建以Tol2转座子为基础的enhancertrap载体，
在放大的照片中可看到耳蜗内的毛细胞
在放大的照片中可看到耳蜗内的毛细胞 斑马鱼心血管毒性评价模型。福建斑马鱼实验中心长沙
斑马鱼为模式生物的研究进入到一个新的阶段。福建斑马鱼实验中心长沙
斑马鱼血管生成基因如血管内皮细胞生长因子（VEGF）、an-iopoietins、ephrions及相应受体与哺乳动物功能相似，而且斑马鱼血管系统及其对调节血管新生类药物的***反应与哺乳动物类似。另外斑马鱼胚胎在血液循环系统严重缺陷的情况下仍能存活，且胚胎透明，利用血管转基因荧光斑马鱼可以在24小时以内就定量评价药物的血管形成***作用。
与传统的鸡胚尿囊膜、小鼠角膜实验相比，斑马鱼更加便捷、快速、高效，而且结果定量分析的准确度更高。
目前多个出于临床试验阶段的抗血管生成靶向候选***药如SU5416、SU6668、TNP470、SU4312和AG1478等均对斑马鱼的血管形成有***的***效果。用斑马鱼筛选发现具有血管形成***活性的中***体化合物也有很多，如靛玉红、呋喃二烯等。 福建斑马鱼实验中心长沙
