Genovis的PNGase F 是一种糖酰胺酶，可水解多肽天冬酰胺与所有哺乳动物天冬酰胺连接复合物、杂交体或高甘露糖寡糖的内层 GlcNAc 之间的酰胺键。 在反应过程中，从中去除聚糖的天冬酰胺残基被脱酰胺为天冬氨酸。释放的低聚糖完好无损，可用于进一步分析。N-糖的去除被用于MS分析的样品制备，以降低蛋白质的异质性，使游离的糖分析成为可能，并研究N-糖的功能作用。 该酶在大肠杆菌中表达，该重组基因来源于伊丽莎白金氏脑膜败血症。 评价抗体片段对完整蛋白聚集的影响。 IgG1 mAb1和mAb2在Biogen生产。 mAb1被糖基化，主要的糖型是具有0和1半乳糖的he心聚焦双触角聚糖(FA2和FA2G1); mAb2被糖基化。依那西普是一种 Fc 融合蛋白，具有高度 O-糖基化的铰链区域。山东PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究
Genovis的SialEXO固定化用于复杂糖蛋白的去唾液酸化：在设置反应条件时，需要在所需的反应时间和完成反应所需的酶量之间进行权衡。较高的酶量可保证在更短的时间内完成周转，但会使下游分析复杂化。为了避免此类问题，我们以离心柱形式固定了活性SialEXO。这允许以更短的孵育时间孵育具有明显更高量的唾液酸酶的糖蛋白底物。Genovis测试了 SialEXO 冻干和 SialEXO 固定化在人 C1 抑制剂上的性能。这种糖蛋白是一种具有挑战性的底物，具有 6 个 N- 和多达 26 个 O-聚糖，由 α2,3 和 α2,6 连接的唾液酸修饰。对游离的N-聚糖的分析表明，SialEXO在溶液中完全脱唾液酸化，SialEXO固定化。北京PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究依那西普和曲妥珠单抗游离聚糖。
蛋白质的N-糖基化特征是一个关键的质量属性。它会影响生物制药的安全性和有效性，因此需要在开发和生产过程中进行表征和监测。常见的聚糖分析工作流程是用PNGase F释放N-聚糖，然后用荧光标记物（如2-AB、2-AA、普鲁卡因胺或RapiFluor-MS™（沃特世公司））标记生成的聚糖。然后使用HILIC-HPLC或毛细管电泳分离标记的聚糖，以表征和定量不同的聚糖结构。 在这里，使用游离聚糖方法分析zhiliao性抗体曲妥珠单抗、Fc-融合蛋白依那西普和糖蛋白RNase B的N-聚糖。曲妥珠单抗和依那西普在天然条件下在37°C下用Genvois的PNGase F去糖基化1小时，而RNase B需要变性和还原才能完全去糖基化。因此，在50°C下用PNGase F去糖基化10分钟之前，用RapiGest™ SF表面活性剂（沃特世公司）和TCEP处理RNase B。 用RapiFluor-MS标记所得游离的聚糖，并通过HILIC UPLC-FLD-MS进行分析。
Genovis的ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖：依那西普是一种融合蛋白，由TNF受体的胞外结构域与人IgG1的Fc部分相连。该蛋白质在Fc区域上方含有多达13个O-糖基化的Ser/Thr残基簇，使其成为一种非常难以在结构上表征的生物制药。为了证明ImpaRATOR的聚糖特异性，制备了三种具有不同聚糖组成的依那西普样品：（i）携带单唾液酸和二唾液酸化he心1结构混合物的未经处理的糖蛋白，（ii）用SialEXO处理的糖蛋白去除唾液酸并产生裸核1结构，以及（iii）用SialEXO和GalactEXO处理的糖蛋白产生单个GalNAc残基， 也称为Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一锅反应中处理三个样品（图1）。作为比较，SialEXO处理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR处理。将所得肽还原、烷基化并用HILIC-MS进行分析。FabRICATOR被包括在反应中，以将Fc区与大多数C端糖肽分离，以促进其表征。从而实现 O-糖谱分析、位点占用测定和 O-糖肽图谱以及使用 LC-MS 分析的中级方法。
Fc N-聚糖在抗体的效应功能中起着至关重要的作用，但可能会增加蛋白质表征测定的复杂性。在天然条件下用PNGase F去除Fc N-糖可以表征游离N-糖以及去糖基化抗体的功能和结构。 为了证明PNGase F固定化和PNGase F冻干在天然反应条件下有效去除Fc N-聚糖，对zhiliao性抗体曲妥珠单抗进行了处理。图2中的质量数偏移表明，在37°C下用Genovis的PNGase F冻干或PNGase F固定化孵育1小时后，曲妥珠单抗上的Fc N-聚糖成功去除，与在溶液中用PNGase F冻干处理的样品相比，没有酶干扰用PNGase F固定处理的样品的分析。使用FabRICATOR®将曲妥珠单抗消化成亚基，并使用LC-MS进行分析。北京PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究
将依那西普与GalactEXO固定化孵育60分钟。山东PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究
Genovis的SialEXO产品是用于去除和分析唾液酸的唾液酸酶。这些酶对天然糖蛋白或游离的聚糖结构上存在的 N- 和 O-连接聚糖均具有活性。SialEXO用于在用OpeRATOR或OglyZOR消化之前预处理O-糖基化蛋白。其他应用包括降低样品复杂性、电荷异构体分析和外切糖苷酶阵列。N-连接、O-连接和游离聚糖的高效去唾液酸化快速去除唾液酸，增强对蛋白质电荷变体的分析可固定在即用型离心柱中。然后可以用FabRICATOR消化所得的去糖基化蛋白，并通过中级质谱分析。我们将该工作流程应用于依那西普的分析，虽然未经处理的TNFR结构域过于复杂而无法分析，但O-聚糖组成可以在用PNGase F处理后进行分离和比较。山东PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究
OglyZOR 来源于口腔链球菌，在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签，分子量为 227 kDa...
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