CoIP-Mass应用场景：CoIP-Mass：用于构建目的蛋白的蛋白互作组数据，或用于不同遗传背景/实验条件下的互作组差异。CoIP-WB：用于验证目的蛋白和候选蛋白的相互作用关系，或用于不同遗传背景/实验条件下的互作变化。
CoIP-Mass和CoIP-WB技术价值：（1）蛋白质相互作用数据是机制研究的重要基础内容，体现机制研究的严谨性，能明显提高临床基础类研究文章的档次。（2）细胞内蛋白互作处于动态变化过程，在不同条件下可发生动态变化，蛋白动态互作组检测，是蛋白互作机制的亮点。（3）蛋白互作，往往是结构域或部分关键区段的互作，可通过蛋白区段拆分，进一步明确互作的结构域，提升机制研究的高度，为靶点转化提供关键切入点。 免疫共沉淀法证实蛋白互作，基于抗体专一性，揭示生理性相互作用。免疫共沉淀检测CoIP-WB
Co-IP技术虽然广泛应用于蛋白质相互作用的研究，但也存在一些局限性。首先，Co-IP技术的结果可能受到抗体特异性的影响。如果抗体与目标蛋白的结合不够特异，可能导致非特异性蛋白的共沉淀，增加背景噪声。其次，Co-IP技术可能无法检测到低丰度的蛋白质相互作用，因为低丰度蛋白在细胞裂解液中的浓度较低，难以形成稳定的复合物。此外，Co-IP技术还受到样品制备和实验条件的影响。样品中的杂质、降解产物或酶活性等因素都可能干扰实验结果。另外，Co-IP技术只能检测到在细胞裂解时存在的蛋白质相互作用，对于瞬时或动态的相互作用可能无法准确捕捉。因此，在使用Co-IP技术时，需要注意这些局限性，并结合其他实验方法和验证手段，以获得更准确的蛋白质相互作用结果。陕西互作机制CoIP Mass检测IP-WB实验常用于验证蛋白质之间的相互作用。
CoIP实验细胞的收集及裂解方法：
收集2E7个细胞样品，加入PBS洗涤细胞，离心后弃上清收集细胞沉淀。
准备500μl预冷的CellLysisBuffer,分别加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF，混匀后加进细胞沉淀中吹打均匀，冰上孵育30min，期间涡旋混匀几次。
4℃,12000rpm离心10min，取上清，进行蛋白浓度测定及后续实验。
CoIP实验免疫复合物的制备：
在离心管中，将每个样品的细胞裂解液与2-10μg免疫沉淀抗体结合。每个免疫沉淀反应推荐的总蛋白量为500-1000μg，由PierceBCAProteinAssay蛋白浓度检测试剂盒测定。
用免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液将抗体/裂解液稀释至500μL。
在室温下孵育1-2h，或4℃过夜，以形成免疫复合物。
CoIP-Mass和CoIP-WB优劣势：优势：高通量获得目的蛋白的专属蛋白互作库。劣势：CoIP的蛋白库鱼龙混杂，包含目的蛋白的直接/间接互作蛋白，非特异结合，残留蛋白。常规理想IP-Mass项目可鉴定到1000-2000个蛋白，其中绝大部分是非特异性结合及清洗残留的背景蛋白，导致CoIP-Mass假阳性高，CoIP-WB验证成功率低，导致研发进展反复跌宕，时间和经费成本占用较大，严重影响士气。其次，项目受限于蛋白表达量和IP抗体有效性，达到理想状态的CoIP-Mass较难，同时分析门槛较高。因此，该项目成功实施，比较依赖成熟和有分析经验的团队。建议整包交给专业的服务商开展检测。Co-IP技术利用抗原抗体结合，研究蛋白质互作，揭示其功能机制的有力工具！
IP-Mass（免疫沉淀-质谱）实验流程主要包括以下步骤：样品制备：收集细胞或组织样品，并进行适当的裂解处理，以释放细胞内的蛋白质。免疫沉淀：将特异性抗体与目标蛋白结合，形成抗原-抗体复合物。随后，将复合物与固相载体（如磁珠）结合，通过洗涤步骤去除非特异性结合的杂质。洗脱：从固相载体上洗脱免疫沉淀得到的蛋白质复合物，以便进行后续的质谱分析。蛋白酶消化：将洗脱下来的蛋白质复合物进行蛋白酶消化，将其分解成小分子的肽段。质谱分析：将消化后的肽段进行质谱分析，通过测量肽段的质量和电荷信息，鉴定出蛋白质的种类和序列。数据分析：对质谱数据进行处理和分析，确定与目标蛋白相互作用的蛋白质，以及相互作用的可能性和强度。IP-Mass实验流程结合了免疫沉淀的高特异性与质谱分析的高灵敏度，能够准确地鉴定蛋白质相互作用，并为后续的功能研究和药物开发提供有力支持。Co-IP技术广泛应用于生物医学、药物研发、蛋白质组学等领域，助力科研人员探索生命奥秘！广西CoIP-WB
IP-WB实验流程：样品制备、免疫沉淀、电泳分离、转膜、WB检测，验证蛋白互作的关键步骤！免疫共沉淀检测CoIP-WB
免疫共沉淀也存在一些局限性。例如，它可能无法检测到低亲和力和瞬间的蛋白质-蛋白质相互作用。此外，两种蛋白质的结合可能不是直接结合，而可能有第三者在中间起桥梁作用。此外，实验前需要预测目的蛋白以选择相应的抗体，因此，如果预测不正确，实验可能无法得到结果，这使得这种方法具有一定的冒险性。总的来说，免疫共沉淀是一种强大的技术，它能够为我们提供关于蛋白质相互作用的宝贵信息。然而，为了得到准确和可靠的结果，我们需要谨慎地解释和分析实验数据，并考虑到这种方法的局限性。免疫共沉淀检测CoIP-WB
